(L)-2((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-8-oxodecanoic acid | 874384-17-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: (L)-2((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-8-oxodecanoic acid
• 英文别名: (S)-2((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-8-oxodecanoic acid；(S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-8-oxodecanoic acid；(2S)-2-[(9-fluorenylmethoxycarbonyl)amino]-8-oxodecanoic acid；N-Fmoc-(S)-2-amino-8-oxo-decanoic acid；(S)-N-Fmoc-Aoda-OH；Fmoc-L-Aod-OH；(2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-8-oxodecanoic acid
• CAS: 874384-17-5
• 化学式: C₂₅H₂₉NO₅
• 分子量: 423.509
• InChiKey: VZUGNTASEYEWLC-QHCPKHFHSA-N

物化性质

• 熔点：
  108-109 °C
• 沸点：
  671.7±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.191±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.4
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  92.7
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (L)-2((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-8-oxodecanoic acid 生成 (2S)-2-氨基-8-氧代癸酸
  参考文献：
  名称：

  Montero, Ana; Beierle, John M.; Olsen, Christian A., Journal of the American Chemical Society, 2009, vol. 131, p. 3033 - 3041

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  6-溴己酸 在 8-羟基喹啉 、 草酰氯 、 potassium carbonate 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 乙醚 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 72.0h， 生成 (L)-2((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-8-oxodecanoic acid
  参考文献：
  名称：

  使用掺锌结合基团的Fmoc氨基酸合成HDAC底物拟肽抑制剂

  摘要：

  制备具有锌结合基团的Fmoc氨基酸的合成，并使用Fmoc / t Bu固相肽合成（SPPS）将其掺入底物抑制剂H3K27肽中。使用Fmoc-Asu（NHO t Bu）-OH制备的肽11是核心NuRD核心加压复合物（HDAC1-MTA1-RBBP4）的有效抑制剂（IC 50 = 390 nM）。在寻找选择性HDAC抑制剂的过程中，Fmoc氨基酸具有促进快速制备底物拟肽抑制剂（SPI）库的潜力。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.9b00885

文献信息

• [EN] FMOC PROTECTED (2S)-2-AMINO-8-[(1,1-DIMETHYLETHOXY)AMINO]-8-OXO-OCTANOIC ACID, (S)-2-AMINO-8-OXONONANOIC ACID AND (S)-2-AMINO-8-OXODECANOIC ACID FOR PEPTIDE SYNTHESIS<br/>[FR] ACIDE (2S)-2-AMINO-8-[(1,1-DIMÉTHYLÉTHOXY)AMINO]-8-OXO-OCTANOÏQUE, ACIDE (S)-2-AMINO-8-OXONONANOÏQUE ET ACIDE (S)-2-AMINO-8-OXODECANOÏQUE À PROTECTION FMOC POUR LA SYNTHÈSE DE PEPTIDES
  申请人：THE UNIV COURT OF THE UNIVERISTY OF GLASGOW

  公开号：WO2019219938A1

  公开（公告）日：2019-11-21

  The invention discloses Fmoc protected (2S)-2-amino-8-[(1,1- dimethylethoxy)amino]-8-oxo-octanoic acid, (S)-2-amino-8- oxononanoic acid and (S)-2-amino-8-oxodecanoic acid for use in peptide synthesis, such as solid phase synthesis, as well as the peptide H3K27 (Ac-Lys-Ala-Ala-Arg-Aox-Ser-Ala-NH2) prepared from Fmoc protected (2S)-2-amino-8-[(1,1-dimethylethoxy)amino]-8-oxo-octanoic acid (Aox). These three exemplary compounds as well as their unprotected forms are claimed in the form of four generic formulae. The first of these four formulae is (formula (I)) where -NPro is a protected amino group, such as an amino group protected with a base-labile protecting group, -L- is alkylene, heteroalkylene, arylene or aralkylene, -X- is a covalent bond, -N(H) - or -N(RN)-, where -RN is alkyl, -R2 is hydrogen or alkyl, -R3 is alkyl, such as C2-10 alkyl, or heterocyclyl, and -LAA- and -R1 are as defined in the claims.

