5-(2-氨基-6-氧代-3H-嘌呤-9-基)戊酸 | 149298-99-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 中文名称: 5-(2-氨基-6-氧代-3H-嘌呤-9-基)戊酸
• 英文名称: 9-guaninepentanoic acid
• 英文别名: 5-(2-Amino-6-oxo-3,6-dihydro-9H-purin-9-yl)pentanoic acid；5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)pentanoic acid
• CAS: 149298-99-7
• 化学式: C₁₀H₁₃N₅O₃
• 分子量: 251.245
• InChiKey: FBOBYAOBUGYMOT-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.67±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  123
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-氨基癸烷 、 5-(2-氨基-6-氧代-3H-嘌呤-9-基)戊酸 在 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以32%的产率得到9-N-[4-(decylcarbamoyl)butyl]guanine
  参考文献：
  名称：

  亲脂鸟嘌呤N-9衍生物的合成：膜锚定的核糖核酸酶适合脂肪酸囊泡。

  摘要：

  软物质结构的共价或非共价表面功能化是定制其功能和稳定性的重要工具。功能化的表面和纳米颗粒已在药物输送和诊断中发现了许多应用，并且自下而上的系统化学领域正在不断开发新的功能化化学。极性功能分子（例如分子识别剂）与软物质结构的缔合可以通过烷基链衍生化来实现，从而允许非共价锚定到两亲性膜中。我们报告了五种新的鸟嘌呤-N9衍生物的合成，这些衍生物带有带有不同连接化学的烷基链，并利用一种可以灵活选择疏水锚部分的合成途径。在这项研究中，用于插入癸酸双层结构的10条链，其中烷基链长度和附着化学性质决定了它们与膜的相互作用。这些鸟嘌呤共轭物以固体形式与癸酸囊泡悬浮液温育，表明与直接与N-9连接的饱和烷基锚定物相比，与醚和三唑连接的C 10锚定物增加了鸟嘌呤衍生物在膜相中的分配。 。癸酸囊泡膜可装载至多5.5 mol％鸟嘌呤衍生物，比以前的限值增加了6倍。因此，与双层的亲水性表面表现出有利相互作用的锚化学物质可以显着增加结构官能化的程度。

  DOI：

  10.1021/acs.bioconjchem.7b00228
• 作为产物：
  描述：

  2-N-acetyl-9-N’-4’-carbmethoxybutyl-6-O-diphenylcarbamoylguanine 在 水 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 以56%的产率得到5-(2-氨基-6-氧代-3H-嘌呤-9-基)戊酸
  参考文献：
  名称：

  针对流感聚合酶PB2帽结合域的新7-甲基鸟嘌呤衍生物

  摘要：

  异三聚体流感病毒聚合酶在感染细胞的核内执行病毒RNA的复制和转录。通过“帽捕捉”进行转录需要宿主细胞前mRNA通过其5'帽与PB2亚基结合。因此，PB2帽结合位点可能是直接抑制病毒复制的新抗病毒药物的良好靶标。使用PB2帽结合结构域的结构的对接研究表明，在N -9和N -2位置取代的7-烷基鸟嘌呤衍生物可能是不错的选择。合成了四个系列的7,9-二-和2,7,9-三烷基鸟嘌呤衍生物，并通过AlphaScreen分析与生物素化帽类似物竞争进行了评估。三种合成的化合物具有IC 50的强大体外活性值低于10μM。与H5N1 PB2帽结合结构域复合的三种抑制剂的高分辨率X射线结构证实了结合模式，并为进一步的化合物优化提供了详细信息。

  DOI：

  10.1021/jm401369y

文献信息

• Synthesis and Some Spectroscopic Properties of Porphyrin Derivatives Connected with Nucleobases (Adenine, Thymine, Guanine and Cytosine) by Alkanamide Chains.
  作者：Masao HISATOME、Noriaki MARUYAMA、Koichi IKEDA、Tetsuo FURUTERA、Tomiyasu ISHIKAWA、Koji YAMAKAWA

  DOI：10.1248/cpb.44.1801

  日期：——

  Several kinds of porphyrin derivatives covalently connected with adenine, thymine, guanine, cytosine or adenine-thymine pair in a stacking mode between the porphyrin and nucleobase moiety have been synthesized via amide formation reaction of (2-aminophenyl)porphyrin derivatives with nucleobase-alkanoic acids, and characterized by spectroscopic methods. In the 1H-NMR spectra of these nucleobase-porphyrins the proton signals of the nucleobase moieties appear at remarkably higher fields than those of the reference compounds (the corresponding nucleobase-alkanoates) which have no porphyrin moiety. The behaviors of the high field shifts, due to the diamagnetic ring current effect of the porphyrin ring, reflect the characteristic conformational features of these compounds in which the base moieties are located at the upper zone of the porphyrin ring. The Soret bands of the porphyrin in the electronic absorption spectra were markedly weaker in intensity compared with those of the reference compound which has no nucleobase moiety. Both the high-field shifts of the base protons and the hypochromic effects on the Soret band are larger in guanine and cytosine systems than those in adenine and thymine systems, respectively.Those results indicate greater affinity of guanine and cytosine for porphyrin in comparison with adenine and cytosine, respectively, and this conclusion is compatible with the reported electronic spectral properties of mixtures of polynucleotides and water-soluble porphyrin derivatives.

