5'-O-levulinyl-3'-O-tert-butyldimethylsilyl-N4-(6-hydroxyhexyl)-5-methyl-2'-deoxycytidine | 942223-83-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5'-O-levulinyl-3'-O-tert-butyldimethylsilyl-N4-(6-hydroxyhexyl)-5-methyl-2'-deoxycytidine
• 英文别名: 5'-O-levulinyl-3'-O-tert-butyldimethylsilyl-N⁴-(6-hydroxyhexyl)-5-methyl-2'-deoxycytidine
• CAS: 942223-83-8
• 化学式: C₂₇H₄₇N₃O₇Si
• 分子量: 553.772
• InChiKey: FWMUZWHQCGIAFK-YTFSRNRJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.11
• 重原子数：
  38.0
• 可旋转键数：
  15.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.78
• 拓扑面积：
  128.98
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-levulinyl-3'-O-tert-butyldimethylsilyl-N4-(6-hydroxyhexyl)-5-methyl-2'-deoxycytidine 在 4-二甲氨基吡啶 、 四丁基氟化铵 、 溶剂黄146 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 为溶剂， 反应 10.0h， 生成 [(2R,3S,5R)-5-[4-[6-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]hexylamino]-5-methyl-2-oxopyrimidin-1-yl]-3-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]methyl 4-oxopentanoate
  参考文献：
  名称：

  新的分支DNA构建体。

  摘要：

  DNA的Watson-Crick碱基配对是一种有利的现象，当将DNA用作纳米级物体的定向自组织支架时，可以利用该现象。文献中出现了一些报道，描述了具有可变数量的臂的支链DNA（bDNA）的产生，这些臂自组装成预先设计的架构。这些bDNA单元是通过巧妙设计的刚性交叉DNA分子生成的。或者，可以使用衍生自核苷或非核苷构件的合成分支点生成bDNA。几乎没有研究过将支链DNA用于纳米技术或从自组装的角度进行研究。在此，我们希望报告合成，表征，以及能够产生线性和环状bDNA构建体的不对称bDNA分子的组装特性。我们产生bDNA的策略是基于利用新的保护基团策略的分支点。bDNA单元是通过自动DNA合成方法生成的，并通过化学和生物学技术被用于生成新的对象。生成的实体可能是基于DNA的纳米生物技术的有用构建基块。

  DOI：

  10.1002/chem.200601473
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-levulinyl-3'-O-tert-butyldimethylsilylthymidine 在 三乙胺 、 三氯氧磷 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 4.75h， 生成 5'-O-levulinyl-3'-O-tert-butyldimethylsilyl-N4-(6-hydroxyhexyl)-5-methyl-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  新的分支DNA构建体。

  摘要：

  DNA的Watson-Crick碱基配对是一种有利的现象，当将DNA用作纳米级物体的定向自组织支架时，可以利用该现象。文献中出现了一些报道，描述了具有可变数量的臂的支链DNA（bDNA）的产生，这些臂自组装成预先设计的架构。这些bDNA单元是通过巧妙设计的刚性交叉DNA分子生成的。或者，可以使用衍生自核苷或非核苷构件的合成分支点生成bDNA。几乎没有研究过将支链DNA用于纳米技术或从自组装的角度进行研究。在此，我们希望报告合成，表征，以及能够产生线性和环状bDNA构建体的不对称bDNA分子的组装特性。我们产生bDNA的策略是基于利用新的保护基团策略的分支点。bDNA单元是通过自动DNA合成方法生成的，并通过化学和生物学技术被用于生成新的对象。生成的实体可能是基于DNA的纳米生物技术的有用构建基块。

  DOI：

  10.1002/chem.200601473