1-(2-deoxy-3,5-di-O-p-toluoyl-α-D-erythro-pentofuranosyl)thymine | 4784-41-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-(2-deoxy-3,5-di-O-p-toluoyl-α-D-erythro-pentofuranosyl)thymine
• 英文别名: α-2'-deoxy-3',5'-di-O-p-toluoylthymidine；3',5'-di-O-toluoyl-α-thymidine；1-(3,5-Di-O-p-toluoyl-2-desoxy-α-D-ribofuranosyl)-thymin；3',5'-Di-O-p-toluoyl-2'-desoxy-α-thymidin；1-[O³,O⁵-bis-(4-methyl-benzoyl)-α-D-erythro-2-deoxy-pentofuranosyl]-5-methyl-1H-pyrimidine-2,4-dione；1-(O,O'-di-p-toluoyl-α-D-erythro-2-deoxy-pentofuranosyl)-5-methyl-1H-pyrimidine-2,4-dione；1-(O,O'-Di-p-toluoyl-α-D-erythro-2-desoxy-pentofuranosyl)-5-methyl-1H-pyrimidin-2,4-dion；[(2R,3S,5S)-3-(4-methylbenzoyl)oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl 4-methylbenzoate
• CAS: 4784-41-2
• 化学式: C₂₆H₂₆N₂O₇
• 分子量: 478.502
• InChiKey: PUSZQUJVSQNJEI-BDTNDASRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  111
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(2-deoxy-3,5-di-O-p-toluoyl-α-D-erythro-pentofuranosyl)thymine 生成 5'-O-dimethoxytrityl-α-thymidine
  参考文献：
  名称：

  Novel DNA Analog for Potential Gene Regulating Agent. A Convenient Synthesis of α-Oligodeoxyribonucleotide Phosphorothioate Bearing 3′-Monophosphate

  摘要：

  利用附着在聚四氟乙烯基固体支持物上的核糖腺苷，通过亚磷酰胺法方便地合成了含 3′-单磷酸的α-2′-去氧肌酸硫代磷酸酯类似物。所获得的寡聚体对常见核酸酶的消化具有更高的稳定性。

  DOI：

  10.1246/cl.1991.1941
• 作为产物：
  描述：

  1-[2-脱氧-3,5-二-O-(4-甲基苯甲酰)呋喃戊糖基]-5-甲基-2,4(1H,3H)-嘧啶二酮 在 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 六甲基二硅氮烷 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 20.0h， 以81%的产率得到1-(2-deoxy-3,5-di-O-p-toluoyl-α-D-erythro-pentofuranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  TMS三氟甲磺酸酯介导的β-胸苷C1'差向异构化为α-胸苷的取代基和溶剂效应

  摘要：

  本文涉及 TMSOTf 介导的 β-胸苷 C1' 差向异构化为 α-胸苷的动力学研究。详细描述了相邻基团参与各种 5'-羟基保护基团，如甲苯甲酰基、Et2CHC(O)、Et2NC(O)和 Et2NC(S)对 β→α 转化的影响。C1'差向异构化中α和β端基异构体的比率的时间依赖性通过1H NMR估计。α/β 平衡常数 K 和速率常数 kα 和 kβ 是根据实验数据计算的。结果得出的结论是，在乙腈中，α/β 平衡常数 K 在热力学上受 5'-羟基保护基团的位阻影响。另一方面，速率常数 kα 和 kβ 主要受氧鎓离子中间体稳定性的影响。特别是，由于二乙基硫代氨基甲酰基的相邻基团参与，从氧鎓离子中间体形成分子内环化亚胺鎓离子中间体倾向于降低总反应速率。最后，通过使用 Et2CHC(O) 基团，可以以 89% 的高 α 异构体选择性进行 α/β C1'差向异构化。因此，可以从 β-胸苷作为合成 α-DNA

  DOI：

  10.1002/1099-0690(20021)2002:1<87::aid-ejoc87>3.0.co;2-b

文献信息

• Synthesis of α-2′-deoxynucleosides
  作者：Erik Larsen、Abdel Aleem H. Abdel Aleem、Erik B. Pedersen

  DOI：10.1002/jhet.5570320542

  日期：1995.9

  α-Thymidine (4) was synthesized from thymidine (1) in 3 steps in 36% overall yield without using chro-matography and with the possibility of increasing the yield to 85% by reusing the remaining α,β-mixture. 1-(2-Deoxy-3,5-di-O-p-toluoyl-α-D-erythro-pentofuranosyl)thymine (3) was further converted to 1-(2-deoxy-α-D-erythro-pentofuranosyl)-5-methylcytosine (5).

  从胸腺嘧啶（1）分三步合成α-胸腺嘧啶（4），总收率36％，无需使用色谱法，并且有可能通过重用剩余的α，β-混合物将收率提高至85％。1-（2-脱氧-3,5-二-运算甲苯甲酰-α-D-赤式-pentofuranosyl）胸腺嘧啶（3）进一步转化为1-（2-脱氧-α-D-赤式-pentofuranosyl）-5- -甲基胞嘧啶（5）。
• Preparation of thymidine and deoxyfluorouridine, and intermediates therefor
  申请人：HOFFMANN LA ROCHE

  公开号：US02949451A1

  公开（公告）日：1960-08-16
• Hoffer et al., Journal of the American Chemical Society, 1959, vol. 81, p. 4112
  作者：Hoffer et al.

  DOI：——

  日期：——
• Hoffer, Chemische Berichte, 1960, vol. 93, p. 2777,2780
  作者：Hoffer

  DOI：——

  日期：——
• Facile Stereospecific Synthesis of a-Anomeric 2'-Deoxynucleosides
  作者：Kazuo Shinozuka、Yoshiki Hirota、Tsutomu Morita、Hiroaki Sawai

  DOI：10.3987/com-92-6125

  日期：——

  The coupling reaction of activated nucleobases, such as the sodium salts of N-benzoyladenine and 6-chloropurine and 2,4-bis-O-trimethylsilylthymine, with 1-alpha-chloro-2-deoxy-3,5-di-O-p-toluoylribofuranose (1) in a mixture of acetonitrile and tetrahydrufuran leads to the stereospecific formation of a-anomeric 2'-deoxynucleosides with satisfactory yields. The ratio of the distribution between the resulted alpha- and beta-stereoisomers was about 3:1 in each case. The method is simple and applicable to the preparation of both purine and pyrimidine alpha-2'-deoxynucleosides.