Dihydrofolic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Dihydrofolic acid
• 英文别名: 7,8-dihydrofolate；L-Glutamic acid, N-[4-[[(2-amino-1,4,7,8-tetrahydro-4-oxo-6-pteridinyl)methyl]amino]benzoyl]-(9CI)；(2S)-2-[[4-[(2-amino-4-oxo-4a,7-dihydro-3H-pteridin-6-yl)methylamino]benzoyl]amino]pentanedioic acid
• 化学式: C₁₉H₂₁N₇O₆
• 分子量: 443.419
• InChiKey: BWPHMODUWYICCN-NBFOIZRFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.1
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  208
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Dihydrofolic acid 在 Escherichia coli dihydrofolate reductase 、 NADPH 、 1,4-二巯基-2,3-丁二醇 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 生成 (6S)-5,6,7,8-tetrahydrofolic acid
  参考文献：
  名称：

  沿着大肠杆菌二氢叶酸还原酶的催化循环探索活性位点微环境的静电

  摘要：

  静电相互作用通过引导配体结合和促进化学反应在酶催化中发挥重要作用。这些静电相互作用受催化循环中发生的构象变化的调节。在此，通过在活性位点的两个位点特异性位置掺入硫氰酸盐探针，沿着大肠杆菌二氢叶酸还原酶 (ecDHFR) 的催化循环检查所有酶复合物的活性位点静电微环境的变化。使用光谱技术和混合量子力学/分子力学 (QM/MM) 计算研究探针周围微环境的静电和水合程度。沿催化环境的静电微环境的变化导致不同的腈 (CN) 振动拉伸频率和 13 C NMR 化学位移。这些环境变化源于催化过程中的蛋白质构象重排。QM/MM 计算再现了硫氰酸盐探针在催化氢化物转移步骤中实验测量的振动频移，该步骤跨越了酶的封闭和封闭构象。分子动力学轨迹的分析提供了对这两种状态之间发生的构象变化以及经典静电学和特定氢键相互作用产生的变化的洞察。沿着探针 CN 轴的电场被分解为来自特定残基、配体、以及构成探针周围微环境的溶剂分子。此外，沿氢化物供体

  DOI：

  10.1021/ja5038947
• 作为产物：
  描述：

  Folic acid 在 sodium hydroxide 、 锌 作用下， 反应 2.0h， 生成 Dihydrofolic acid
  参考文献：
  名称：

  Production of Dihydrofolate Reductase by ClonedEscherichia coliand Its Application to Asymmetric Synthesis ofl-Leucovorin

  摘要：

  We have investigated culture conditions for production of dihydrofolate reductase by Escherichia coli harboring a high expression plasmid, pTP64–1. Sorbitol addition and pH control were effective for the production of the enzyme in a jar fermentor. The enzyme was purified from a cell-free extract by column chromatographies on DEAE-Cellulofine and Superose Prep12 and showed a single band on SDS-polyacrylamide gel electrophoresis.The reduction of 200 mM dihydrofolate to 6(S)-tetrahydrofolate, an intermediate for l-leucovorin synthesis, was complete in 2 hr under anaerobic conditions, using 1.5 units/ml of the purified enzyme.

  DOI：

  10.1271/bbb.56.437

文献信息

• Probing the Electrostatics of Active Site Microenvironments along the Catalytic Cycle for <i>Escherichia coli</i> Dihydrofolate Reductase
  作者：C. Tony Liu、Joshua P. Layfield、Robert J. Stewart、Jarrod B. French、Philip Hanoian、John B. Asbury、Sharon Hammes-Schiffer、Stephen J. Benkovic

  DOI：10.1021/ja5038947

  日期：2014.7.23

  Electrostatic interactions play an important role in enzyme catalysis by guiding ligand binding and facilitating chemical reactions. These electrostatic interactions are modulated by conformational changes occurring over the catalytic cycle. Herein, the changes in active site electrostatic microenvironments are examined for all enzyme complexes along the catalytic cycle of Escherichia coli dihydrofolate

  静电相互作用通过引导配体结合和促进化学反应在酶催化中发挥重要作用。这些静电相互作用受催化循环中发生的构象变化的调节。在此，通过在活性位点的两个位点特异性位置掺入硫氰酸盐探针，沿着大肠杆菌二氢叶酸还原酶 (ecDHFR) 的催化循环检查所有酶复合物的活性位点静电微环境的变化。使用光谱技术和混合量子力学/分子力学 (QM/MM) 计算研究探针周围微环境的静电和水合程度。沿催化环境的静电微环境的变化导致不同的腈 (CN) 振动拉伸频率和 13 C NMR 化学位移。这些环境变化源于催化过程中的蛋白质构象重排。QM/MM 计算再现了硫氰酸盐探针在催化氢化物转移步骤中实验测量的振动频移，该步骤跨越了酶的封闭和封闭构象。分子动力学轨迹的分析提供了对这两种状态之间发生的构象变化以及经典静电学和特定氢键相互作用产生的变化的洞察。沿着探针 CN 轴的电场被分解为来自特定残基、配体、以及构成探针周围微环境的溶剂分子。此外，沿氢化物供体
• Production of Dihydrofolate Reductase by Cloned<i>Escherichia coli</i>and Its Application to Asymmetric Synthesis of<i>l</i>-Leucovorin
  作者：Takashi Ohshiro、Yukihiro Kuge、Akiko Igarashi、Kenichi Mochida、Masanori Iwakura、Takayuki Uwajima

  DOI：10.1271/bbb.56.437

  日期：1992.1

  We have investigated culture conditions for production of dihydrofolate reductase by Escherichia coli harboring a high expression plasmid, pTP64–1. Sorbitol addition and pH control were effective for the production of the enzyme in a jar fermentor. The enzyme was purified from a cell-free extract by column chromatographies on DEAE-Cellulofine and Superose Prep12 and showed a single band on SDS-polyacrylamide gel electrophoresis.The reduction of 200 mM dihydrofolate to 6(S)-tetrahydrofolate, an intermediate for l-leucovorin synthesis, was complete in 2 hr under anaerobic conditions, using 1.5 units/ml of the purified enzyme.