Design and Synthesis of Novel Macrocyclic Derivatives as Potent and Selective Cyclin-Dependent Kinase 7 Inhibitors
作者:Pengpeng Niu、Yanxin Tao、Guohao Lin、Huiqi Xu、Qingyuan Meng、Kang Yang、Weixue Huang、Meiru Song、Ke Ding、Dawei Ma、Mengyang Fan
DOI:10.1021/acs.jmedchem.3c01832
日期:2024.4.25
we detail the design and synthesis of a series of macrocyclic derivatives with pyrazolo[1,5-a]-1,3,5-triazine core structure as potent and selective CDK7 inhibitors. The diverse manners of macrocyclization led to distinguished selectivity profiles of the CDK family. Molecular dynamics (MD) simulation explained the binding difference between 15- and 16-membered macrocyclic compounds. Further optimization
细胞周期蛋白依赖性激酶7(CDK7)的功能(细胞周期调节和基因转录)的双重性使其成为有吸引力的肿瘤学靶点,CDK7抑制剂的发现一直是学术界和制药公司的长期追求。然而,由于 ATP 结合口袋之间的相似性,实现选择性先导化合物仍然很困难。在此,我们详细介绍了一系列具有吡唑并[1,5- a ]-1,3,5-三嗪核心结构的大环衍生物的设计和合成,作为有效的选择性CDK7抑制剂。大环化的不同方式导致了 CDK 家族的独特选择性特征。分子动力学 (MD) 模拟解释了15 元和16 元大环化合物之间的结合差异。进一步优化产生的化合物37表现出良好的 CDK7 抑制活性和比其他 CDK 更高的选择性。这项工作清楚地证明了大环化是一种微调小分子选择性曲线的通用方法,MD 模拟可以成为确定大环设计优先顺序的宝贵工具。