5'-d(TXTTTTTT)-3'; X = 2'-deoxy-5-[3-({4-[(2,2-difluorocyclooct-3-yn-1-yl)methyl]benzoyl}amino)prop-1-yn-1-yl]uridine | 1289361-06-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: 5'-d(TXTTTTTT)-3'; X = 2'-deoxy-5-[3-({4-[(2,2-difluorocyclooct-3-yn-1-yl)methyl]benzoyl}amino)prop-1-yn-1-yl]uridine
• CAS: 1289361-06-3
• 化学式: C₉₈H₁₂₀F₂N₁₇O₅₅P₇
• 分子量: 2670.92
• InChiKey: ZMGGWCRITQQMSK-QZZKMDEESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.13
• 重原子数：
  179.0
• 可旋转键数：
  48.0
• 环数：
  18.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  972.6
• 氢给体数：
  18.0
• 氢受体数：
  56.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [4-[[(2-Azidoacetyl)amino]methyl]phenyl]boronic acid 、 5'-d(TXTTTTTT)-3'; X = 2'-deoxy-5-[3-({4-[(2,2-difluorocyclooct-3-yn-1-yl)methyl]benzoyl}amino)prop-1-yn-1-yl]uridine 反应 0.5h， 生成 5'-d(TXTTTTTT)-3'; X = 2'-deoxy-5-{3-[(4-{[1-(2-{[4-(dihydroxyboryl)benzyl]amino}-2-oxoethyl)-9,9-difluoro-4,5,6,7,8,9-hexahydro-1H-cycloocta[d][1,2,3]triazol-8-yl]methyl}benzoyl)amino]prop-1-yn-1-yl}uridine 、 5'-d(TXTTTTTT)-3'; X = 2'-deoxy-5-{3-[(4-{[3-(2-{[4-(dihydroxyboryl)benzyl]amino}-2-oxoethyl)-9,9-difluoro-4,5,6,7,8,9-hexahydro-1H-cycloocta[d][1,2,3]triazol-8-yl]methyl}benzoyl)amino]prop-1-yn-1-yl}uridine
  参考文献：
  名称：

  通过无铜点击反应进行硼酸修饰的DNA的第一化学合成。

  摘要：

  报道了使用无铜咔嗒试剂将硼酸基团第一次化学掺入DNA。与基于PCR的方法相比，此方法可进行更大的位点特异性结合和合成。

  DOI：

  10.1039/c0cc04546b
• 作为产物：
  描述：

  、 N-[3-[1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]-2,4-dioxopyrimidin-5-yl]prop-2-ynyl]-4-[(2,2-difluorocyclooct-3-yn-1-yl)methyl]benzamide 、 5’-(4,4’-二甲氧基三苯基)-3’-脱氧胸苷 2’-(2-氰乙基-N,N-二异丙基)亚磷酰胺 在 三氯乙酸 、 5-苄硫基四氮唑 作用下， 以 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 0.09h， 生成 5'-d(TXTTTTTT)-3'; X = 2'-deoxy-5-[3-({4-[(2,2-difluorocyclooct-3-yn-1-yl)methyl]benzoyl}amino)prop-1-yn-1-yl]uridine
  参考文献：
  名称：

  通过无铜点击反应进行硼酸修饰的DNA的第一化学合成。

  摘要：

  报道了使用无铜咔嗒试剂将硼酸基团第一次化学掺入DNA。与基于PCR的方法相比，此方法可进行更大的位点特异性结合和合成。

  DOI：

  10.1039/c0cc04546b