[(2R,4R,5R,6S)-4,5-dihydroxy-6-methyloxan-2-yl] [hydroxy-[[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy]phosphoryl] hydrogen phosphate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: [(2R,4R,5R,6S)-4,5-dihydroxy-6-methyloxan-2-yl] [hydroxy-[[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy]phosphoryl] hydrogen phosphate
• 化学式: C₁₆H₂₆N₂O₁₄P₂
• 分子量: 532.335
• InChiKey: GLUZBIYLBPDBPE-MDRVADGTSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.8
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  231
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  tdp-4-酮-6-脱氧-D-葡萄糖 在 Tris*HCl buffer 、 magnesium chloride 还原型辅酶II(NADPH)四钠盐 、 1,4-dihydronicotinamide adenine dinucleotide 作用下， 以 甘油 为溶剂， 反应 28.0h， 生成 [(2R,4R,5R,6S)-4,5-dihydroxy-6-methyloxan-2-yl] [hydroxy-[[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy]phosphoryl] hydrogen phosphate
  参考文献：
  名称：

  Kijanimicin 基因簇的阐明：对螺环膦酸抗生素和硝基糖生物合成的洞察

  摘要：

  由放线菌 Actinomadura kijaniata 产生的抗生素 kijanimicin 具有广泛的生物活性以及许多有趣的生物合成特征。为了了解其形成的分子基础并开发此类化合物的组合生物合成系统，鉴定、克隆和测序了含有 kijanimicin 生物合成位点的 A. kijaniata 染色体的 107.6 kb 片段。通过对基因簇中编码的四种酶的生化分析，阐明了形成 TDP-1-洋地黄毒苷（用于构建 kijanimicin 的两个糖供体之一）的完整途径。序列分析表明，苷元kijanolide 是由模块化I 型聚酮化合物合酶的联合作用形成的，这是一组参与形成、附着、甘油酸衍生的三碳单元的分子内环化，形成螺环膦酸盐部分的核心。参与不寻常脱氧糖 d-kijanose [2,3,4,6-tetradeoxy-4-(methylcarbamyl)-3-C-methyl-3-nitro-d-xylo-hexopyranose]

  DOI：

  10.1021/ja0744854

文献信息

• Elucidation of the Kijanimicin Gene Cluster:  Insights into the Biosynthesis of Spirotetronate Antibiotics and Nitrosugars
  作者：Hua Zhang、Jess A. White-Phillip、Charles E. Melançon、Hyung-jin Kwon、Wei-luen Yu、Hung-wen Liu

  DOI：10.1021/ja0744854

  日期：2007.11.28

  formation of TDP-l-digitoxose, one of the two sugar donors used in construction of kijanimicin, was elucidated through biochemical analysis of four enzymes encoded in the gene cluster. Sequence analysis indicates that the aglycone kijanolide is formed by the combined action of a modular Type-I polyketide synthase, a conserved set of enzymes involved in formation, attachment, and intramolecular cyclization of

  由放线菌 Actinomadura kijaniata 产生的抗生素 kijanimicin 具有广泛的生物活性以及许多有趣的生物合成特征。为了了解其形成的分子基础并开发此类化合物的组合生物合成系统，鉴定、克隆和测序了含有 kijanimicin 生物合成位点的 A. kijaniata 染色体的 107.6 kb 片段。通过对基因簇中编码的四种酶的生化分析，阐明了形成 TDP-1-洋地黄毒苷（用于构建 kijanimicin 的两个糖供体之一）的完整途径。序列分析表明，苷元kijanolide 是由模块化I 型聚酮化合物合酶的联合作用形成的，这是一组参与形成、附着、甘油酸衍生的三碳单元的分子内环化，形成螺环膦酸盐部分的核心。参与不寻常脱氧糖 d-kijanose [2,3,4,6-tetradeoxy-4-(methylcarbamyl)-3-C-methyl-3-nitro-d-xylo-hexopyranose]