Design, synthesis, and biological evaluation of novel dipeptide-type SARS-CoV 3CL protease inhibitors: Structure–activity relationship study
作者:Pillaiyar Thanigaimalai、Sho Konno、Takehito Yamamoto、Yuji Koiwai、Akihiro Taguchi、Kentaro Takayama、Fumika Yakushiji、Kenichi Akaji、Yoshiaki Kiso、Yuko Kawasaki、Shen-En Chen、Aurash Naser-Tavakolian、Arne Schön、Ernesto Freire、Yoshio Hayashi
DOI:10.1016/j.ejmech.2013.05.005
日期:2013.7
work describes the design, synthesis, and evaluation of low-molecular weight peptidic SARS-CoV 3CL protease inhibitors. The inhibitors were designed based on the potent tripeptidic Z-Val-Leu-Ala(pyrrolidone-3-yl)-2-benzothiazole (8; Ki = 4.1 nM), in which the P3 valine unit was substituted with a variety of distinct moieties. The resulting series of dipeptide-type inhibitors displayed moderate to good
这项工作描述了低分子量肽 SARS-CoV 3CL 蛋白酶抑制剂的设计、合成和评估。抑制剂的设计基于有效的三肽 Z-Val-Leu-Ala(pyrrolidone-3-yl)-2-benzothiazole ( 8 ; Ki = 4.1 nM),其中 P3 缬氨酸单元被多种不同的部分。所得系列二肽型抑制剂对 3CL pro表现出中等至良好的抑制活性。特别是,化合物26m和26n对K i表现出良好的抑制活性。值分别为 0.39 和 0.33 μM。这些低分子量化合物对于进一步开发具有药物特性的强效肽模拟物抑制剂具有吸引力。进行了对接研究以模拟化合物26m与 SARS-CoV 3CL 蛋白酶的结合相互作用。对具有强效抑制活性的拟肽化合物的初步 SAR 研究揭示了几个提高抑制活性的结构特征:(i)在 S1' 位置的苯并噻唑弹头,(ii)在 S1 位置的 γ-内酰胺单元,(iii ) S2-位的适当疏水亮氨酸部分,和