(3R)-4-benzylthio-3-(N-tert-butyloxycarbonyl)aminopropionaldehyde | 118546-67-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: (3R)-4-benzylthio-3-(N-tert-butyloxycarbonyl)aminopropionaldehyde
• 英文别名: 3-benzylthio-2-(N-tert-butyloxycarbonyl)aminopropionaldehyde；(R)-tert-butyl (1-(benzylthio)-3-oxopropan-2-yl)carbamate；tert-butyl (R)-(1-(benzylthio)-3-oxopropan-2-yl)carbamate；N-Boc-Cys(Bzl)-H；S-benzyl-Boc-cysteinal；((R)-2-Benzylsulfanyl-1-formyl-ethyl)-carbamic acid tert-butyl ester；tert-butyl N-[(2R)-1-benzylsulfanyl-3-oxopropan-2-yl]carbamate
• CAS: 118546-67-1
• 化学式: C₁₅H₂₁NO₃S
• 分子量: 295.403
• InChiKey: BVWMROSCGYTJLB-CYBMUJFWSA-N

物化性质

• 沸点：
  425.1±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.128±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  80.7
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3R)-4-benzylthio-3-(N-tert-butyloxycarbonyl)aminopropionaldehyde 在 sodium cyanoborohydride 、 溶剂黄146 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 (2S)-N-[(2R)-1-(benzylsulfanyl)-3-(5-fluoro-2,3-dihydro-1H-indol-1-yl)propan-2-yl]-4-cyclohexyl-2-[(3-methoxyphenyl)formamido]butanamide
  参考文献：
  名称：

  Arylaminoethyl amides as noncovalent inhibitors of cathepsin S. Part 2: Optimization of P1 and N-aryl

  摘要：

  A systematic study of anilines led to the discovery of a metabolically robust fluoroindoline replacement for the alkoxy aniline toxicophore in 1. Investigations of the PI pocket resulted in the discovery of a wide tolerance of functionality leading to the discovery of 11 as a potent and selective inhibitor of cathepsin S. (C) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2005.12.056
• 作为产物：
  描述：

  Boc-S-苄基-L-半光氨酸 在 lithium aluminium tetrahydride 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 乙醚 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 12.75h， 生成 (3R)-4-benzylthio-3-(N-tert-butyloxycarbonyl)aminopropionaldehyde
  参考文献：
  名称：

  氟乙烯基砜和-磺酸盐作为锥体半胱氨酸蛋白酶 Rhodesain 的强效共价可逆抑制剂：结构-活性关系、抑制机制、代谢和体内研究

  摘要：

  Rhodesain 是罗得西亚布氏锥虫的主要半胱氨酸蛋白酶，这是一种导致人类非洲锥虫病的病原体，也是一个经过验证的药物靶点。最近，我们报道了 α-卤乙烯基砜作为一类新的共价可逆半胱氨酸蛋白酶抑制剂的发展。在这里，α-氟乙烯基砜/-磺酸盐基于分子建模方法针对罗得沙因进行了优化。2d是该系列中最有效和选择性的抑制剂，对哺乳动物组织蛋白酶 B 和 L 显示出个位数的纳摩尔亲和力和高选择性。酶稀释测定和 MS 实验表明2d是一种慢紧结合剂 ( K i = 3 nM ）。此外，非氟化 2d-(H)通过腹膜内和口服给药后在小鼠脑组织中的积累显示出良好的代谢和生物分布。对于具有 N 末端 2,3-二氢苯并[ b ][1,4]二恶英基团和 P2 ( 2e / 4e ) 中的 4-Me-Phe 残基的抑制剂，观察到最高的抗锥虫活性，具有纳摩尔 EC 50值 (0.14 /0.80 微米）。使用 QM/MM 计算和

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.1c01002

文献信息

• Fluorovinylsulfones and -Sulfonates as Potent Covalent Reversible Inhibitors of the Trypanosomal Cysteine Protease Rhodesain: Structure–Activity Relationship, Inhibition Mechanism, Metabolism, and In Vivo Studies
  作者：Sascha Jung、Natalie Fuchs、Patrick Johe、Annika Wagner、Erika Diehl、Tri Yuliani、Collin Zimmer、Fabian Barthels、Robert A. Zimmermann、Philipp Klein、Waldemar Waigel、Jessica Meyr、Till Opatz、Stefan Tenzer、Ute Distler、Hans-Joachim Räder、Christian Kersten、Bernd Engels、Ute A. Hellmich、Jochen Klein、Tanja Schirmeister

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.1c01002

  日期：2021.8.26

  Rhodesain is a major cysteine protease of Trypanosoma brucei rhodesiense, a pathogen causing Human African Trypanosomiasis, and a validated drug target. Recently, we reported the development of α-halovinylsulfones as a new class of covalent reversible cysteine protease inhibitors. Here, α-fluorovinylsulfones/-sulfonates were optimized for rhodesain based on molecular modeling approaches. 2d, the most

