5-(5,6-dimethyl-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)-1-(4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione | 1425795-63-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-(5,6-dimethyl-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)-1-(4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• 英文别名: 5-(5,6-dimethyl-1H-benzimidazol-2-yl)-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1425795-63-6
• 化学式: C₁₈H₂₀N₄O₅
• 分子量: 372.381
• InChiKey: STLMINGGYFVKOP-RRFJBIMHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.4
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  128
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-脱氧尿苷 在 三乙胺 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 106.08h， 生成 5-(5,6-dimethyl-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)-1-(4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and spectroscopic properties of fluorescent 5-benzimidazolyl-2′-deoxyuridines 5-fdU probes obtained from o-phenylenediamine derivatives

  摘要：

  合成了具有理想荧光量子产率（Φ）的荧光核苷（dUbmz），其来源于几乎不发光的5-fdU和邻苯二胺衍生物。这些核苷的荧光对pH值和有机溶剂相当敏感。4-甲氧基苯-1,2-二胺被用于在天然核苷中检测5-fdU。

  DOI：

  10.1039/c3ob27519a

文献信息

• Synthesis and spectroscopic properties of fluorescent 5-benzimidazolyl-2′-deoxyuridines 5-fdU probes obtained from o-phenylenediamine derivatives
  作者：Pu Guo、Xiaowei Xu、Xiaoyu Qiu、Yimin Zhou、Shengyong Yan、Changcheng Wang、Chunjiang Lu、Wen Ma、Xiaocheng Weng、Xianzheng Zhang、Xiang Zhou

  DOI：10.1039/c3ob27519a

  日期：——

  Fluorescent nucleosides (dUbmz) with desirable fluorescence quantum yield (Φ) are synthesized from almost non-fluorescent 5-fdU and o-phenylenediamine derivatives. The fluorescence of these nucleosides is quite sensitive to pH and organic solvents. 4-Methoxybenzene-1,2-diamine was used for the detection of 5-fdU among natural nucleosides.

  合成了具有理想荧光量子产率（Φ）的荧光核苷（dUbmz），其来源于几乎不发光的5-fdU和邻苯二胺衍生物。这些核苷的荧光对pH值和有机溶剂相当敏感。4-甲氧基苯-1,2-二胺被用于在天然核苷中检测5-fdU。