Fragment-Based Discovery of Novel Non-Hydroxamate LpxC Inhibitors with Antibacterial Activity
作者:Yousuke Yamada、Hajime Takashima、David Lee Walmsley、Fumihito Ushiyama、Yohei Matsuda、Harumi Kanazawa、Toru Yamaguchi-Sasaki、Nozomi Tanaka-Yamamoto、Junya Yamagishi、Risa Kurimoto-Tsuruta、Yuya Ogata、Norikazu Ohtake、Hayley Angove、Lisa Baker、Richard Harris、Alba Macias、Alan Robertson、Allan Surgenor、Hayato Watanabe、Koichiro Nakano、Masashi Mima、Kunihiko Iwamoto、Atsushi Okada、Iichiro Takata、Kosuke Hitaka、Akihiro Tanaka、Kiyoko Fujita、Hiroyuki Sugiyama、Roderick E. Hubbard
DOI:10.1021/acs.jmedchem.0c01215
日期:2020.12.10
deacetylase (LpxC) is a zinc metalloenzyme that catalyzes the first committed step in the biosynthesis of Lipid A, an essential component of the cell envelope of Gram-negative bacteria. The most advanced, disclosed LpxC inhibitors showing antibacterial activity coordinate zinc through a hydroxamate moiety with concerns about binding to other metalloenzymes. Here, we describe the discovery, optimization, and
UDP-3- O-酰基-N-乙酰氨基葡糖脱乙酰基酶(LpxC)是一种锌金属酶,可催化脂质A(革兰氏阴性细菌细胞包膜的重要组成部分)生物合成中的第一步。显示出抗菌活性的最先进,公开的LpxC抑制剂可通过异羟肟酸酯部分协调锌,并考虑与其他金属酶的结合。在这里,我们描述了衍生自具有不同锌螯合模式的片段的两个系列化合物的发现,优化和功效。从甘氨酸部分与锌复合的片段演化出一系列,该片段在酶功能测定中的纳摩尔浓度较低,但对细胞培养的抗菌活性较弱。第二系列基于通过咪唑部分螯合锌的片段。结构导向的设计导致2-(1S-羟乙基)-咪唑衍生物对铜绿假单胞菌表现出对LpxC的低纳摩尔抑制作用和4μg/ mL的最小抑制浓度(MIC),受白蛋白的影响很小。