  Rhodesain 是罗得西亚布氏锥虫的主要半胱氨酸蛋白酶，这是一种导致人类非洲锥虫病的病原体，也是一个经过验证的药物靶点。最近，我们报道了 α-卤乙烯基砜作为一类新的共价可逆半胱氨酸蛋白酶抑制剂的发展。在这里，α-氟乙烯基砜/-磺酸盐基于分子建模方法针对罗得沙因进行了优化。2d是该系列中最有效和选择性的抑制剂，对哺乳动物组织蛋白酶 B 和 L 显示出个位数的纳摩尔亲和力和高选择性。酶稀释测定和 MS 实验表明2d是一种慢紧结合剂 ( K i = 3 nM ）。此外，非氟化 2d-(H)通过腹膜内和口服给药后在小鼠脑组织中的积累显示出良好的代谢和生物分布。对于具有 N 末端 2,3-二氢苯并[ b ][1,4]二恶英基团和 P2 ( 2e / 4e ) 中的 4-Me-Phe 残基的抑制剂，观察到最高的抗锥虫活性，具有纳摩尔 EC 50值 (0.14 /0.80 微米）。使用 QM/MM 计算和
• Total synthesis of (+)-kalkitoxinElectronic supplementary information (ESI) available: experimental procedures and spectroscopic data. See http://www.rsc.org/suppdata/cc/b3/b306124h/
  作者：James D. White、Chang-Sun Lee、Qing Xu

  DOI：10.1039/b306124h

  日期：——

  The neurotoxic lipopeptide (+)-kalkitoxin was synthesized by a route which employed asymmetric organocopper conjugate addition followed by in situ enolate alkylation to install the anti,anti-1,2,4-trimethyl relationship of the toxin; the synthesis of kalkitoxin required sixteen steps and proceeded in 3% overall yield.

  神经毒素脂肽 (+)-kalkitoxin 的合成使用了不对称有机铜共轭加成的方法，随后通过原位烯醇盐烷基化来建立毒素的反反-1,2,4-三甲基关系；kalkitoxin 的合成总共需要十六个步骤，最终的总体产率为3%。
• Total synthesis and biological evaluation of (+)-kalkitoxin, a cytotoxic metabolite of the cyanobacterium Lyngbya majusculaElectronic supplementary information (ESI) available: 1H NMR spectrum of synthetic (+)-kalkitoxin in C6D6. See http://www.rsc.org/suppdata/ob/b4/b404205k/
  作者：James D. White、Qing Xu、Chang-Sun Lee、Frederick A. Valeriote

  DOI：10.1039/b404205k

  日期：——

  +-Kalkitoxin, a metabolite of the marine cyanobacterium Lyngbya majuscula, was synthesized from (R)-2-methylbutyric acid, (R)-cysteine, and (3S, 4S, 6S)-3,4,6-trimethyl-8-(methylamino)octanoic acid. A key step in the synthesis was installation of the anti,anti methyl stereotriad by means of a tandem asymmetric conjugate addition of an organocopper species to an alpha,beta-unsaturated N-acyl oxazolidin-2-one

  由（R）-2-甲基丁酸，（R）-半胱氨酸和（3S，4S，6S）-3,4,6-三甲基-8- （甲基氨基）辛酸。合成中的关键步骤是通过将有机铜物种串联不对称共轭加成到α，β-不饱和N-酰基恶唑烷-2--2-上，然后原位通过α-甲基化来安装抗，反甲基立体三联体。产生的烯醇。烷基毒素的噻唑啉部分是通过四氯化钛催化的乙烯基取代的酰胺基硫醇的环化反应组装的。
• Exploration of the P1 SAR of aldehyde cathepsin K inhibitors
  作者：John G. Catalano、David N. Deaton、Eric S. Furfine、Annie M. Hassell、Robert B. McFadyen、Aaron B. Miller、Larry R. Miller、Lisa M. Shewchuk、Derril H. Willard、Lois L. Wright

  DOI：10.1016/j.bmcl.2003.09.088

  日期：2004.1

  The synthesis and biological activity of a series of aldehyde inhibitors of cathepsin K are reported. Exploration of the properties of the S(1) subsite with a series of alpha-amino aldehyde derivatives substituted at the P(1) position afforded compounds with cathepsin K IC(50)s between 52 microM and 15 nM.
• Design and Synthesis of Activity-Based Probes and Inhibitors for Bleomycin Hydrolase
  作者：Wouter A. van der Linden、Ehud Segal、Matthew A. Child、Anna Byzia、Marcin Drąg、Matthew Bogyo

  DOI：10.1016/j.chembiol.2015.07.010

  日期：2015.8

  Bleomycin hydrolase (BLMH) is a neutral cysteine aminopeptidase that has been ascribed roles in many physiological and pathological processes, yet its primary biological function remains enigmatic. In this work, we describe the results of screening of a library of fluorogenic substrates to identify non-natural amino acids that are optimally recognized by BLMH. This screen identified several substrates with k(cat)/K-M values that are substantially improved over the previously reported fluorogenic substrates for this enzyme. The substrate sequences were used to design activity-based probes that showed potent labeling of recombinant BLMH as well as endogenously expressed BLMH in cell extracts, and in intact cells. Importantly, we identify potent BLMH inhibitors that are able to fully inhibit endogenous BLMH activity in intact cells. These probes and inhibitors will be valuable new reagents to study BLMH function in cellular and animal models of human diseases where BLMH is likely to be involved.