  几种通过(2-氨基苯基)卟啉衍生物与核苷酸-烷酸通过酰胺形成反应共价连接的卟啉衍生物已被合成，这些核苷酸包括腺嘌呤、胸腺嘧啶、鸟嘌呤、胞嘧啶或腺嘌呤-胸腺嘧啶对，并且以堆叠模式与卟啉和核苷酸部分相连。合成的化合物通过光谱方法进行了表征。在这些核苷酸-卟啉的1H-NMR光谱中，核苷酸部分的质子信号出现在明显高于参考化合物（对应的核苷酸-烷酸酯，也没有卟啉部分）的化学位移位置。这种高场位移的行为源于卟啉环的抗磁环流效应，反映了这些化合物的特征构象特征，其中碱基部分位于卟啉环的上方。在电子吸收光谱中，卟啉的索雷特带的强度明显弱于不含核苷酸部分的参考化合物。与腺嘌呤和胸腺嘧啶系统相比，鸟嘌呤和胞嘧啶系统中的碱基质子的高场位移和对索雷特带的弱化效应更为显著。这些结果表明，与腺嘌呤和胸腺嘧啶相比，鸟嘌呤和胞嘧啶对卟啉有更强的亲和力，这一结论与已报道的聚核苷酸和水溶性卟啉衍生物混合物的电子光谱特性相符。
• Hisatome, Masao; Maruyama, Noriaki; Ikeda, Koichi, Heterocycles, 1993, vol. 36, # 3, p. 441 - 444
  作者：Hisatome, Masao、Maruyama, Noriaki、Ikeda, Koichi、Yamakawa, Koji

  DOI：——

  日期：——
• Synthesis of Lipophilic Guanine N-9 Derivatives: Membrane Anchoring of Nucleobases Tailored to Fatty Acid Vesicles
  作者：Michael C. Wamberg、Pernille L. Pedersen、Philipp M. G. Löffler、Anders N. Albertsen、Sarah E. Maurer、Kent A. Nielsen、Pierre-Alain Monnard

  DOI：10.1021/acs.bioconjchem.7b00228

  日期：2017.7.19

  membranes. We report the synthesis of five new guanine–N9 derivatives bearing alkyl chains with different attachment chemistries, exploiting a synthesis pathway that allows a flexible choice of hydrophobic anchor moiety. In this study, these guanine derivatives were functionalized with C10 chains for insertion into decanoic acid bilayer structures, in which both alkyl chain length and attachment chemistry

  软物质结构的共价或非共价表面功能化是定制其功能和稳定性的重要工具。功能化的表面和纳米颗粒已在药物输送和诊断中发现了许多应用，并且自下而上的系统化学领域正在不断开发新的功能化化学。极性功能分子（例如分子识别剂）与软物质结构的缔合可以通过烷基链衍生化来实现，从而允许非共价锚定到两亲性膜中。我们报告了五种新的鸟嘌呤-N9衍生物的合成，这些衍生物带有带有不同连接化学的烷基链，并利用一种可以灵活选择疏水锚部分的合成途径。在这项研究中，用于插入癸酸双层结构的10条链，其中烷基链长度和附着化学性质决定了它们与膜的相互作用。这些鸟嘌呤共轭物以固体形式与癸酸囊泡悬浮液温育，表明与直接与N-9连接的饱和烷基锚定物相比，与醚和三唑连接的C 10锚定物增加了鸟嘌呤衍生物在膜相中的分配。 。癸酸囊泡膜可装载至多5.5 mol％鸟嘌呤衍生物，比以前的限值增加了6倍。因此，与双层的亲水性表面表现出有利相互作用的锚化学物质可以显着增加结构官能化的程度。
• New 7-Methylguanine Derivatives Targeting the Influenza Polymerase PB2 Cap-Binding Domain
  作者：Stéphane Pautus、Peter Sehr、Joe Lewis、Antoine Fortuné、Andrea Wolkerstorfer、Oliver Szolar、Delphine Guilligay、Thomas Lunardi、Jean-Luc Décout、Stephen Cusack

  DOI：10.1021/jm401369y

  日期：2013.11.14

  directly inhibit viral replication. Docking studies using the structure of the PB2 cap-binding domain suggested that 7-alkylguanine derivatives substituted at position N-9 and N-2 could be good candidates. Four series of 7,9-di- and 2,7,9-trialkyl guanine derivatives were synthesized and evaluated by an AlphaScreen assay in competition with a biotinylated cap analogue. Three synthesized compounds display

  异三聚体流感病毒聚合酶在感染细胞的核内执行病毒RNA的复制和转录。通过“帽捕捉”进行转录需要宿主细胞前mRNA通过其5'帽与PB2亚基结合。因此，PB2帽结合位点可能是直接抑制病毒复制的新抗病毒药物的良好靶标。使用PB2帽结合结构域的结构的对接研究表明，在N -9和N -2位置取代的7-烷基鸟嘌呤衍生物可能是不错的选择。合成了四个系列的7,9-二-和2,7,9-三烷基鸟嘌呤衍生物，并通过AlphaScreen分析与生物素化帽类似物竞争进行了评估。三种合成的化合物具有IC 50的强大体外活性值低于10μM。与H5N1 PB2帽结合结构域复合的三种抑制剂的高分辨率X射线结构证实了结合模式，并为进一步的化合物优化提供了详细信息。