5-氯-1-[(2R,5S)-5-(羟基甲基)四氢呋喃-2-基]嘧啶-2,4-二酮 | 127592-40-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 中文名称: 5-氯-1-[(2R,5S)-5-(羟基甲基)四氢呋喃-2-基]嘧啶-2,4-二酮
• 英文名称: 2',3'-dideoxy-β-D-5-chlorouridine
• 英文别名: 2',3'-dideoxy-5-chlorouridine；5-chloro-2',3'-dideoxyuridine；Uridine, 5-chloro-2',3'-dideoxy-；5-chloro-1-[(2R,5S)-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 127592-40-9
• 化学式: C₉H₁₁ClN₂O₄
• 分子量: 246.65
• InChiKey: VMZOLVOHWONZSQ-CAHLUQPWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.2
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  78.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-氯-1-[(2R,5S)-5-(羟基甲基)四氢呋喃-2-基]嘧啶-2,4-二酮 生成 2',3'-dideoxy-5-chlorocytidine
  参考文献：
  名称：

  AERSCHOT, ARTHUR VAN;EVERAERT, DIRK;BALZARINI, JAN;AUGUSTYNS, KOEN;JIE, L+, J. MED. CHEM., 33,(1990) N, C. 1833-1839

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  (5S)-5-(hydroxymethyl)-2-oxo-tetrahydrofuran 在 咪唑 、 四丁基氟化铵 、 二氯乙基铝 、 二异丁基氢化铝 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 1,2-二氯乙烷 、 甲苯 为溶剂， 反应 32.75h， 生成 5-氯-1-[(2R,5S)-5-(羟基甲基)四氢呋喃-2-基]嘧啶-2,4-二酮
  参考文献：
  名称：

  对 LINE-1 迁移率具有抑制活性的 2,3-双脱氧-d-核糖衍生的嘧啶核苷的 NMR 研究

  摘要：

  嘧啶核苷类似物具有很高的药理学价值。它们显示出非常有用的抗 VIH、乙型肝炎病毒和抗癌活性的抗病毒活性，目前用于治疗这些疾病。鉴于其重要性，许多科学家修改了这些核苷类似物的结构，以寻求改善其特性、靶向特异性、功效并降低其毒性。由于这项研究，一些类似物被描述为具有改进的特性，其中包括源自 2,3-双脱氧-D-核糖的核苷，如齐多夫定 (AZT)、去羟肌苷 (ddI) 和扎西他滨 (ddC)。许多研究人员还研究了这些化合物的核磁共振谱。特别是，他们描述了异头构型对化合物中的 H 和 C NMR 信号的影响，例如，腺苷核苷或异核苷。作为我们抑制转座因子（如 LINE-1）研究的一部分，我们合成了（方案 1）18 种 2',3'-双脱氧核糖核苷性质的核苷类似物（化合物 1-18，图 1）及其相应的前体（化合物 19-36，图 2）和针对哺乳动物 LINE-1 逆转录转座的 1-18 检测，获得了非常

  DOI：

  10.1002/mrc.4942

文献信息

• Synthesis and Characterization of Specific Reverse Transcriptase Inhibitors for Mammalian LINE-1 Retrotransposons
  作者：Guillermo Banuelos-Sanchez、Laura Sanchez、Maria Benitez-Guijarro、Valentin Sanchez-Carnerero、Carmen Salvador-Palomeque、Pablo Tristan-Ramos、Meriem Benkaddour-Boumzaouad、Santiago Morell、Jose L. Garcia-Puche、Sara R. Heras、Francisco Franco-Montalban、Juan A. Tamayo、Jose L. Garcia-Perez

  DOI：10.1016/j.chembiol.2019.04.010

  日期：2019.8

  LINE-1-retroelements use different mechanisms for retrotransposition, although both involve the reverse transcription of an intermediate retroelement-derived RNA. Retrotransposon activity continues to effect the germline and somatic genomes, generating interindividual variability over evolution and potentially influencing cancer and brain physiology, respectively. However, relatively little is known about

  逆转座子是在哺乳动物基因组中扩增到惊人数量的一种可转座元件（TE），包括超过三分之一的人类和小鼠基因组。长时间散布的1类元素（LINE-1或L1）反转录转座子丰富，目前在人类和小鼠基因组中具有活跃的反转录元件。同样，两个基因组中都含有长末端重复序列（LTR）的逆转座子，尽管仅在小鼠中有活性。LTR和LINE-1-逆转录元件使用不同的逆转座子机制，尽管两者都涉及中间逆向元件衍生的RNA的逆转录。反转录转座子的活性继续影响种系和体细胞基因组，在进化过程中产生个体差异，并分别影响癌症和脑部生理。然而，关于逆转座的功能后果知之甚少。在这项研究中，我们已经合成和表征了针对哺乳动物LINE-1逆转座子的逆转录酶抑制剂，这可能有助于破译体内逆转座子的功能。
• Synthesis and anti-HIV evaluation of 2',3'-dideoxyribo-5-chloropyrimidine analogs: reduced toxicity of 5-chlorinated 2',3'-dideoxynucleosides
  作者：Arthur Van Aerschot、Dirk Everaert、Jan Balzarini、Koen Augustyns、Liu Jie、Gerard Janssen、Oswald Peeters、Norbert Blaton、Camiel De Ranter

