HIV生命周期中的重要步骤是将病毒DNA整合到宿主染色体中。此步骤由32 kDa病毒酶HIV整合酶(IN)催化。HIV-1 IN是重要且经过验证的靶标,与逆转录酶(RT)和
蛋白酶(PR)
抑制剂组合使用时,选择性抑制该酶的药物被认为在抑制病毒复制方面非常有效。IN催化两个离散的酶促过程,称为3'处理和DNA链转移。作为优化我们先前从一系列2-巯基苯磺酰胺(
MBSA)中识别出的先导分子的研究的一部分,我们应用了三维定量结构-活性关系方法,比较分子场分析(CoMFA),以及比较分子相似性指数分析(CoMSIA),可对多达66种化合物进行训练。使用了两种不同的构象模板:分别通过对接至HIV-1 IN活性位点而获得的Conf-d和通过系统构象搜索而分别使用前导化合物1和14获得的Conf-s。去除具有高残留物的化合物后,可获得具有良好预测能力的可靠模型。Conf-s模型的性能往往优于Conf-d模型