5,6-dihydroxy-2-(3,4-dichlorobenzyl)pyrimidine-4-carboxylic acid methyl ester | 1189791-47-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 5,6-dihydroxy-2-(3,4-dichlorobenzyl)pyrimidine-4-carboxylic acid methyl ester
• 英文别名: methyl 2-[(3,4-dichlorophenyl)methyl]-5-hydroxy-6-oxo-1H-pyrimidine-4-carboxylate
• CAS: 1189791-47-6
• 化学式: C₁₃H₁₀Cl₂N₂O₄
• 分子量: 329.139
• InChiKey: BAQOVWBGJHUBFR-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.15
• 拓扑面积：
  88
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5,6-dihydroxy-2-(3,4-dichlorobenzyl)pyrimidine-4-carboxylic acid methyl ester 在 水 、 lithium hydroxide 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 为溶剂， 以91%的产率得到2-(3,4-dichlorobenzyl)-5,6-dihydroxypyrimidine-4-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  4,5-二羟基嘧啶甲基羧酸盐、羧酸和甲酰胺作为人巨细胞病毒 pUL89 核酸内切酶的抑制剂

  摘要：

  人巨细胞病毒 (HCMV) 末端酶复合物在 pUL89 (pUL89-C) 的 C 末端包含金属依赖性核酸内切酶。我们在此报告了二羟基嘧啶 (DHP) 酸 ( 14 )、甲酯 ( 13 ) 和酰胺 ( 15 ) 亚型作为 HCMV pUL89-C 抑制剂的设计、合成和表征。所有合成的类似物都在核酸内切酶测定和热位移测定 (TSA) 中进行测试，并进行分子对接以预测结合亲和力。尽管从所有三种亚型中鉴定出在亚 μM 范围内抑制 pUL89-C 的类似物，但酸 ( 14 ) 显示出比酯 ( 13 ) 和酰胺 ( 15 ) 更好的整体效力、显着更大的热位移和更好的对接分数). 在基于细胞的抗病毒试验中，六种类似物以中等活性抑制 HCMV (EC 50 = 14.4–22.8 μM)。酸亚型 ( 14 ) 表现出良好的体外ADME 特性，但渗透性较差。总体而言，我们的数据支持 DHP 酸亚型 ( 14

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.2c00203
• 作为产物：
  描述：

  3,4-二氯苯乙腈 在 羟胺 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 、 邻二甲苯 、 水 为溶剂， 反应 24.67h， 生成 5,6-dihydroxy-2-(3,4-dichlorobenzyl)pyrimidine-4-carboxylic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  4,5-二羟基嘧啶甲基羧酸盐、羧酸和甲酰胺作为人巨细胞病毒 pUL89 核酸内切酶的抑制剂

  摘要：

  人巨细胞病毒 (HCMV) 末端酶复合物在 pUL89 (pUL89-C) 的 C 末端包含金属依赖性核酸内切酶。我们在此报告了二羟基嘧啶 (DHP) 酸 ( 14 )、甲酯 ( 13 ) 和酰胺 ( 15 ) 亚型作为 HCMV pUL89-C 抑制剂的设计、合成和表征。所有合成的类似物都在核酸内切酶测定和热位移测定 (TSA) 中进行测试，并进行分子对接以预测结合亲和力。尽管从所有三种亚型中鉴定出在亚 μM 范围内抑制 pUL89-C 的类似物，但酸 ( 14 ) 显示出比酯 ( 13 ) 和酰胺 ( 15 ) 更好的整体效力、显着更大的热位移和更好的对接分数). 在基于细胞的抗病毒试验中，六种类似物以中等活性抑制 HCMV (EC 50 = 14.4–22.8 μM)。酸亚型 ( 14 ) 表现出良好的体外ADME 特性，但渗透性较差。总体而言，我们的数据支持 DHP 酸亚型 ( 14

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.2c00203

文献信息

• RNase H Active Site Inhibitors of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Reverse Transcriptase: Design, Biochemical Activity, and Structural Information
  作者：Thorsten A. Kirschberg、Mini Balakrishnan、Neil H. Squires、Tiffany Barnes、Katherine M. Brendza、Xiaowu Chen、Eugene J. Eisenberg、Weili Jin、Nilima Kutty、Stephanie Leavitt、Albert Liclican、Qi Liu、Xiaohong Liu、John Mak、Jason K. Perry、Michael Wang、William J. Watkins、Eric B. Lansdon

  DOI：10.1021/jm900597q

  日期：2009.10.8

  Pyrimidinol carboxylic acids were designed as inhibitors of HIV-1 RNase H function. These molecules can coordinate to two divalent metal ions in the RNase H active site. Inhibition of enzymatic activity was measured in a biochemical assay, but no antiviral effect was observed. Binding wits demonstrated via a solid state structure of the isolated p15-Ec domain of HIV-1 RT showing inhibitor and two Mn(II) ions bound to the RNase H active site.
• Design and synthesis of N-methylpyrimidone derivatives as HIV-1 integrase inhibitors
  作者：Yujie Wang、Jie Rong、Bin Zhang、Liming Hu、Xiaoli Wang、Chengchu Zeng

  DOI：10.1016/j.bmc.2014.12.059

  日期：2015.2

  A series of novel beta-diketo derivatives which combined the virtues of dihydroxypyrimidine carboxamide derived from the evolution of DKA and polyhydroxylated aromatics moieties, were designed and synthesized as potential HIV-1 integrase (IN) inhibitors and evaluated their inhibition to the strand transfer process of HIV-1 integrase and anti-HIV-1 activity. The result indicates that 3,4,5-trihydroxylated aromatic derivatives exhibit good inhibition to HIV-1 integrase, but dihydroxylated aromatic derivatives appear little inhibition to HIV-1 integrase. In addition, the preliminary structure-activity relationship (SAR) of these new derivatives was rationalized by docking studies. (c) 2014 Elsevier Ltd. All rights reserved.