(2R)-N-[(1S,2R,18R,19R,22S,25R,28R,40S)-26-amino-22-(2-amino-2-oxoethyl)-5,15-dichloro-2,18,32,35,37,48-hexahydroxy-40-(hydroxymethyl)-20,23,42,44-tetraoxo-7,13-dioxa-21,24,27,41,43-pentazaoctacyclo[26.14.2.23,6.214,17.18,12.129,33.010,25.034,39]pentaconta-3,5,8(48),9,11,14,16,26,29(45),30,32,34(39),35,37,46,49-hexadecaen-19-yl]-4-methyl-2-(methylamino)pentanamide | 1355080-51-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (2R)-N-[(1S,2R,18R,19R,22S,25R,28R,40S)-26-amino-22-(2-amino-2-oxoethyl)-5,15-dichloro-2,18,32,35,37,48-hexahydroxy-40-(hydroxymethyl)-20,23,42,44-tetraoxo-7,13-dioxa-21,24,27,41,43-pentazaoctacyclo[26.14.2.23,6.214,17.18,12.129,33.010,25.034,39]pentaconta-3,5,8(48),9,11,14,16,26,29(45),30,32,34(39),35,37,46,49-hexadecaen-19-yl]-4-methyl-2-(methylamino)pentanamide
• CAS: 1355080-51-1
• 化学式: C₅₃H₅₅Cl₂N₉O₁₅
• 分子量: 1128.98
• InChiKey: YPOIGLHQXXWTDZ-JBKHQUTPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.9
• 重原子数：
  79
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  10.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  399
• 氢给体数：
  15
• 氢受体数：
  17

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (2R)-N-[(1S,2R,18R,19R,22S,25R,28R,40S)-22-(2-amino-2-oxoethyl)-5,15-dichloro-2,18,32,35,37,48-hexahydroxy-40-(hydroxymethyl)-20,23,42,44-tetraoxo-26-sulfanylidene-7,13-dioxa-21,24,27,41,43-pentazaoctacyclo[26.14.2.23,6.214,17.18,12.129,33.010,25.034,39]pentaconta-3,5,8(48),9,11,14,16,29(45),30,32,34(39),35,37,46,49-pentadecaen-19-yl]-4-methyl-2-(methylamino)pentanamide 在 氨 、 silver(I) acetate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 12.0h， 以85%的产率得到(2R)-N-[(1S,2R,18R,19R,22S,25R,28R,40S)-26-amino-22-(2-amino-2-oxoethyl)-5,15-dichloro-2,18,32,35,37,48-hexahydroxy-40-(hydroxymethyl)-20,23,42,44-tetraoxo-7,13-dioxa-21,24,27,41,43-pentazaoctacyclo[26.14.2.23,6.214,17.18,12.129,33.010,25.034,39]pentaconta-3,5,8(48),9,11,14,16,26,29(45),30,32,34(39),35,37,46,49-hexadecaen-19-yl]-4-methyl-2-(methylamino)pentanamide
  参考文献：
  名称：

  [Ψ[C(=S)NH]Tpg4]万古霉素苷元、[Ψ[C(=NH)NH]Tpg4]万古霉素苷元及相关关键化合物的全合成：将万古霉素重新设计为双-Ala-d-Ala 和d-丙氨酸-紫胶结合

  摘要：

  [Ψ[C(=S)NH]Tpg(4)]万古霉素苷元 (8) 的全合成及其独特的 AgOAc 促进的单步转化为 [Ψ[C(=NH)NH]Tpg(4)]公开了在完全去保护的底物上进行的万古霉素苷元(7)。该合成方法不仅允许获得 7，而且还允许在后期获得相关残基 4 衍生物，从常见的后期获得 [Ψ[CH(2)NH]Tpg(4)]万古霉素苷元 (6)。 -阶段中间体，并提供万​​古霉素苷元的真实残基4硫代酰胺和脒衍生物，这将有助于其半合成制备的持续努力。除了早期残基 4 硫代酰胺的引入（允许区分万古霉素核心结构中心的七个酰胺键之一）之外，该方法还依赖于两个芳香族亲核取代反应来在 CD/DE 环系统中形成 16 元二芳基醚，用于闭合 12 元联芳基 AB 环系统的有效大环内酰胺化，以及 CD、AB 和 DE 环闭合的定义顺序。这种闭环顺序遵循其热阻转异构体平衡的日益容易，允许在逐渐温和的热条件下回收任

