(E)-methyl 5-(aminomethyl)-2-((2-((2,2-dimethyl-4-oxo-3,8,11,14-tetraoxa-5-azahexadecan-16-yl)oxy)-4-hydroxyphenyl)diazenyl)benzoate | 1474019-94-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: (E)-methyl 5-(aminomethyl)-2-((2-((2,2-dimethyl-4-oxo-3,8,11,14-tetraoxa-5-azahexadecan-16-yl)oxy)-4-hydroxyphenyl)diazenyl)benzoate
• CAS: 1474019-94-7
• 化学式: C₂₈H₄₀N₄O₉
• 分子量: 576.647
• InChiKey: YECMEQPNYYZIQE-QNEJGDQOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.01
• 重原子数：
  41.0
• 可旋转键数：
  17.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  172.52
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (E)-methyl 5-(aminomethyl)-2-((2-((2,2-dimethyl-4-oxo-3,8,11,14-tetraoxa-5-azahexadecan-16-yl)oxy)-4-hydroxyphenyl)diazenyl)benzoate 在 水 、 三乙胺 、 lithium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 19.0h， 生成 5-((5-((4-(1,2,4,5-tetrazin-3-yl)benzyl)amino)-5-oxopentanamido)methyl)-2-((E)-(4-hydroxy-2-((13-oxo-17-((4S)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)-3,6,9-trioxa-12-azaheptadecyl)oxy)phenyl)diazenyl)benzoic acid
  参考文献：
  名称：

  用生物正交方法识别活细胞中未知的药物靶点

  摘要：

  描述了一种从活细胞中拉下二级药物靶点的蛋白质组学方法。目标药物用反式环辛烯 (TCO)修饰并与活细胞一起孵育。细胞裂解后，与蛋白质结合的修饰药物使用装饰有可切割四嗪修饰接头的磁珠下拉。然后在 SDS-PAGE 凝胶上运行样品，并将分离的条带提交用于质谱分析以确定药物靶点。

  DOI：

  10.1002/anie.201304096
• 作为产物：
  描述：

  (E)-methyl 5-(((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)methyl)-2-((2-((2,2-dimethyl-4-oxo-3,8,11,14-tetraoxa-5-azahexadecan-16-yl)oxy)-4-hydroxyphenyl)diazenyl)benzoate 在 哌啶 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.0h， 以75%的产率得到(E)-methyl 5-(aminomethyl)-2-((2-((2,2-dimethyl-4-oxo-3,8,11,14-tetraoxa-5-azahexadecan-16-yl)oxy)-4-hydroxyphenyl)diazenyl)benzoate
  参考文献：
  名称：

  用生物正交方法识别活细胞中未知的药物靶点

  摘要：

  描述了一种从活细胞中拉下二级药物靶点的蛋白质组学方法。目标药物用反式环辛烯 (TCO)修饰并与活细胞一起孵育。细胞裂解后，与蛋白质结合的修饰药物使用装饰有可切割四嗪修饰接头的磁珠下拉。然后在 SDS-PAGE 凝胶上运行样品，并将分离的条带提交用于质谱分析以确定药物靶点。

  DOI：

  10.1002/anie.201304096