perfluorophenyl 2,5,8,11,14-pentaoxahexadecan-16-oate | 1082737-41-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯酚酯
• 英文名称: perfluorophenyl 2,5,8,11,14-pentaoxahexadecan-16-oate
• CAS: 1082737-41-4
• 化学式: C₁₇H₂₁F₅O₇
• 分子量: 432.342
• InChiKey: MXJIVHWTNUVSSE-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.0
• 重原子数：
  29.0
• 可旋转键数：
  15.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.59
• 拓扑面积：
  72.45
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  perfluorophenyl 2,5,8,11,14-pentaoxahexadecan-16-oate 、 N'-Fmoc-L-赖氨酸 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以0.37 g的产率得到Fmoc-Lys(MPEG4)-OH
  参考文献：
  名称：

  脂氨基酸在调节全身活性甘丙肽类似物的抗惊厥活性中的结构要求

  摘要：

  将脂氨基酸 (LAA)、Lys-棕榈酰和阳离子化引入一系列甘丙肽类似物，产生具有全身活性的抗惊厥化合物。为了研究 LAA 结构与抗惊厥活性之间的关系，合成了正交保护的 LAA，其中 Lys 侧链与长度从 C 8到 C 18不等的脂肪酸偶联，或与单分散聚乙二醇 PEG 4偶联。全身给药后，测定了甘丙肽受体亲和力、血清稳定性、亲脂性 (log  D ) 和每种新合成类似物在 6 Hz 癫痫小鼠模型中的活性。各种 LAA 或 Lys 的存在（MPEG 4) 不影响修饰肽的受体结合特性，但它们的抗惊厥活性变化很大并且通常与它们的亲脂性相关。我们的结果表明，改变与带正电荷的氨基酸残基相邻的 LAA 残基的长度或极性可以有效地调节甘丙肽类似物的抗癫痫活性。

  DOI：

  10.1021/jm801397w
• 作为产物：
  描述：

  五氟苯酚 、 2,5,8,11,14-五氧杂十六碳烷-16-酸 在 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 perfluorophenyl 2,5,8,11,14-pentaoxahexadecan-16-oate
  参考文献：
  名称：

  脂氨基酸在调节全身活性甘丙肽类似物的抗惊厥活性中的结构要求

  摘要：

  将脂氨基酸 (LAA)、Lys-棕榈酰和阳离子化引入一系列甘丙肽类似物，产生具有全身活性的抗惊厥化合物。为了研究 LAA 结构与抗惊厥活性之间的关系，合成了正交保护的 LAA，其中 Lys 侧链与长度从 C 8到 C 18不等的脂肪酸偶联，或与单分散聚乙二醇 PEG 4偶联。全身给药后，测定了甘丙肽受体亲和力、血清稳定性、亲脂性 (log  D ) 和每种新合成类似物在 6 Hz 癫痫小鼠模型中的活性。各种 LAA 或 Lys 的存在（MPEG 4) 不影响修饰肽的受体结合特性，但它们的抗惊厥活性变化很大并且通常与它们的亲脂性相关。我们的结果表明，改变与带正电荷的氨基酸残基相邻的 LAA 残基的长度或极性可以有效地调节甘丙肽类似物的抗癫痫活性。

  DOI：

  10.1021/jm801397w

文献信息

• Poly(ethylene glycol)-Based Stable Isotope Labeling Reagents for the Quantitative Analysis of Low Molecular Weight Metabolites by LC−MS
  作者：Nicolas Abello、Paul P. Geurink、Marco van der Toorn、Antoon J. M. van Oosterhout、Johan Lugtenburg、Gijs A. van der Marel、Huib A. M. Kerstjens、Dirkje S. Postma、Hermen S. Overkleeft、Rainer Bischoff

  DOI：10.1021/ac801215c

  日期：2008.12.1

  reversed-phase column, and their identification was facilitated based on m/z values and retention times using extracted ion chromatograms. The mass increase due to PEG derivatization moved low molecular weight metabolite signals out of the often noisy, low m/z region of the mass spectra, which resulted in enhanced overall sensitivity and selectivity. Furthermore, elution at increased retention times resulted in

