1-((2R,3S,4R,5R)-3-ethynyl-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione | 1051395-31-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-((2R,3S,4R,5R)-3-ethynyl-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• 英文别名: 1-(2-C-ethynyl-β-D-arabinofuranosyl)uracil；1-[(2R,3S,4R,5R)-3-ethynyl-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1051395-31-3
• 化学式: C₁₁H₁₂N₂O₆
• 分子量: 268.226
• InChiKey: KPLKOOBPQQYUTM-AAQQEJRNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.4
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-((2R,3S,4R,5R)-3-ethynyl-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 在 吡啶 、 二乙胺基三氟化硫 、 氨 作用下， 以 甲醇 、 甲苯 为溶剂， 反应 31.0h， 生成 1-((2R,3R,4R,5R)-3-ethynyl-3-fluoro-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  基于尿苷的核苷氨基磷酸酯前药的结构-活性关系用于抑制登革热病毒RNA依赖性RNA聚合酶。

  摘要：

  为了鉴定登革热病毒依赖RNA的RNA聚合酶的有效和选择性核苷抑制剂，合成并评估了一系列2'-和/或4'-核糖修饰的尿苷核苷氨基磷酸酯前药及其相应的三磷酸酯。用2'-F替代2'-OH导致登革热病毒和人类线粒体RNA聚合酶的底物均较差。代替2'氟化，发现在核糖4'位置引入氟并不会影响线粒体RNA聚合酶的吸收，从而抑制了登革病毒聚合酶的抑制。2'-C-乙炔基-4'

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2018.04.069
• 作为产物：
  描述：

  3',5'-O-(1,1,3,3-四异丙基-1,3-二硅氧烷)尿苷 在 正丁基锂 、 戴斯-马丁氧化剂 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 作用下， 以 四氢呋喃 、 正己烷 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 23.08h， 生成 1-((2R,3S,4R,5R)-3-ethynyl-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  基于尿苷的核苷氨基磷酸酯前药的结构-活性关系用于抑制登革热病毒RNA依赖性RNA聚合酶。

  摘要：

  为了鉴定登革热病毒依赖RNA的RNA聚合酶的有效和选择性核苷抑制剂，合成并评估了一系列2'-和/或4'-核糖修饰的尿苷核苷氨基磷酸酯前药及其相应的三磷酸酯。用2'-F替代2'-OH导致登革热病毒和人类线粒体RNA聚合酶的底物均较差。代替2'氟化，发现在核糖4'位置引入氟并不会影响线粒体RNA聚合酶的吸收，从而抑制了登革病毒聚合酶的抑制。2'-C-乙炔基-4'

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2018.04.069

文献信息

• [EN] COMPOSITIONS AND METHODS FOR DELIVERY OF THERAPEUTIC AGENTS<br/>[FR] COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS PERMETTANT D'ADMINISTRER DES AGENTS THÉRAPEUTIQUES
  申请人：MODERNATX INC

  公开号：WO2017099823A1

  公开（公告）日：2017-06-15

  This disclosure provides improved lipid-based compositions, including lipid nanoparticle compositions, and methods of use thereof for delivering agents in vivo including nucleic acids and proteins. These compositions are not subject to accelerated blood clearance and they have an improved toxicity profile in vivo.

  这项披露提供了改进的基于脂质的组合物，包括脂质纳米粒子组合物，以及它们用于体内传递药剂的方法，包括核酸和蛋白质。这些组合物不受加速血清清除的影响，并且它们在体内具有改进的毒性特性。
• 2'-Branched Nucleosides for Treatment of Viral Infections
  申请人：Novartis AG

  公开号：US20140065101A1

  公开（公告）日：2014-03-06

  The present invention provides a compound of formula I: or a pharmaceutically acceptable salt thereof, wherein R 1 is defined herein, which is a 2′-branched nucleoside useful for the treatment or prevention of viral infections, particularly dengue virus, yellow fever virus, West Nile virus, Japanese encephalitis virus, tick-borne encephalitis virus, Kunjin virus, Murray Valley encephalitis, St Louis encephalitis, Omsk hemorrhagic fever virus, bovine viral diarrhea virus, Zika virus and Hepatitis C virus.