  DOI：

  10.1021/ja209937s

文献信息

• [EN] GLYCOPEPTIDE ANTIBIOTIC ANALOGS EFFECTIVE AGAINST VANCOMYCIN-RESISTANT BACTERIAL STRAINS<br/>[FR] ANALOGUES D'ANTIBIOTIQUES GLYCOPEPTIDIQUES EFFICACES CONTRE DES SOUCHES BACTÉRIENNES RÉSISTANTES À LA VANCOMYCINE
  申请人：SCRIPPS RESEARCH INST

  公开号：WO2013022763A1

  公开（公告）日：2013-02-14

  The invention is directed to glycopeptide antibiotics and their aglycones that are engineered to overcome bacterial resistance by replacement of a single, specific peptide carboxamide group in the core peptide of the glycopeptide antibiotic with an amidine group. The amidine pseudopeptide analog of the glycopeptide is effective in killing vancomycin-resistant bacteria at therapeutically achievable concentrations in a patient. For example, a [ψ[C(=NH)NH]Tpg4]-vancomycin aglycon designed to exhibit the dual binding to D-Ala-D-Ala and D-Ala-D-Lac needed to reinstate activity against vancomycin-resistant bacteria has been shown to overcome a common mode of bacterial resistance to the "last resort" antibiotics of the glycopeptide class. The pseudopeptide amidine analogs can be prepared from corresponding pseudopeptide thioamide analogs, which can be prepared synthetically, semi-synthetically, or biosynthetically.

  本发明涉及糖肽抗生素及其无糖基物，通过将糖肽抗生素的核心肽中的单一、特定的肽羧酰胺基团替换为氨基亚胺基团，以克服细菌抗药性的工程化。糖肽的氨基亚胺伪肽类似物在患者体内的治疗可达浓度下有效地杀灭万古霉素耐药菌。例如，设计用于表现对D-Ala-D-Ala和D-Ala-D-Lac双重结合所需的[ψ[C(=NH)NH]Tpg4]-万古霉素无糖基物已被证明能克服糖肽类“最后一道防线”抗生素常见的细菌耐药机制。伪肽氨基亚胺类似物可以从相应的伪肽硫酰胺类似物中制备，这些类似物可以通过合成、半合成或生物合成制备。
• GLYCOPEPTIDE ANTIBIOTIC ANALOGS EFFECTIVE AGAINST VANCOMYCIN-RESISTANT BACTERIAL STRAINS
  申请人：The Scripps Research Institute

  公开号：EP2739289B1

  公开（公告）日：2020-05-06
• Total Synthesis of [Ψ[C(═S)NH]Tpg⁴]Vancomycin Aglycon, [Ψ[C(═NH)NH]Tpg⁴]Vancomycin Aglycon, and Related Key Compounds: Reengineering Vancomycin for Dual <scp>d</scp>-Ala-<scp>d</scp>-Ala and <scp>d</scp>-Ala-<scp>d</scp>-Lac Binding
  作者：Jian Xie、Akinori Okano、Joshua G. Pierce、Robert C. James、Simon Stamm、Christine M. Crane、Dale L. Boger

  DOI：10.1021/ja209937s

  日期：2012.1.18

  thioamide introduction, allowing differentiation of one of seven amide bonds central to the vancomycin core structure, the approach relied on two aromatic nucleophilic substitution reactions for formation of the 16-membered diaryl ethers in the CD/DE ring systems, an effective macrolactamization for closure of the 12-membered biaryl AB ring system, and the defined order of CD, AB, and DE ring closures

  [Ψ[C(=S)NH]Tpg(4)]万古霉素苷元 (8) 的全合成及其独特的 AgOAc 促进的单步转化为 [Ψ[C(=NH)NH]Tpg(4)]公开了在完全去保护的底物上进行的万古霉素苷元(7)。该合成方法不仅允许获得 7，而且还允许在后期获得相关残基 4 衍生物，从常见的后期获得 [Ψ[CH(2)NH]Tpg(4)]万古霉素苷元 (6)。 -阶段中间体，并提供万​​古霉素苷元的真实残基4硫代酰胺和脒衍生物，这将有助于其半合成制备的持续努力。除了早期残基 4 硫代酰胺的引入（允许区分万古霉素核心结构中心的七个酰胺键之一）之外，该方法还依赖于两个芳香族亲核取代反应来在 CD/DE 环系统中形成 16 元二芳基醚，用于闭合 12 元联芳基 AB 环系统的有效大环内酰胺化，以及 CD、AB 和 DE 环闭合的定义顺序。这种闭环顺序遵循其热阻转异构体平衡的日益容易，允许在逐渐温和的热条件下回收任