越来越多的证据表明,延长药物靶点停留时间与提高药物疗效之间存在显着相关性。在这里,我们报告了两种密切相关激酶之间动力学选择性的结构原理:粘着斑激酶 (FAK) 和富含脯
氨酸的
酪氨酸激酶 2 (PYK2)。我们发现缓慢解离的
FAK 抑制剂会在 FAK 的 DFG 基序上诱导螺旋结构,但不会在 PYK2 上诱导螺旋结构。结合动力学数据、高分辨率结构和诱变数据支持
抑制剂与 DFG 螺旋区域的疏
水相互作用的作用,为 FAK 的缓慢解离速率和 PYK2 的动力学选择性提供了结构原理。我们的实验数据与从分子模拟计算的相对停留时间密切相关,支持合理优化
配体停留时间的可行策略。我们认为蛋白质结构迁移率和
配体诱导效应之间的相互作用是 FAK 与 PYK2
抑制剂的动力学选择性的关键调节剂。