  该发明揭示了用于肽合成的Fmoc保护(2S)-2-氨基-8-[(1,1-二甲基乙氧基)氨基]-8-氧代辛酸、(S)-2-氨基-8-氧代壬酸和(S)-2-氨基-8-氧代癸酸，例如固相合成，以及从Fmoc保护的(2S)-2-氨基-8-[(1,1-二甲基乙氧基)氨基]-8-氧代辛酸(Aox)制备的肽H3K27(Ac-Lys-ALA-ALA-Arg-Aox-Ser-ALA-NH2)。这三种示范性化合物及其未保护形式以四种通用式的形式声明。这四种式中的第一种式（式(I)）是其中-NPro是受保护的氨基基团，例如用碱敏感保护基保护的氨基基团，-L-是烷基，杂原子烷基，芳基或芳基烷基，-X-是共价键，-N(H)-或-N(RN)-，其中-RN是烷基，-R2是氢或烷基，-R3是烷基，例如C2-10烷基，或杂环烷基，-LAA-和-R1如索引中所定义。
• Discovery of Potent and Selective Histone Deacetylase Inhibitors via Focused Combinatorial Libraries of Cyclic α₃β-Tetrapeptides
  作者：Christian A. Olsen、M. Reza Ghadiri

  DOI：10.1021/jm900850t

  日期：2009.12.10

  libraries to the discovery of potent HDAC ligands using a convenient screening platform. Our studies led to the first HDAC6-selective cyclic tetrapeptide analogue, which extends the use of cyclic tetrapeptides to the class II HDAC isoforms. These findings highlight the persistent potential of cyclic tetrapeptides as epigenetic modulators and possible anticancer drug lead compounds.

  组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 抑制剂是了解表观遗传调控的有力工具，已被证明在治疗各种癌症方面特别有前途，但发现有效的、异构体选择性 HDAC 抑制剂一直是一项重大挑战。我们最近开发了一种环状 α 3 β-四肽支架，用于制备具有新型选择性特征的 HDAC 抑制剂（J. Am. Chem. Soc. 2009 , 131 , 3033）。在这项研究中，我们通过合成阐述这个支架相对于侧链多样性一个-珠-一个-化合物环四肽类似物的组合文库，并使用方便的筛选平台将这些集中文库的两代应用于发现有效的 HDAC 配体。我们的研究导致了第一个 HDAC6 选择性环状四肽类似物，它将环状四肽的使用扩展到 II 类 HDAC 同种型。这些发现突出了环状四肽作为表观遗传调节剂和可能的抗癌药物先导化合物的持久潜力。
• Synthesis of <scp>l</scp><i>-</i>2-Amino-8-oxodecanoic Acid: An Amino Acid Component of Apicidins
  作者：Ramón Alajarín、Julio Alvarez-Builla、M. Linares、F. Agejas、J. Vaquero

  DOI：10.1055/s-2006-942395

  日期：2006.6

  The synthesis of L-2-amino-8-oxodecanoic acid (Aoda) is described. This is a rare amino acid component of apicidins, a family of new cyclic tetrapeptides, inhibitors of histone deacetylase. Aoda was synthesised in seven steps from L-glutamic acid, along with some derivatives.

  描述了 L-2-氨基-8-氧代癸酸 (Aoda) 的合成。这是一种稀有的氨基酸成分，是一种新的环状四肽家族，是组蛋白脱乙酰酶的抑制剂。Aoda 是由 L-谷氨酸和一些衍生物分七个步骤合成的。
• Macrocyclic Peptoid–Peptide Hybrids as Inhibitors of Class I Histone Deacetylases
  作者：Christian A. Olsen、Ana Montero、Luke J. Leman、M. Reza Ghadiri

  DOI：10.1021/ml300162r

  日期：2012.9.13

  We report the design, synthesis, and biological evaluation of the first macrocyclic peptoid-containing histone deacetylase (HDAC) inhibitors. The compounds selectively inhibit human class I HDAC isoforms in vitro, with no inhibition of the tubulin deacetylase activity associated with class IIb HDAC6 in cultured Jurkat cells. Compared to the natural product apicidin (1), one inhibitor (compound 10) showed equivalent potency against K-562 cells, but was more cytoselective across a panel of cancer cell lines.
• Synthesis of 2-Amino-8-oxodecanoic Acids (Aodas) Present in Natural Hystone Deacetylase Inhibitors
  作者：Manuela Rodriquez、Ines Bruno、Elena Cini、Mauro Marchetti、Maurizio Taddei、Luigi Gomez-Paloma

  DOI：10.1021/jo0518250

  日期：2006.1.1

  Differently substituted 2-amino-8-oxodecanoic acids (Aodas), present in naturally occurring inhibitors of hystone deacetylase (HDAC), have been prepared using a convergent approach. The configuration in position 2 was derived from enantiomerically pure allylglycine or glutamic acid, whereas the stereochemistry of the substituent in position 9 derived from lactic acid or glyceraldehyde derivatives. Starting from allylglycine, (S)-Aodas, protected at the nitrogen as Boc or Fmoc, were obtained in four steps in about 30% overall yield. These products have been used to prepare a simplified analogue of a natural cyclic tetrapeptide HDAC inhibitor by SPPS.