UDP-2,3-bis[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]-alpha-D-glucosamine | 90293-60-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: UDP-2,3-bis[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]-alpha-D-glucosamine
• 英文别名: [(2R,3R,4R,5S,6R)-2-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-[[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]amino]oxan-4-yl] (3R)-3-hydroxytetradecanoate
• CAS: 90293-60-0
• 化学式: C₄₃H₇₇N₃O₂₀P₂
• 分子量: 1018.04
• InChiKey: KOJCFMYSTWNMQW-RUAJDYCTSA-N

物化性质

• 密度：
  1.37±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  甲醇（微溶）、水（微溶）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.3
• 重原子数：
  68
• 可旋转键数：
  36
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.86
• 拓扑面积：
  347
• 氢给体数：
  10
• 氢受体数：
  20

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  UDP-2,3-bis[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]-alpha-D-glucosamine 在 wild type UDP-diacylglucosamine pyrophosphatase from Escherichia coli C-terminally fused with mCherry 、 水 、 bovine serum albumin 作用下， 以 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 2-脱氧-3-O-[(3R)-3-羟基十四烷酰基]-2-{[(3R)-3-羟基十四烷酰基]氨基}-1-O-膦酰-alpha-D-吡喃葡萄糖
  参考文献：
  名称：

  UDP-二酰基葡萄糖胺焦磷酸酶 LpxH 的底物结合帽具有高度灵活性，可轻松实现底物结合和产物释放。

  摘要：

  革兰氏阴性细菌被次生膜包围，其外层由糖脂脂多糖 (LPS) 组成，可防止疏水性毒素，包括许多抗生素。因此，细菌中脂多糖的合成是抗生素开发的一个有吸引力的目标。LpxH 是一种参与 LPS 合成的焦磷酸酶，之前的结构表明 LpxH 具有与其脂质底物结合的螺旋帽。在这里，晶体学和氢-氘交换 MS 为 LpxH 中高度灵活的底物结合帽提供了证据。此外，分子动力学模拟揭示了帽的螺旋如何打开以允许基质进入。LpxH 变体的活性测定支持了预测的开放机制。最后，我们从生化角度证实了 LpxH 受到先前鉴定的抗菌化合物的抑制，确定了该抑制剂的效力，并模拟了其在 LpxH 活性位点的结合模式。总之，我们的工作提供了证据，证明 LpxH 的底物结合帽是高度动态的，从而允许在加帽螺旋之间轻松进行底物结合和产物释放。我们的结果也为合理设计更有效的 LpxH 抑制剂铺平了道路。

  DOI：

  10.1074/jbc.ra118.002503

文献信息

• C-Glycosidic analogs of lipid A and lipid X: synthesis and biological activities
  作者：Hermann Vyplel、Dieter Scholz、Ingolf Macher、Karl Schindlmaier、Eberhard Schuetze

  DOI：10.1021/jm00113a013

  日期：1991.9

  The synthesis of a series of novel analogues of lipid A, the lipophilic terminal of lipopolysaccharides (LPS), and lipid X, the reducing monosaccharide unit in lipid A, is reported. In these compounds, the native 1-O-phosphate group has been replaced by a "bioisosteric" CH2COOH substituent. The new N,O-acylated monosaccharide C-glycosides were obtained by Wittig reaction of suitably protected glucosamine

  据报道，合成了一系列脂质A（脂多糖（LPS）的亲脂性末端）和脂质X（脂质A中的还原单糖单元）的新型类似物。在这些化合物中，天然的1-O-磷酸基团已被“生物等位” CH2COOH取代基取代。通过适当保护的葡糖胺衍生物的Wittig反应获得新的N，O-酰化的单糖C-糖苷。这些脂质X类似物被脂质A合酶识别为底物，并且可以与UDP-脂质X偶联，以制备规模提供脂质A前体的相应二糖类似物。所有化合物均通过NMR，MS和元素分析进行​​了表征，并测试了它们增强对小鼠感染的非特异性抵抗力的能力以及内毒素。结果清楚地表明，新化合物的生物活性与其O-磷酸化的天然对应物相似。此外，这些化合物在小鼠模型中显示出比从马尾流产沙门氏菌获得的标准LPS更好的治疗指数。
• Synthesis of fluorinated analogues of lipid A
  作者：Hermann Vyplel、Dieter Scholz、Hans Loibner、Michael Kern、Karl Bednarik、Hans Schaller

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)91596-x

  日期：1992.3

  In order to study structure-activity relationships of lipid A derivatives, a series of fluorinated analogues of lipid X was synthesized. Subsequently, these were converted enzymatically into the corresponding disccaharidic lipid A analogues using lipid A synthase. This further demonstrates the low substrate specificity of this enzyme.

  为了研究脂质A衍生物的构效关系，合成了一系列脂质X的氟化类似物。随后，使用脂质A合酶将它们酶促转化为相应的盘硬脂酸脂质A类似物。这进一步证明了该酶的低底物特异性。