methyl (S)-4,6-dioxo-5¹H-11,16-dioxa-7-aza-5(2,5)-pyrrola-1,10(1,4)-dibenzenacyclohexadecaphane-8-carboxylate | 1610043-31-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 大环内酰胺类
• 英文名称: methyl (S)-4,6-dioxo-5¹H-11,16-dioxa-7-aza-5(2,5)-pyrrola-1,10(1,4)-dibenzenacyclohexadecaphane-8-carboxylate
• CAS: 1610043-31-6
• 化学式: C₂₈H₃₀N₂O₆
• 分子量: 490.556
• InChiKey: KRLFKKCHKOGQQJ-VWLOTQADSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  36.0
• 可旋转键数：
  1.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  106.72
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (S)-4,6-dioxo-5¹H-11,16-dioxa-7-aza-5(2,5)-pyrrola-1,10(1,4)-dibenzenacyclohexadecaphane-8-carboxylate 在 1-羟基苯并三唑 、 戴斯-马丁氧化剂 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 37.08h， 生成 (S)-N-((S)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl)-4,6-dioxo-5¹H-11,16-dioxa-7-aza-5(2,5)-pyrrola-1,10(1,4)-dibenzenacyclohexadecaphane-8-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  具有降低的肽特性的大环蛋白酶抑制剂

  摘要：

  真正需要定义β链构象的简单结构，这是肽与蛋白质相互作用的核心二级结构。例如，蛋白酶底物和抑制剂在活性位点结合上几乎普遍采用这种几何形状。平面吡咯用于取代肽主链的两个氨基酸，以生成一个简单的大环，该大环保留了活性位点结合所需的几何形状。生成的β链模板具有降低的肽特性，并提供了有效的蛋白酶抑制剂，并在C末端连接了适当的氨基醛。据报道组织蛋白酶L和S的皮摩尔抑制剂，并且一个实例与模型蛋白酶胰凝乳蛋白酶的结合方式通过X射线晶体学确定。

  DOI：

  10.1002/anie.201404301
• 作为产物：
  描述：

  在 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 20.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 18.0h， 以80 mg的产率得到methyl (S)-4,6-dioxo-5¹H-11,16-dioxa-7-aza-5(2,5)-pyrrola-1,10(1,4)-dibenzenacyclohexadecaphane-8-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  具有降低的肽特性的大环蛋白酶抑制剂

  摘要：

  真正需要定义β链构象的简单结构，这是肽与蛋白质相互作用的核心二级结构。例如，蛋白酶底物和抑制剂在活性位点结合上几乎普遍采用这种几何形状。平面吡咯用于取代肽主链的两个氨基酸，以生成一个简单的大环，该大环保留了活性位点结合所需的几何形状。生成的β链模板具有降低的肽特性，并提供了有效的蛋白酶抑制剂，并在C末端连接了适当的氨基醛。据报道组织蛋白酶L和S的皮摩尔抑制剂，并且一个实例与模型蛋白酶胰凝乳蛋白酶的结合方式通过X射线晶体学确定。

  DOI：

  10.1002/anie.201404301

文献信息

• A mechanistic study on the inhibition of α-chymotrypsin by a macrocyclic peptidomimetic aldehyde
  作者：X. Zhang、J. B. Bruning、J. H. George、A. D. Abell

  DOI：10.1039/c6ob01159d

  日期：——

  which a new class of macrocyclic peptidomimetic aldehyde inhibits α-chymotrypsin. In particular, a 13C-labelled analogue of the inhibitor was prepared and used in NMR experiments to confirm formation of a hemiacetal intermediate on binding with α-chymotrypsin. Analysis of an X-ray crystallographic structure in complex with α-chymotrypsin reveals that the backbone adopts a stable β-strand conformation

  在这里，我们描述了一种基于NMR和X射线晶体学的表征机制，通过该机制，一类新型的大环拟肽醛抑制α-胰凝乳蛋白酶。特别地，制备了抑制剂的13 C-标记的类似物，并用于NMR实验中，以确认与α-胰凝乳蛋白酶结合后半缩醛中间体的形成。与α-胰凝乳蛋白酶复合的X射线晶体结构分析表明，该骨架根据其设计采用了稳定的β链构象。通过与S 1亚位点附近的氧阴离子孔和多个氢键的相互作用进一步稳定了结合。