4-(3,8-diamino-5-methylphenanthridin-5-ium-6-yl)-N-[4-[[2-[[[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-[(2R,3S,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxyphosphoryl]amino]acetyl]amino]butyl]benzamide | 79999-70-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 4-(3,8-diamino-5-methylphenanthridin-5-ium-6-yl)-N-[4-[[2-[[[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-[(2R,3S,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxyphosphoryl]amino]acetyl]amino]butyl]benzamide
• CAS: 79999-70-5
• 化学式: C₄₇H₅₆N₁₀O₁₃P
• 分子量: 999.995
• InChiKey: BBNCNEJSQVDDIP-YZRSQCKOSA-O

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.02
• 重原子数：
  71.0
• 可旋转键数：
  18.0
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  330.32
• 氢给体数：
  9.0
• 氢受体数：
  17.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)胸苷 在 吡啶 、 1H-1,2,3-三氮唑 、 2-chlorophenylphosphorochloridite 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 反应 84.0h， 生成 4-(3,8-diamino-5-methylphenanthridin-5-ium-6-yl)-N-[4-[[2-[[[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-[(2R,3S,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxyphosphoryl]amino]acetyl]amino]butyl]benzamide
  参考文献：
  名称：

  Selectivity in binding a phenanthridinium-dinucleotide derivative to homopolynucleotides

  摘要：

  DOI：

  10.1021/ja00414a086