(S)-9-(2-phosphonomethoxypropyl)-2,6-diaminopurine | 147057-09-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: (S)-9-(2-phosphonomethoxypropyl)-2,6-diaminopurine
• 英文别名: (S)-PMPDAP；[(2S)-1-(2,6-diaminopurin-9-yl)propan-2-yl]oxymethylphosphonic acid
• CAS: 147057-09-8
• 化学式: C₉H₁₅N₆O₄P
• 分子量: 302.23
• InChiKey: LWEKFDHXJHJYGB-YFKPBYRVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.2
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  162
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-9-(2-phosphonomethoxypropyl)-2,6-diaminopurine 在 mitochondrial AMP kinase from L₁₂₁₀ cells (EC 2.7.4.3) 作用下， 生成 (S)-PMPDAPp
  参考文献：
  名称：

  Phosphorylation of Purine (Phosphonomethoxy)alkyl Derivatives by Mitochondrial AMP Kinase (AK2 Type) from L1210 Cells

  摘要：

  研究了对L1210细胞中线粒体AMP激酶（AK2型）的嘌呤（磷甲氧基）烷基衍生物的底物活性。纯化几乎纯度接近的天然AMP激酶是一种分子量为26kDa的单体。纯化的AMP激酶特异性地对天然腺嘌呤核苷酸（AMP和dAMP）作为磷酸受体，但对核苷酸5'-三磷酸作为磷酸供体具有广泛的特异性。除了腺嘌呤无环核苷酸类似物外，该酶还能磷酸化含有2,6-二氨基嘌呤基团的类似衍生物。动力学数据表明，这些无环核苷酸磷酸酯对AK2同功酶的底物活性按顺序降低为（S）-HPMPA >（R）-PMPA > PMEA > PMEDAP >（S）-PMPDAP >（R）-PMPDAP >>（S）-PMPA。无环核苷酸类似物对AK2同功酶不表现出任何抑制活性。

  DOI：

  10.1135/cccc20001653
• 作为产物：
  描述：

  9-[(S)-2-(Tetrahydro-pyran-2-yloxy)-propyl]-9H-purine-2,6-diamine 在 ammonium hydroxide 、 三甲基溴硅烷 、 硫酸 、 sodium hydride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 (S)-9-(2-phosphonomethoxypropyl)-2,6-diaminopurine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Enantiomeric N-(2-Phosphonomethoxypropyl) Derivatives of Purine and Pyrimidine Bases. I. The Stepwise Approach

  摘要：

  (R)和(S)-N-(2-磷酸甲氧基丙基)嘌呤和嘧啶碱（PMP衍生物）对逆转录病毒表现出非常高的活性。本文描述了对映异构体9-(2-磷酸甲氧基丙基)腺嘌呤（I和XXVII）、9-(2-磷酸甲氧基丙基)-2,6-二氨基嘌呤（II和XXXI）、9-(2-磷酸甲氧基丙基)鸟嘌呤（III和XXIX）和1-(R)-(2-磷酸甲氧基丙基)胞嘧啶（XIX）的合成，方法是用双(2-丙基) p-甲苯磺酰氧甲基膦酸酯（X）烷基化对应碱的N保护N-(2-羟基丙基)衍生物，然后逐步去保护中间体的N和O。关键中间体，N-(2-羟基丙基)衍生物IX和XXV，是通过将适当的杂环碱与(R)-或(S)-2-(2-四氢吡喃氧基)丙基 p-甲苯磺酸酯（VII或XXIII）烷基化，并酸水解得到的N-[2-(2-四氢吡喃氧基)丙基]衍生物VIII和XXII。手性合成物是通过对(R)-或(S)-2-(2-四氢吡喃氧基)丙醇（VI或XXI）进行对烯基化制备的，这些化合物可通过还原对映异构烷基2-O-四氢吡喃基乳酸酯V和XXI与双(2-甲氧基乙氧基)铝氢化钠反应得到。这种方法用于合成胞嘧啶、腺嘌呤和2,6-二氨基嘌呤衍生物，而从鸟嘌呤衍生物制备的化合物则是通过2-氨基-6-氯嘌呤中间体的水解制备的。胞嘧啶衍生物IXe也是通过对4-甲氧基-2-嘧啶酮的烷基化后接着中间体IXf的氨解合成的。

  DOI：

  10.1135/cccc19951196

文献信息

• Synthesis of Enantiomeric N-(2-Phosphonomethoxypropyl) Derivatives of Purine and Pyrimidine Bases. II. The Synthon Approach
  作者：Antonín Holý、Hana Dvořáková、Milena Masojídková

