4-[3,5-bis(trifluoromethyl)benzamido]benzoic acid | 298678-62-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 4-[3,5-bis(trifluoromethyl)benzamido]benzoic acid
• 英文别名: 4-[[3,5-bis(trifluoromethyl)benzoyl]amino]benzoic Acid
• CAS: 298678-62-3
• 化学式: C₁₆H₉F₆NO₃
• 分子量: 377.243
• InChiKey: NVKMEYVFYHLPSL-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.1
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.12
• 拓扑面积：
  66.4
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-[3,5-bis(trifluoromethyl)benzamido]benzoic acid 在 盐酸 、 草酰氯 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N-二甲基甲酰胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 N-(4-(hydroxycarbamoyl)phenyl)-3,5-bis(trifluoromethyl)benzamide
  参考文献：
  名称：

  用于有效和选择性HDAC8靶向的构象受限的苯甲酰胺支架的表征。

  摘要：

  组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）是多种人类疾病的诱人治疗靶标。当前，所有四种FDA批准的HDAC靶向药物都是非选择性的pan-HDAC抑制剂，在治疗剂量时表现出不良副作用。尽管已提出选择性HDAC抑制以减轻毒性，但靶向的催化结构域却高度保守。在本文中，我们描述了一系列合理设计，构象受限的苯甲酰苯胺折叠剂，它们选择性结合HDAC8的催化通道。该系列包括苯甲酰苯胺，MMH371，MMH409和MMH410，它们均具有强大的体外HDAC8活性（IC 50分别为66、23和66 nM），并且在下一个目标HDAC上对HDAC8的选择性高达410倍。对与人HDAC8酶对接的苯甲酰苯胺结构的实验和计算分析表明，采用了低能L形构象异构体，该构象有利于HDAC8选择性。构象受限的HDAC8抑制剂为进一步确定患病细胞中HDAC8的临床应用和药理学敲除的安全性提供了一种替代性的生物探针。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.0c01025
• 作为产物：
  描述：

  Ethyl 4-[[3,5-bis(trifluoromethyl)benzoyl]amino]benzoate 在 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 4-[3,5-bis(trifluoromethyl)benzamido]benzoic acid
  参考文献：
  名称：

  用于有效和选择性HDAC8靶向的构象受限的苯甲酰胺支架的表征。

  摘要：

  组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）是多种人类疾病的诱人治疗靶标。当前，所有四种FDA批准的HDAC靶向药物都是非选择性的pan-HDAC抑制剂，在治疗剂量时表现出不良副作用。尽管已提出选择性HDAC抑制以减轻毒性，但靶向的催化结构域却高度保守。在本文中，我们描述了一系列合理设计，构象受限的苯甲酰苯胺折叠剂，它们选择性结合HDAC8的催化通道。该系列包括苯甲酰苯胺，MMH371，MMH409和MMH410，它们均具有强大的体外HDAC8活性（IC 50分别为66、23和66 nM），并且在下一个目标HDAC上对HDAC8的选择性高达410倍。对与人HDAC8酶对接的苯甲酰苯胺结构的实验和计算分析表明，采用了低能L形构象异构体，该构象有利于HDAC8选择性。构象受限的HDAC8抑制剂为进一步确定患病细胞中HDAC8的临床应用和药理学敲除的安全性提供了一种替代性的生物探针。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.0c01025

文献信息

• Probing DNA Mismatched and Bulged Structures by Using¹⁹F NMR Spectroscopy and Oligodeoxynucleotides with an¹⁹F-Labeled Nucleobase
  作者：Kazuhito Tanabe、Takuya Tsuda、Takeo Ito、Sei-ichi Nishimoto

  DOI：10.1002/chem.201302770

  日期：2013.11.4

  In this study, DNA local structures with bulged bases and mismatched base pairs as well as ordinary full‐matched base pairs by using 19F NMR spectroscopy with 19F‐labeled oligodeoxynucleotides (ODNs) were monitored. The chemical shift change in the 19F NMR spectra allowed discrimination of the DNA structures. Two types of ODNs possessing the bis(trifluoromethyl)benzene unit (F‐unit) at specified uridines