  DOI：10.1021/jm00168a046

  日期：1990.6

  While chlorination of 2',3'-dideoxycytidine removed the anti-HIV activity, introduction of a chlorine at the C-5 position of 3'-fluoro-, 3'-azido- or 2',3'-didehydro-2',3'-dideoxycytidine led to reduced cytotoxicity with only slightly reduced anti-HIV activity. X-ray analysis showed compound 11 to have two molecules in the asymmetric unit with chi = -168.8 (3) degrees and -131.3 (3) degrees and P = 179

  鉴于2'，3'-dideoxy-3'-fluoro-5-chlorouridine（11）的选择性抗HIV活性，合成了8个2'，3'-dideoxy-5-chloropyrimidines并评估了它们对MT-4细胞中1型人类免疫缺陷病毒（HIV-1）复制的抑制活性。注意到2，3-二脱氧核糖呋喃糖，3-叠氮基-2，3-二脱氧核糖呋喃糖和3-氟-2，3-二脱氧核糖呋喃糖的5-氯尿嘧啶衍生物的选择性显着改善，这主要是由于该化合物对宿主细胞。虽然氯化2'，3'-二脱氧胞苷可消除抗HIV活性，但在3'-氟-，3'-叠氮基或2'，3'-二氢-2'的C-5位置引入了氯，3'-二脱氧胞苷导致细胞毒性降低，而抗HIV活性仅略微降低。X射线分析表明化合物11在不对称单元中具有两个分子，分别为chi = -168.8（3）度和-131.3（3）度，P = 179（1）度和163（1）度。因此显示与3'-叠氮基-3'-脱氧胸苷（AZT）没有相似之处。
• [EN] SYNTHESIS OF FLG<br/>[FR] SYNTHÈSE DE FLG
  申请人：MEDIVIR AB

  公开号：WO2012115578A1

  公开（公告）日：2012-08-30

  The present invention concerns the synthesis of substantially anomerically pure 2,3-dideoxy-3- fluoro-5-0-(4-phenylbenzoyl)-a-D-erythropentofuranosyl chloride from an α/β-mixture of the corresponding methyl glycoside. The method of the invention provides the pure a-chloride without the need of anomeric separation. The α-chloride thus achieved is suitable for use as glycosyl donor in the preparation of 2',3'-dideoxy-3'-fluoro nucleosides. In particular, the preparation of 2',3'-dideoxy-3 '-fluoroguanosine, FLG, using an α/β-mixture of the methyl glycoside without the need of anomeric separation is disclosed.

  本发明涉及从相应的甲基糖苷的α/β混合物中合成基本无旋异构体纯的2,3-二脱氧-3-氟-5-0-(4-苯基苯甲酰基)-α-D-赤血酮糖氯化物的方法。本发明的方法提供了纯的α-氯化物，无需进行旋异构分离。因此，所获得的α-氯化物适用于作为糖基供体用于制备2'，3'-二脱氧-3'-氟核苷。特别地，本发明揭示了使用甲基糖苷的α/β混合物而无需进行旋异构分离来制备2'，3'-二脱氧-3'-氟鸟嘌呤核苷（FLG）的方法。
• Inhibition of <i>Mycobacterium tuberculosis</i>, <i>Mycobacterium bovis</i>, and <i>Mycobacterium </i><i>avium</i> by Novel Dideoxy Nucleosides
  作者：Dinesh Rai、Monika Johar、Naveen C. Srivastav、Tracey Manning、B. Agrawal、Dennis Y. Kunimoto、Rakesh Kumar

  DOI：10.1021/jm070391t

  日期：2007.9.1

  The prevalence of tuberculosis (TB) and mutidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB) has been increasing, leading to serious infections, high mortality, and a global health threat. Here, we report the identification of a novel class of dideoxy nucleosides as potent and selective inhibitors of Mycobacterium bovis, Mycobacterium tuberculosis, and drug-resistant Mycobacterium tuberculosis. A series of 5-acetylenic derivatives of 2 ',3 '-dideoxyuridine (3-8) and 3 '-fluoro-2 ',3 '-dideoxyuridine (22-27) were synthesized and tested for their antimycobacterial activity against M. bovis, M. tuberculosis, and M. avium. 2 ',3 '-Dideoxyuridine possessing 5-decynyl, 5-dodecynyl, 5-tridecynyl, and 5-tetradecynyl substituents (4-7) exhibited the highest antimycobacterial activity against all three mycobacteria. In contrast, in the 3 '-fluoro-2 ',3 '-dideoxyuridine series, a 5-tetradecynyl analogue (26) displayed the most potent activity against these mycobacteria. Among other derivatives, 5-bromo-2',3'-dideoxycytidine (11), 5-methyl-2 ',3 '-dideoxycytidine (12). and 5-chloro-4-thio-2 ',3 '-dideoxyuridine (19) exhibited modest inhibition of M. bovis and M. tuberculosis. In the series of dideoxy derivatives of adenosine, guanosine, and purines, 2-amino-6-mercaptoethyl-9-(2,3-dideoxy-beta-D-glyceropentofuranosyl)purine (32) and 2-amino-4-fluoro-7-(2,3-dideoxy-beta-D-glyceropentofuranosyl)pyrrolo[2,3-d]pyrimidine (35) were the most efficacious against M. bovis and M. tuberculosis, and All. avium, respectively.
• AERSCHOT, ARTHUR VAN;EVERAERT, DIRK;BALZARINI, JAN;AUGUSTYNS, KOEN;JIE, L+, J. MED. CHEM., 33,(1990) N, C. 1833-1839
  作者：AERSCHOT, ARTHUR VAN、EVERAERT, DIRK、BALZARINI, JAN、AUGUSTYNS, KOEN、JIE, L+

  DOI：——

  日期：——