DMTr[CG]AZMB | 1222078-44-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物
• 英文名称: DMTr[CG]AZMB
• CAS: 1222078-44-5
• 化学式: C₇₅H₈₅ClN₁₁O₁₇PSi₂
• 分子量: 1535.16
• InChiKey: ZHPKHNUUUDCAIO-FAGXKHPYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  14.47
• 重原子数：
  107.0
• 可旋转键数：
  28.0
• 环数：
  11.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  341.09
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  23.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  DMTr[CG]AZMB 在 甲酸 作用下， 以 氯仿 为溶剂， 反应 0.5h， 以79.1%的产率得到OH-[CG]AZMB
  参考文献：
  名称：

  METHOD FOR PREPARING OLIGONUCLEOTIDE

  摘要：

  一种制备寡核苷酸的方法，包括在液体反应介质中，将化合物式（1）与化合物式（2）在缩合反应条件下反应，以获得化合物式（3）。根据本发明的方法，通过适当的保护基保护功能基团，仅暴露化合物式（1）的5'-OH（OH组分）和化合物式（2）的3'-磷酸酯（P组分），这两者将被连接，从而在液体反应介质中进行缩合反应，将OH组分和P组分连接以获得DNA或RNA短链。本发明的方法不需要固相柱，并且可以在液体反应介质中进行。因此，寡核苷酸可以大规模合成。

  公开号：

  US20110237786A1
• 作为产物：
  描述：

  (2R,3R,4R,5R)-5-(2-acetamido-6-oxo-3,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-yl 2-(azidomethyl)benzoate 、 5'-O-DMTr-2'-O-TBDMS-N-Bz-cytidine -3'-O-(2-chlorophenyl)phosphate triethylammonium salt 在 吡啶 、 苯甲基-2-磺酰三硝基三氮唑 、 四乙基溴化铵 、 水 作用下， 反应 3.5h， 以56.4%的产率得到DMTr[CG]AZMB
  参考文献：
  名称：

  METHOD FOR PREPARING OLIGONUCLEOTIDE

  摘要：

  一种制备寡核苷酸的方法，包括在液体反应介质中，将化合物式（1）与化合物式（2）在缩合反应条件下反应，以获得化合物式（3）。根据本发明的方法，通过适当的保护基保护功能基团，仅暴露化合物式（1）的5'-OH（OH组分）和化合物式（2）的3'-磷酸酯（P组分），这两者将被连接，从而在液体反应介质中进行缩合反应，将OH组分和P组分连接以获得DNA或RNA短链。本发明的方法不需要固相柱，并且可以在液体反应介质中进行。因此，寡核苷酸可以大规模合成。

  公开号：

  US20110237786A1