2H-ED

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: 2H-ED
• 英文别名: 4-[3-[6-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]-1H-benzimidazol-2-yl]phenoxy]-N-[2-[4-[3-[6-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]-1H-benzimidazol-2-yl]phenoxy]butanoylamino]ethyl]butanamide
• 化学式: C₆₀H₆₄N₁₄O₄
• 分子量: 1045.26
• InChiKey: QOAPBVWKJXITQH-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.5
• 重原子数：
  78
• 可旋转键数：
  19
• 环数：
  12.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  204
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  Hoechst 33258 、 乙二胺 在 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以5%的产率得到2H-ED
  参考文献：
  名称：

  MODULARLY ASSEMBLED SMALL MOLECULES FOR THE TREATMENT OF MYOTONIC DYSTROPHY TYPE 1

  摘要：

  转录组提供了大量潜在的RNA，可以成为治疗靶点或功能化学遗传探针的目标。然而，细胞可渗透的小分子通常不利用这些靶点，因为设计高亲和力、特异性小分子靶向RNA的困难。作为一个研究使用小分子研究RNA功能的普遍计划的一部分，我们设计了能够靶向导致肌萎缩性脊柱肌肉营养不良症类型1（DM1）的非编码扩展RNA重复物质r(CUG)exp的生物活性、模块化组装的小分子。在这里，我们提出了一项严谨的研究，以阐明模块化组装化合物中提供生物活性的特征。研究了不同的模块化组装支架，包括多胺、α-肽、β-肽和肽三级酰胺（PTAs）。根据通过改善DM1相关缺陷评估的活性、对蛋白酶的稳定性、细胞渗透性和毒性，我们发现受限制的骨架，即PTAs，是最佳的。

  公开号：

  US20180089049A1

文献信息

• [EN] MODULARLY ASSEMBLED SMALL MOLECULES FOR THE TREATMENT OF MYOTONIC DYSTROPHY TYPE 1<br/>[FR] PETITES MOLÉCULES ASSEMBLÉES DE MANIÈRE MODULAIRE POUR LE TRAITEMENT DE LA DYSTROPHIE MYOTONIQUE DE TYPE 1
  申请人：SCRIPPS RESEARCH INST

  公开号：WO2015031819A1

  公开（公告）日：2015-03-05

  To study RNA function using small molecules, we designed bioactive, modularly assembled small molecules that target the noncoding expanded RNA repeat that causes myotonic dystrophy type 1 (Dml), r(CUG)exp. Different modular assembly scaffolds were investigated including polyamines, alpha-peptides, beta-peptides, and peptide tertiary amides (PT As). Based on activity as assessed by improvement of DM1 -associated defects, stability against proteases, cellular permeability, and toxicity, we discovered that constrained backbones, namely PT As, are optimal.

  为了研究使用小分子来研究RNA功能，我们设计了具有生物活性的模块化组装的小分子，以靶向导致肌无力型肌萎缩症1型（Dml）的非编码扩展RNA重复物质r(CUG)exp。我们研究了不同的模块化组装支架，包括聚胺、α-肽、β-肽和肽三级酰胺（PTAs）。根据通过改善DM1相关缺陷评估的活性、对蛋白酶的稳定性、细胞渗透性和毒性，我们发现受限的骨架，即PTAs，是最佳选择。
• US9795687B2
  申请人：——

  公开号：US9795687B2

  公开（公告）日：2017-10-24
• MODULARLY ASSEMBLED SMALL MOLECULES FOR THE TREATMENT OF MYOTONIC DYSTROPHY TYPE 1
  申请人：The Scripps Research Institute

  公开号：US20180089049A1

  公开（公告）日：2018-03-29

  Transcriptomes provide a myriad of potential RNAs that could be the targets of therapeutics or chemical genetic probes of function. Cell permeable small molecules, however, generally do not exploit these targets, owing to the difficulty in the design of high affinity, specific small molecules targeting RNA. As part of a general program to study RNA function using small molecules, we designed bioactive, modularly assembled small molecules that target the non-coding expanded RNA repeat that causes myotonic dystrophy type 1 (DM1), r(CUG) exp . Herein, we present a rigorous study to elucidate features in modularly assembled compounds that afford bioactivity. Different modular assembly scaffolds were investigated including polyamines, α-peptides, β-peptides, and peptide tertiary amides (PTAs). Based on activity as assessed by improvement of DM1-associated defects, stability against proteases, cellular permeability, and toxicity, we discovered that constrained backbones, namely PTAs, are optimal.

  转录组提供了大量潜在的RNA，可以成为治疗靶点或功能化学遗传探针的目标。然而，细胞可渗透的小分子通常不利用这些靶点，因为设计高亲和力、特异性小分子靶向RNA的困难。作为一个研究使用小分子研究RNA功能的普遍计划的一部分，我们设计了能够靶向导致肌萎缩性脊柱肌肉营养不良症类型1（DM1）的非编码扩展RNA重复物质r(CUG)exp的生物活性、模块化组装的小分子。在这里，我们提出了一项严谨的研究，以阐明模块化组装化合物中提供生物活性的特征。研究了不同的模块化组装支架，包括多胺、α-肽、β-肽和肽三级酰胺（PTAs）。根据通过改善DM1相关缺陷评估的活性、对蛋白酶的稳定性、细胞渗透性和毒性，我们发现受限制的骨架，即PTAs，是最佳的。