(R)-3-(2-fluorobenzyl)morpholine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: (R)-3-(2-fluorobenzyl)morpholine
• 英文别名: (3R)-3-[(2-fluorophenyl)methyl]morpholine
• 化学式: C₁₁H₁₄FNO
• 分子量: 195.237
• InChiKey: DJPXCTBQLNMYAX-SNVBAGLBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.5
• 重原子数：
  14
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  21.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(4-methylpyridin-2-yl)-1H-pyrazole-3-carboxylic acid 、 (R)-3-(2-fluorobenzyl)morpholine 在 O-(benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium tetrafluoroborate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.0h， 以22.2%的产率得到(R)-(3-(2-fluorobenzyl)morpholino)(3-(4-methylpyridin-2-yl)-1H-pyrazol-5-yl)methanone
  参考文献：
  名称：

  抑制脂多糖生物合成必需的 LpxA 酰基转移酶的两种不同机制

  摘要：

  脂多糖生物合成途径被认为是对抗多重耐药革兰氏阴性菌日益严重的威胁的有吸引力的药物靶点。在这里，我们报告了脂多糖生物合成途径中的第一种酶酰基转移酶 LpxA 的两种新型小分子抑制剂（化合物 1 和 2）。我们从遗传学上表明，这些化合物对外排缺陷型大肠杆菌的抗菌活性是由 LpxA 抑制介导的。一致地，这些化合物在体外抑制了 LpxA 酶促反应。有趣的是，利用生化、生物物理和结构表征，我们揭示了 LpxA 抑制的两种不同机制；化合物 1 是靶向 apo LpxA 的底物竞争性抑制剂，化合物 2 是靶向 LpxA/产物复合物的非竞争性抑制剂。化合物 2 表现出比化合物 1 更有利的生物学和理化性质，并使用结构信息进行优化，以实现对野生型大肠杆菌的更高抗菌活性。这些结果表明 LpxA 是一个有前途的抗菌靶点，暗示了靶向酶/产物复合物在药物发现中的优势。

  DOI：

  10.1021/jacs.9b13530
• 作为产物：
  描述：

  (R)-2-chloro-N-(1-(2-fluorophenyl)-3-hydroxypropan-2-yl)acetamide 在 lithium aluminium tetrahydride 、 sodium hydride 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 16.5h， 生成 (R)-3-(2-fluorobenzyl)morpholine
  参考文献：
  名称：

  抑制脂多糖生物合成必需的 LpxA 酰基转移酶的两种不同机制

  摘要：

  脂多糖生物合成途径被认为是对抗多重耐药革兰氏阴性菌日益严重的威胁的有吸引力的药物靶点。在这里，我们报告了脂多糖生物合成途径中的第一种酶酰基转移酶 LpxA 的两种新型小分子抑制剂（化合物 1 和 2）。我们从遗传学上表明，这些化合物对外排缺陷型大肠杆菌的抗菌活性是由 LpxA 抑制介导的。一致地，这些化合物在体外抑制了 LpxA 酶促反应。有趣的是，利用生化、生物物理和结构表征，我们揭示了 LpxA 抑制的两种不同机制；化合物 1 是靶向 apo LpxA 的底物竞争性抑制剂，化合物 2 是靶向 LpxA/产物复合物的非竞争性抑制剂。化合物 2 表现出比化合物 1 更有利的生物学和理化性质，并使用结构信息进行优化，以实现对野生型大肠杆菌的更高抗菌活性。这些结果表明 LpxA 是一个有前途的抗菌靶点，暗示了靶向酶/产物复合物在药物发现中的优势。

  DOI：

  10.1021/jacs.9b13530

文献信息

• Two Distinct Mechanisms of Inhibition of LpxA Acyltransferase Essential for Lipopolysaccharide Biosynthesis
  作者：Wooseok Han、Xiaolei Ma、Carl J. Balibar、Christopher M. Baxter Rath、Bret Benton、Alun Bermingham、Fergal Casey、Barbara Chie-Leon、Min-Kyu Cho、Andreas O. Frank、Alexandra Frommlet、Chi-Min Ho、Patrick S. Lee、Min Li、Andreas Lingel、Sylvia Ma、Hanne Merritt、Elizabeth Ornelas、Gianfranco De Pascale、Ramadevi Prathapam、Katherine R. Prosen、Dita Rasper、Alexey Ruzin、William S. Sawyer、Jacob Shaul、Xiaoyu Shen、Steven Shia、Micah Steffek、Sharadha Subramanian、Jason Vo、Feng Wang、Charles Wartchow、Tsuyoshi Uehara

  DOI：10.1021/jacs.9b13530

  日期：2020.3.4

  mechanisms of LpxA inhibition; compound 1 is a substrate-competitive inhibitor targeting apo LpxA, and compound 2 is an uncompetitive inhibitor targeting the LpxA/product complex. Compound 2 exhibited more favorable biological and physicochemical properties than compound 1 and was optimized using structural information to achieve improved antibacterial activity against wild-type E. coli. These results show

  脂多糖生物合成途径被认为是对抗多重耐药革兰氏阴性菌日益严重的威胁的有吸引力的药物靶点。在这里，我们报告了脂多糖生物合成途径中的第一种酶酰基转移酶 LpxA 的两种新型小分子抑制剂（化合物 1 和 2）。我们从遗传学上表明，这些化合物对外排缺陷型大肠杆菌的抗菌活性是由 LpxA 抑制介导的。一致地，这些化合物在体外抑制了 LpxA 酶促反应。有趣的是，利用生化、生物物理和结构表征，我们揭示了 LpxA 抑制的两种不同机制；化合物 1 是靶向 apo LpxA 的底物竞争性抑制剂，化合物 2 是靶向 LpxA/产物复合物的非竞争性抑制剂。化合物 2 表现出比化合物 1 更有利的生物学和理化性质，并使用结构信息进行优化，以实现对野生型大肠杆菌的更高抗菌活性。这些结果表明 LpxA 是一个有前途的抗菌靶点，暗示了靶向酶/产物复合物在药物发现中的优势。