  在这项研究中，通过使用带有19 F标记的寡脱氧核苷酸（ODN）的19 F NMR光谱对带有凸起碱基和错配碱基对以及普通完全匹配碱基对的DNA局部结构进行了监测。19年代的化学位移变化F NMR光谱可以区分DNA结构。制备了两种在特定尿苷中具有双（三氟甲基）苯单元（F-unit）的ODN，并与它们的互补链或非互补链杂交形成匹配，错配或凸出的双链体。通过使用ODN F1，其中F单元直接与炔丙基胺取代的尿苷连接，可以分析三个局部结构，即完全匹配，G–U不匹配和A凸起，而其他结构可以不歧视。分子模型研究表明，ODN F1中的F-单元与相反链的核碱基和糖主链几乎没有相互作用，因为F-单元和尿苷碱基之间的接头长度太短。因此，ODN F1区分DNA局部结构的能力受到限制。因此，ODN F2旨在改进该系统；将氨基苯甲酸插入F-单元和尿苷碱基之间，以便F-单元可以与相反链更紧密地相互作用。最终，可以通过使用ODN
• Design, synthesis and prostate cancer cell-based studies of analogs of the Rho/MKL1 transcriptional pathway inhibitor, CCG-1423
  作者：Chris R. Evelyn、Jessica L. Bell、Jenny G. Ryu、Susan M. Wade、Andrew Kocab、Nicole L. Harzdorf、H.D. Hollis Showalter、Richard R. Neubig、Scott D. Larsen

  DOI：10.1016/j.bmcl.2009.11.056

  日期：2010.1

  We recently identified bis(amide) CCG-1423 (1) as a novel inhibitor of RhoA/C-mediated gene transcription that is capable of inhibiting invasion of PC-3 prostate cancer cells in a Matrigel model of metastasis. An initial structure-activity relationship study focusing on bioisosteric replacement of the amides and conformational restriction identified two compounds, 4g and 8, with improved selectivity for inhibition of RhoA/C-mediated gene transcription and attenuated cytotoxicity relative to 1. Both compounds were also capable of inhibiting cell invasion with equal efficacy to 1 but with less attendant cytotoxicity. (C) 2009 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Characterization of Conformationally Constrained Benzanilide Scaffolds for Potent and Selective HDAC8 Targeting
  作者：Muhammad Murtaza Hassan、Johan Israelian、Nabanita Nawar、Giovanni Ganda、Pimyupa Manaswiyoungkul、Yasir S. Raouf、David Armstrong、Abootaleb Sedighi、Olasunkanmi O. Olaoye、Fettah Erdogan、Aaron D. Cabral、Fabrizio Angeles、Rabia Altintas、Elvin D. de Araujo、Patrick T. Gunning

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.0c01025

  日期：2020.8.13

  selectively bind the catalytic tunnel of HDAC8. The series includes benzanilides, MMH371, MMH409, and MMH410, which exhibit potent in vitro HDAC8 activity (IC50 = 66, 23, and 66 nM, respectively) and up to 410-fold selectivity for HDAC8 over the next targeted HDAC. Experimental and computational analyses of the benzanilide structure docked with human HDAC8 enzyme showed the adoption of a low-energy

  组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）是多种人类疾病的诱人治疗靶标。当前，所有四种FDA批准的HDAC靶向药物都是非选择性的pan-HDAC抑制剂，在治疗剂量时表现出不良副作用。尽管已提出选择性HDAC抑制以减轻毒性，但靶向的催化结构域却高度保守。在本文中，我们描述了一系列合理设计，构象受限的苯甲酰苯胺折叠剂，它们选择性结合HDAC8的催化通道。该系列包括苯甲酰苯胺，MMH371，MMH409和MMH410，它们均具有强大的体外HDAC8活性（IC 50分别为66、23和66 nM），并且在下一个目标HDAC上对HDAC8的选择性高达410倍。对与人HDAC8酶对接的苯甲酰苯胺结构的实验和计算分析表明，采用了低能L形构象异构体，该构象有利于HDAC8选择性。构象受限的HDAC8抑制剂为进一步确定患病细胞中HDAC8的临床应用和药理学敲除的安全性提供了一种替代性的生物探针。