  DOI：10.1135/cccc19951390

  日期：——

  Another approach to (R)- and (S)-N-(2-phosphonomethoxypropyl) derivatives of purine and pyrimidine bases (PMP derivatives) I and II is described, consisting in alkylation of the heterocyclic base with (R)- and (S)-2-[bis(2-propyl)phosphonylmethoxy]propyl p-toluenesulfonates (X and XVIII) followed by transsilylation of the intermediary N-[2-bis(2-propyl)phosphonylmethoxypropyl] derivatives XI and XIX. The key intermediates X and XVIII were obtained from 1-benzyloxypropanols VI and XIV by two routes: (i) condensation with bis(2-propyl) p-toluenesulfonyloxymethylphosphonate (XIII), hydrogenolysis of the obtained 1-benzyloxy-2-bis(2-propyl)phosphonylmethoxypropanes VIII and XVI over Pd/C to 2-bis(2-propyl)phosphonylmethoxypropanols IX and XVII and tosylation of the latter or (ii) chloromethylation of compounds VI and XIV and subsequent reaction of the chloromethyl ethers VII and XV with tris(2-propyl) phosphite and further processing of the benzyl ethers VIII and XVI analogous to the enantiomeric propanols IX and XVII. This approach was used for the synthesis of derivatives of adenine (Ia, IIa), 2,6-diaminopurine (Ib, IIb) and 3-deazaadenine (Ic, IIc). Their guanine counterparts Ie and IIe were prepared by hydrolysis of 2-amino-6-chloropurine intermediates XId and XIXd. 6-Chloropurine was converted into diester XIi by reaction with tosylate X, which on reaction with thiourea and subsequent ester cleavage afforded the 6-thiopurine derivative Ij. Analogously, 2-amino-6-chloropurine derivative XId reacted with thiourea to give 9-(R)-(2-phosphonomethoxypropyl)-2-thioguanine (If), or with dimethylamine under formation of (2-phosphonomethoxypropyl)-2-amino-6-dimethylaminopurine (Ig). Hydrogenolysis of compound XId gave 9-(R)-(2-phosphonomethoxypropyl)-2-aminopurine (Ik). Hydrolytic deamination of adenine derivatives Ia and IIa led to enantiomeric (2-phosphonomethoxypropyl)hypoxanthines Ih and IIh.

  描述了另一种合成嘧啶和嘌呤碱基的(R)和(S)-N-(2-磷酸甲氧丙基)衍生物（PMP衍生物）I和II的方法，包括用(R)和(S)-2-[双(2-丙基)磷酸甲氧基]丙基p-甲苯磺酸酯(X和XVIII)烷基化杂环碱基，然后通过中间体N-[2-双(2-丙基)磷酸甲氧基丙基]衍生物XI和XIX的转硅基化来制备。关键的中间体X和XVIII是从1-苄氧基丙醇VI和XIV通过两种途径获得的：（i）与双(2-丙基)p-甲苯磺酰氧甲基磷酸酯(XIII)缩合，氢解得到1-苄氧基-2-双(2-丙基)磷酸甲氧基丙烷VIII和XVI，再经Pd/C转化为2-双(2-丙基)磷酸甲氧基丙醇IX和XVII，然后对后者进行对甲苯磺酸基化或（ii）氯甲基化化合物VI和XIV，随后氯甲醚VII和XV与三(2-丙基)磷酸酯反应，进一步处理苄醚VIII和XVI类似对映体丙醇IX和XVII。这种方法被用于合成腺嘌呤(Ia，IIa)、2,6-二氨基嘌呤(Ib，IIb)和3-去氧腺嘌呤(Ic，IIc)的衍生物。它们的鸟嘌呤对应物Ie和IIe通过水解2-氨基-6-氯嘌呤中间体XId和XIXd制备。6-氯嘌呤通过与甲苯磺酸酯X反应转化为二酯XIi，再与硫脲反应并进行酯解得到6-硫嘌呤衍生物Ij。类似地，2-氨基-6-氯嘌呤衍生物XId与硫脲反应得到9-(R)-(2-磷酸甲氧丙基)-2-硫鸟嘌呤(If)，或与二甲胺反应形成(2-磷酸甲氧丙基)-2-氨基-6-二甲胺嘌呤(Ig)。化合物XId的氢解得到9-(R)-(2-磷酸甲氧丙基)-2-氨基嘌呤(Ik)。腺嘌呤衍生物Ia和IIa的水解脱氨基反应得到对映的(2-磷酸甲氧丙基)次黄嘌呤Ih和IIh。
• Inhibition of human purine nucleoside phosphorylase by tenofovir phosphate congeners
  作者：Ivan Votruba、Jana Trýznová、Petra Břehová、Eva Tloušťová、Květoslava Horská、Jindřich Fanfrlík、Ondřej Přenosil、Antonín Holý

  DOI：10.1135/cccc2010094

  日期：——

  The structure-activity study on the phosphates of phosphonomethoxypropyl derivatives of purine bases interacting with human purine nucleoside phosphorylase has shown that the most efficient inhibitors of the enzyme are (R)- and (S)-PMPGp with K_i ~ 1.9 × 10^–8 and/or 2.2 × 10^–8 mol/l. The kinetic experiments have proven, with the exception of both enantiomers of PMP-8-BrDAPp, strictly competitive character of inhibition for all ANP monophosphates tested. Bromine derivatives exhibited uncompetitive and mixed type of inhibition as well. These results were confirmed by docking studies. The substitution of purine moiety with the bromine at the position 8 lead to an allosteric binding of these compounds toward the enzyme.

