Bromodomains (BRDs) are epigenetic readers that recognize acetylated-lysine (KAc) on proteins and are implicated in a number of diseases. We describe a virtual screening approach to identify BRD inhibitors. Key elements of this approach are the extensive design and use of substructure queries to compile a set of commercially available compounds featuring novel putative KAc mimetics and docking this
溴结构域 (BRD) 是表观遗传阅读器,可识别蛋白质上的乙酰化赖
氨酸 (KAc),并与许多疾病有关。我们描述了一种虚拟筛选方法来识别 BRD
抑制剂。这种方法的关键要素是广泛设计和使用子结构查询来编译一组具有新型推定 KAc 模拟物的市售化合物,并将该组对接以进行最终化合物选择。我们通过将其应用于 BR
D4 的第一个 BRD 来描述该方法的验证。对 143 种化合物的选择和测试导致发现了六种新的热门产品,其中包括四种前所未有的 KAc 模拟物。我们解决了四个命中的晶体结构,确定了它们的结合模式,并通过合成和购买衍
生物提高了它们的效力。