1-β-D-ribofuranosyl-6-(hydroxymethyl)uracil | 76222-53-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-β-D-ribofuranosyl-6-(hydroxymethyl)uracil
• 英文别名: 6-(hydroxymethyl)uridine；6-hydroxymethyluridine；1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-6-(hydroxymethyl)pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 76222-53-2
• 化学式: C₁₀H₁₄N₂O₇
• 分子量: 274.23
• InChiKey: BKTDWKYNCNBGBC-ZOQUXTDFSA-N

物化性质

• 密度：
  1.689±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.2
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  140
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-β-D-ribofuranosyl-6-(hydroxymethyl)uracil 在 盐酸 、 column of BioRex 70 作用下， 生成 6-(羟基甲基)尿嘧啶 、 alpha-D-呋喃核糖
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of 6-substituted uridines. synthesis of (R or S)-6-(3-amino-2-carboxypropyl)uridine

  摘要：

  DOI：

  10.1016/s0008-6215(00)84560-7
• 作为产物：
  描述：

  6-甲基尿苷 在 甲醇 、 4-二甲氨基吡啶 、 selenium(IV) oxide 、 氨 、 tetrabutylammonium borohydride 、 溶剂黄146 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 氯仿 为溶剂， 反应 23.0h， 生成 1-β-D-ribofuranosyl-6-(hydroxymethyl)uracil
  参考文献：
  名称：

  尿苷的6-取代和5,6-二取代衍生物：立体选择性合成，与尿苷磷酸化酶的相互作用以及体外抗肿瘤活性。

  摘要：

  描述了通过路易斯酸催化的（a）三甲基硅烷化的6-烷基-4-烷基硫尿嘧啶与1-O-乙酰基-2,3,5-三-O-苯甲酰基-β-的缩合反应合成6-烷基尿苷的立体选择程序。 D-核呋喃糖（ABR）和（b）三甲基甲硅烷基化的6-烷基-3-苄基尿嘧啶与ABR。随后通过使用配合物BBr3-THF的新的改性方法，使用1N三氟乙酸除去4-甲硫基，并除去3-苄基。此外，通过依次用SeO 2氧化并用四丁基硼氢化铵还原6-甲基尿苷（5）获得6-（羟甲基）尿苷（39）和5-氟-6-（羟甲基）尿苷（40）。分别通过39和40的DAST处理，获得了5-氟-6-甲基尿苷和3-氟-6-甲基尿苷（35），以及它们相应的6-氟甲基同源物41和42。对于前述关于糖基键的固定顺式构象的所有核苷，1 H NMR光谱进一步证实戊糖环主要存在于构象N（3'-内）。大多数核苷是大肠杆菌嘧啶核苷磷酸化酶的弱底物。其中两个39和41具有6-C

  DOI：

  10.1021/jm950675q

文献信息

• “Umpulong” of reactivity at the C-6 position of uridine: a simple and general method for 6-substituted uridines
  作者：Hiromichi Tanaka、Hiroyuki Hayakawa、Tadashi Miyasaka

  DOI：10.1016/0040-4020(82)80016-1

  日期：——

  the ribose moiety in the 6-functionalized products were concurrently removed under mild conditions with aqueous trifluoroacetic acid. Consequently, the present method permits simple and general syntheses of 6-substituted uridines.

  发现锂化的2'，3'-O-异丙基-5'-甲氧基甲基-尿苷与多种亲电试剂在C-6位置上区域特异性地反应。在温和条件下用三氟乙酸水溶液同时除去6-官能化产物中核糖部分的保护基。因此，本发明方法可以简单且通用地合成6-取代的尿苷。
• Oligonucleotide Analogues with a‘Nucleobase-Including Backbone’. Part 10
  作者：Andrew John Matthews、Punit Kumar Bhardwaj、Andrea Vasella

  DOI：10.1002/hlca.200490204

  日期：2004.9

  fully deprotected dimer 32 proved insufficiently soluble in CDCl3. This observation strongly evidences that structural differentiation of oligonucleotides and their analogues into backbone and nucleobases is not required for pairing. The dinucleotide analogues were prepared by O-alkylation of C(8)-unsubstituted or of C(8)-oxymethylated, partially protected adenosines by the C(6)-mesyloxy- or C(6)-halomethylated

  的二核苷类似物24，25，28 - 30，和33在CDCl准3溶液。由尿苷部分的HN（3）的浓度依赖性化学位移和热力学参数确定的缔合常数为265 M -1（33）至3220 M -1（30）。CDCl 3中的31缔合太强而无法确定（与浓度无关的δ（HN（3））约为12.8 ppm），并且完全脱保护的二聚体32被证明不足以溶于CDCl 3。该观察结果有力证明配对不需要寡核苷酸及其类似物结构分化为骨架和核碱基。通过制备的二核苷酸类似物Ô烷基化的C（8）未被取代的或C（8） -oxymethylated，部分保护的腺苷由C（6） -mesyloxy-或C（6） -halomethylated尿苷20 - 22，随后通过部分或全部脱保护。
• Synthesis of 6-substituted uridines. synthesis of (R or S)-6-(3-amino-2-carboxypropyl)uridine
  作者：Alex Rosenthal、Robert H. Dodd

  DOI：10.1016/s0008-6215(00)84560-7

  日期：1980.10
• 6-Substituted and 5,6-Disubstituted Derivatives of Uridine:  Stereoselective Synthesis, Interaction with Uridine Phosphorylase, and <i>in Vitro</i> Antitumor Activity
  作者：Krzysztof Felczak、Alicja K. Drabikowska、Juhani A. Vilpo、Tadeusz Kulikowski、David Shugar

  DOI：10.1021/jm950675q

  日期：1996.1.1

  hydrogen bond with the enzyme. The 5-fluoro-6-substituted uridines were the poorest substrates. Cytotoxicities of the nucleosides were examined vs the human tumor cell lines MOLT-3, U-937, K-562, and IM-9, as well as PHA-stimulated human lymphocytes. Two of the analogues, 5-fluoro-6-(fluoromethyl)uridine (42) and 5-fluoro-6-(hydroxymethyl)uridine (40), exhibited cytotoxicities comparable to that of 5-fluorouracil

  描述了通过路易斯酸催化的（a）三甲基硅烷化的6-烷基-4-烷基硫尿嘧啶与1-O-乙酰基-2,3,5-三-O-苯甲酰基-β-的缩合反应合成6-烷基尿苷的立体选择程序。 D-核呋喃糖（ABR）和（b）三甲基甲硅烷基化的6-烷基-3-苄基尿嘧啶与ABR。随后通过使用配合物BBr3-THF的新的改性方法，使用1N三氟乙酸除去4-甲硫基，并除去3-苄基。此外，通过依次用SeO 2氧化并用四丁基硼氢化铵还原6-甲基尿苷（5）获得6-（羟甲基）尿苷（39）和5-氟-6-（羟甲基）尿苷（40）。分别通过39和40的DAST处理，获得了5-氟-6-甲基尿苷和3-氟-6-甲基尿苷（35），以及它们相应的6-氟甲基同源物41和42。对于前述关于糖基键的固定顺式构象的所有核苷，1 H NMR光谱进一步证实戊糖环主要存在于构象N（3'-内）。大多数核苷是大肠杆菌嘧啶核苷磷酸化酶的弱底物。其中两个39和41具有6-C