  磷酸基嘧啶碱的磷酸甲氧基丙基衍生物与人类嘌呤核苷酸磷酸酰化酶相互作用的结构-活性研究表明，酶的最有效抑制剂是（R）-和（S）-PMPGp，其Ki约为1.9×10^-8和/或2.2×10^-8mol/l。动力学实验证明，除了PMP-8-BrDAPp的两个对映异构体外，所有测试的ANP单磷酸都具有严格的竞争性抑制特性。溴衍生物也表现出非竞争性和混合型抑制。这些结果得到了对接研究的证实。在位置8上用溴代替嘌呤基团导致这些化合物对酶的异构结合。
• [EN] ANTIRETROVIRAL ENANTIOMERIC NUCLEOTIDE ANALOGS<br/>[FR] ANALOGUES DE NUCLEOTIDES ENANTIOMERES ANTIRETROVIRAUX
  申请人：INSTITUTE OF ORGANIC CHEMISTRY AND BIOCHEMISTRY OF THE ACADEMY OF SCIENCES OF THE CZECH REPUBLIC

  公开号：WO1994003467A2

  公开（公告）日：1994-02-17

  (EN) Resolved enantiomers of formulae (IA) and (IB) wherein B is a purine or pyrimidine base or aza and/or deaza analogs thereof are useful in antiviral pharmaceutical compositions to treat retroviral infections.(FR) Des énantiomères dédoublés des formules (IA) et (IB) où B est une base purique ou pyrimidique, ou bien des analogues aza et/ou désaza de ceux-ci sont utiles dans des compositions pharmaceutiques antivirales pour traiter des infections rétrovirales.

  (中文) 公式（IA）和（IB）的旋光异构体，其中B是嘌呤或嘧啶碱基或其氮杂环和/或去氮杂环衍生物，可用于抗病毒药物组合物中，用于治疗逆转录病毒感染。
• Microwave-Accelerated McKenna Synthesis of Phosphonic Acids: An Investigation
  作者：Dana Mustafa、Justin M. Overhulse、Boris A. Kashemirov、Charles E. McKenna

  DOI：10.3390/molecules28083497

  日期：——

  Phosphonic acids represent one of the most important categories of organophosphorus compounds, with myriad examples found in chemical biology, medicine, materials, and other domains. Phosphonic acids are rapidly and conveniently prepared from their simple dialkyl esters by silyldealkylation with bromotrimethylsilane (BTMS), followed by desilylation upon contact with water or methanol. Introduced originally

  膦酸是最重要的有机磷化合物类别之一，在化学生物学、医学、材料和其他领域中有无数的例子。通过用溴三甲基硅烷 (BTMS) 进行甲硅烷基脱烷基化，然后在与水或甲醇接触时脱甲硅烷基化，可以快速方便地从简单的二烷基酯制备膦酸。BTMS 最初由 McKenna 引入，由于其方便、高产、非常温和的条件和化学选择性，长期以来一直是一种受欢迎的膦酸方法。我们系统地研究了微波辐射作为加速一系列甲基膦酸二烷基酯的 BTMS 甲硅烷基脱烷基化 (MW-BTMS) 的手段，涉及溶剂极性（ACN、二恶烷、纯 BTMS、DMF 和环丁砜）、烷基（Me、Et、和知识产权），吸电子 P-取代和膦酸-羧酸三酯化学选择性。使用常规加热进行对照反应。我们还将 MW-BTMS 应用于制备三种无环核苷膦酸酯（ANPs，一类重要的抗病毒和抗癌药物），据报道，在 130–140 °C 下用 HCl 进行 MW 水解时，核苷部分降解（MW-HCl
• Advanced drug development and manufacturing
  申请人：Los Alamos National Security, LLC

  公开号：EP2511844A2

  公开（公告）日：2012-10-17

  There is described an apparatus for measuring protein characteristics comprising an X-ray fluorescence (XRF) spectrometer comprising a source of polychromatic X-rays, an X-ray detector, a protein, a molecule that has been exposed to and at least weakly binds to the protein, a plurality of X-ray fluorescence signal data obtained by irradiating chemical elements in the protein and molecule with the polychromatic X-rays and a security system for maintaining records for the data from the plurality of X-ray fluorescence signal measurements. There is also described an x-ray microscope for measuring a sample.

  描述了一种测量蛋白质特性的仪器，该仪器包括一个 X 射线荧光 (XRF) 光谱仪，其中包括一个多色 X 射线源、一个 X 射线探测器、一个蛋白质、一个已暴露于该蛋白质并至少与该蛋白质弱结合的分子、通过用多色 X 射线照射蛋白质和分子中的化学元素而获得的多个 X 射线荧光信号数据，以及一个用于维护多个 X 射线荧光信号测量数据记录的安全系统。此外，还介绍了一种用于测量样品的 X 射线显微镜。