  本发明提供了一种式I的化合物： 或其药学上可接受的盐，其中R 1 在此被定义，这是一种对治疗或预防病毒感染，特别是登革病毒、黄热病病毒、西尼罗河病毒、日本脑炎病毒、蜱传脑炎病毒、昆津病毒、默里谷炎病毒、圣路易斯炎病毒、鄂木斯克出血热病毒、牛病毒性腹泻病毒、寨卡病毒和丙型肝炎病毒有用的2′-支链核苷。
• Concise syntheses and HCV NS5B polymerase inhibition of (2′ R )-3 and (2′ S )-2′-ethynyluridine-10 and related nucleosides
  作者：Frank Bennett、Alexei V. Buevich、Hsueh-Cheng Huang、Vinay Girijavallabhan、Angela D. Kerekes、Yuhua Huang、Asra Malikzay、Elizabeth Smith、Eric Ferrari、Mary Senior、Rebecca Osterman、Lingyan Wang、Jun Wang、Haiyan Pu、Quang T. Truong、Paul Tawa、Stephane L. Bogen、Ian W. Davies、Ann E. Weber

  DOI：10.1016/j.bmcl.2017.06.064

  日期：2017.12

  (2′R)-Ethynyl uridine 3, and its (2′S)-diastereomer 10, are synthesised in a divergent fashion from the inexpensive parent nucleoside. Both nucleoside analogues are obtained from a total of 5 simple synthetic steps and 3 trivial column chromatography purifications. To evaluate their effectiveness against HCV NS5B polymerase, the nucleosides were converted to their respective 5′-O-triphosphates. Subsequently

  (2' R )-乙炔基尿苷3及其 (2' S )-非对映异构体10是由廉价的母体核苷以不同的方式合成的。两种核苷类似物均通过总共 5 个简单的合成步骤和 3 个简单的柱层析纯化获得。为了评估它们对 HCV NS5B 聚合酶的有效性，将核苷转化为它们各自的 5'-O-三磷酸。随后，这导致发现 2'-β-乙炔基18和 -丙炔基20核苷酸比索非布韦三磷酸24具有显着提高的效力。
• A Click Chemistry Approach to Pleuromutilin Conjugates with Nucleosides or Acyclic Nucleoside Derivatives and Their Binding to the Bacterial Ribosome
  作者：Line Lolk、Jacob Pøhlsgaard、Anne Sofie Jepsen、Lykke H. Hansen、Henrik Nielsen、Signe I. Steffansen、Laura Sparving、Annette B. Nielsen、Birte Vester、Poul Nielsen

  DOI：10.1021/jm800261u

  日期：2008.8.1

  Pleuromutilin and its derivatives are antibacterial drugs that inhibit protein synthesis in bacteria by binding to ribosomes. To promote rational design of pleuromutilin based drugs, 19 pleuromutilin conjugates with different nucleoside fragments as side chain extensions were synthesized by a click chemistry protocol. Binding was assessed by chemical footprinting of nucleotide U2506 in 23S rRNA, and

  截短侧耳素及其衍生物是通过与核糖体结合而抑制细菌中蛋白质合成的抗菌药物。为了促进基于截短侧耳素的药物的合理设计，通过点击化学方案合成了19种截短侧耳素作为侧链延伸的截短侧耳素缀合物。通过23S rRNA中核苷酸U2506的化学足迹评估结合，所有结合物均以不同程度结合，反映了其与肽基转移酶中心的结合亲和力。侧链延伸部分还在位置U2585处显示了各种保护。对具有最高亲和力的结合物的对接研究支持以下结论：尽管存在各种结合，截短侧耳素骨架仍在相同的结合袋中结合。共轭三唑部分的位置很好，核碱基位于50S核糖体亚基的不同口袋中。与截短侧耳素本身相比，具有最高亲和力和明显更好结合的衍生物包含与截短侧耳素C-22的腺嘌呤9-基丙烯三唑缀合物。
• [EN] MODIFIED NUCLEIC ACID MOLECULES AND USES THEREOF<br/>[FR] MOLÉCULES D'ACIDE NUCLÉIQUE MODIFIÉES ET LEURS UTILISATIONS
  申请人：MODERNA THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2014093924A1

  公开（公告）日：2014-06-19

  The present disclosure provides modified nucleosides, nucleotides, and nucleic acids, and methods of using them.

  本公开提供了经修改的核苷、核苷酸和核酸，以及它们的使用方法。