2'-deoxy-5-(1,2-dihydroxyethyl)uridine | 100635-00-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 2'-deoxy-5-(1,2-dihydroxyethyl)uridine
• 英文别名: Uridine, 2'-deoxy-5-(1-hydroxy-2-methoxyethyl)-；5-(1,2-dihydroxyethyl)-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 100635-00-5
• 化学式: C₁₁H₁₆N₂O₇
• 分子量: 288.257
• InChiKey: HBEZJIPJVVECAF-KKVHJZIVSA-N

物化性质

• 密度：
  1.624±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.5
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  140
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-deoxy-5-(1,2-dihydroxyethyl)uridine 在 sodium periodate 、 水 作用下， 生成 1-((2R,4S,5R)-4-羟基-5-(羟基甲基)四氢呋喃-2-基)-2,4-二氧代-1,2,3,4-四氢嘧啶-5-甲醛
  参考文献：
  名称：

  Introduction of 5-Formyl-2′-deoxyuridine into a κB Site: Critical Discrimination of a Base Structure in the Major Groove by NFκB p50 Homodimer

  摘要：

  合成了四种寡核苷酸 26-单体，其中包括在δB 位点用 5-甲酰基-2′-脱氧尿苷代替胸苷。其中一种寡核苷酸 26-mers 与 NFκB p50 同源二聚体的结合具有重要的鉴别作用。

  DOI：

  10.1055/s-1999-3084
• 作为产物：
  描述：

  3',5'-bis-(O-tert-butyldimethylsilyl)-5-vinyl-2'-deoxyuridine 在 四氧化锇 、 N-甲基吲哚酮 、 四丁基氟化铵 、 水 作用下， 以 丙酮 、 叔丁醇 为溶剂， 生成 2'-deoxy-5-(1,2-dihydroxyethyl)uridine
  参考文献：
  名称：

  Introduction of 5-Formyl-2′-deoxyuridine into a κB Site: Critical Discrimination of a Base Structure in the Major Groove by NFκB p50 Homodimer

  摘要：

  合成了四种寡核苷酸 26-单体，其中包括在δB 位点用 5-甲酰基-2′-脱氧尿苷代替胸苷。其中一种寡核苷酸 26-mers 与 NFκB p50 同源二聚体的结合具有重要的鉴别作用。

  DOI：

  10.1055/s-1999-3084

文献信息

• Jones, A. Stanley; Slater, Martin J.; Walker, Richard T., Journal of the Chemical Society. Perkin transactions I, 1987, p. 1325 - 1330
  作者：Jones, A. Stanley、Slater, Martin J.、Walker, Richard T.

  DOI：——

  日期：——
• JONES, A. STANLEY;SLATER, MARTIN J.;WALKER, RICHARD T., J. CHEM. SOC. PERKIN TRANS., 1,(1987) N 6, 1325-1329
  作者：JONES, A. STANLEY、SLATER, MARTIN J.、WALKER, RICHARD T.

  DOI：——

  日期：——
• Introduction of 5-Formyl-2′-deoxyuridine into a κB Site: Critical Discrimination of a Base Structure in the Major Groove by NFκB p50 Homodimer
  作者：Atsushi Kittaka、Chikafumi Horii、Tetsuya Kuze、Takashi Asakura、Katsutoshi Ito、Kazuo T. Nakamura、Tadashi Miyasaka、Jun-ichiro Inoue

  DOI：10.1055/s-1999-3084

  日期：——

  Four kinds of oligonucleotide 26-mers including 5-formyl-2′-deoxyuridine in place of thymidine at the κB site were synthesized. One of the oligonucleotide 26-mers was critically discriminated by the NFκB p50 homodimer in binding.

  合成了四种寡核苷酸 26-单体，其中包括在δB 位点用 5-甲酰基-2′-脱氧尿苷代替胸苷。其中一种寡核苷酸 26-mers 与 NFκB p50 同源二聚体的结合具有重要的鉴别作用。