  稳定同位素标记（SIL）与液相色谱-质谱联用是最广泛使用的定量分析方法之一，因为它具有灵敏度高和能够处理极其复杂的生物样品的能力。但是，用于代谢物分析的SIL方法通常在多重分析，衍生化分析物的色谱特性或其电离效率方面仍然受到限制。在这里，我们描述了一种新的基于伯胺的含13C聚（乙二醇）链（PEG）的五氟苯基活化酯的含伯胺化合物的SIL试剂，解决了这些缺点。PEG链的顺序建立允许引入各种数量的13C原子，从而打开了扩展的复用可能性。亲水性较强的分子（例如氨基酸和谷胱甘肽）的PEG衍生物已成功保留在标准C18反相色谱柱上，并基于m / z值和保留时间，使用提取的离子色谱图进行了鉴定。由于PEG衍生化而导致的质量增加，使低分子量代谢物信号从质谱图中通常嘈杂的低m / z区域移出，从而提高了总体灵敏度和选择性。此外，由于流动相中乙腈的含量较高，因此保留时间增加的洗脱导致有效的电喷雾电离。该方法已成
• Electron Transfer and Collision Induced Dissociation of Non-Derivatized and Derivatized Desmosine and Isodesmosine
  作者：Sara Ongay、Jos Hermans、Andries P. Bruins、Adrianus M. C. H. Nieuwendijk、Hermen Overkleeft、Rainer Bischoff

  DOI：10.1007/s13361-012-0504-x

  日期：2013.1.1

  Electron transfer dissociation (ETD) has attracted increasing interest due to its complementarity to collision-induced dissociation (CID). ETD allows the direct localization of labile post-translational modifications, which is of main interest in proteomics where differences and similarities between ETD and CID have been widely studied. However, due to the fact that ETD requires precursor ions to carry at least two charges, little is known about differences in ETD and CID of small molecules such as metabolites. In this work, ETD and CID of desmosine (DES) and isodesmosine (IDS), two isomers that due to the presence of a pyridinium group can carry two charges after protonation, are studied and compared. In addition, the influence of DES/IDS derivatization with propionic anhydride and polyethyleneglycol (PEG) reagents on ETD and CID was studied, since this is a common strategy to increase sensitivity and to facilitate the analysis by reversed-phase chromatography. Clear differences between ETD and CID of non-derivatized and derivatized-DES/IDS were observed. While CID is mainly attributable to charge-directed fragmentation, ETD is initiated by the generation of a hydrogen atom at the initial protonation site and its subsequent transfer to the pyridinium ring of DES/IDS. These differences are reflected in the generation of complex CID spectra dominated by the loss of small, noninformative molecules (NH3, CO, H2O), while ETD spectra are simpler and dominated by characteristic side-chain losses. This constitutes a potential advantage of ETD in comparison to CID when employed for the targeted analysis of DES/IDS in biological samples.

  电子转移解离（ETD）因其与碰撞诱导解离（CID）的互补性而受到越来越多的关注。电子转移解离可直接定位易变的翻译后修饰，这也是蛋白质组学的主要兴趣所在，ETD 和 CID 之间的异同已被广泛研究。然而，由于 ETD 要求前体离子至少带两个电荷，因此人们对代谢物等小分子的 ETD 和 CID 的差异知之甚少。在这项工作中，研究并比较了去甲肌苷（DES）和异去甲肌苷（IDS）的 ETD 和 CID，这两种异构体由于存在一个吡啶基，质子化后可携带两种电荷。此外，还研究了用丙酸酐和聚乙二醇（PEG）试剂衍生 DES/IDS 对 ETD 和 CID 的影响，因为这是提高灵敏度和方便反相色谱分析的常用策略。观察到未衍生化和衍生化 DES/IDS 的 ETD 和 CID 之间存在明显差异。CID 主要归因于电荷定向碎片，而 ETD 则是由初始质子化位点产生的氢原子及其随后转移到 DES/IDS 的吡啶鎓环上引起的。这些差异反映在产生复杂的 CID 图谱上，主要是损失了小的、无信息的分子（NH3、CO、H2O），而 ETD 图谱较为简单，主要是损失了特征性侧链。这也是 ETD 与 CID 相比在生物样本中定向分析 DES/IDS 时的潜在优势。