| 120725-11-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• CAS: 120725-11-3
• 化学式: C₂₆H₃₀N₂O₄S
• 分子量: 466.601
• InChiKey: ROKIZBWHQKSEHQ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.51
• 重原子数：
  33.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  80.52
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  4.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  、 3-(4-carboxybutyl)-N-(4-sulfobutyl)-2,3,5-trimethylindolenyne 生成
  参考文献：
  名称：

  New indodicarbocyanine dyes for the biological microchip technology

  摘要：

  为寻找生物微芯片技术中最有效的荧光标记物，合成了吲哚碳菁染料，其吲哚啉部分的3位带有羧丁基，环的5位和7位分别带有甲基和磺酸基。染料的吸收和荧光最大值位置、分子总电荷以及水溶性取决于甲基和磺酸基的位置和总量。测定了所合成染料的光谱特性，并在激发波长为635nm和655nm，发射波长为670nm和690nm时，分别测量了等浓度染料的相对荧光效率。

  DOI：

  10.1134/s1068162008010184
• 作为产物：
  描述：

  1-(4-磺基丁基)-2,3,3-三甲基吲哚鎓内盐 、 N-((1E,2E)-3-(phenylamino)allylidene)benzenaminium chloride 、 乙酰氯 在 乙酸酐 作用下， 反应 2.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  新型不对称吲哚二羰花青染料

  摘要：

  获得了在吲哚啉系统的第 5 位官能化的新型吲哚二羰花青染料，并通过光谱方法对其进行了表征。

  DOI：

  10.1007/s11172-007-0356-x

文献信息

• Water-soluble cyanine dyes for biological microchip technology
  作者：V. E. Kuznetsova、T. A. Luk’yanova、V. A. Vasiliskov、O. V. Kharitonova、A. V. Chudinov、A. S. Zasedatelev

  DOI：10.1007/s11172-007-0387-3

  日期：2007.12

  Novel indodicarbocyanine dyes were obtained and their spectroscopic characteristics were determined. For equal concentrations of the dyes, the relative fluorescence efficiency was measured at the excitation wavelengths λ = 635 and 655 nm and the emission wavelengths λ = 670 and 690 nm, respectively.

  新型吲哚二碳菁染料被合成，并测定了它们的谱学特性。对于等浓度的染料，在激发波长 λ = 635 nm 和 655 nm，以及发射波长 λ = 670 nm 和 690 nm 处，分别测量了相对荧光效率。
• Simple reagent for the synthesis of oligonucleotides labeled with 3,3,3′,3′-tetramethyl-2,2′-indodicarbocyanine
  作者：M. V. Kvach、S. V. Gontarev、I. A. Prokhorenko、I. A. Stepanova、V. V. Shmanai、V. A. Korshun

  DOI：10.1007/s11172-006-0230-2

  日期：2006.1

  Synthesis of a phosphoramidite reagent for the preparation of oligonucleotides labeled at the 5′-end with a fluorescent dye, 3,3,3′,3′-tetramethyl-2,2′-indodicarbocyanine, is described. The efficiency of this reagent is confirmed by the synthesis of several labeled oligonucleotides.

  描述了一种磷酰胺试剂的合成，用于制备在5′-末端标记荧光染料3,3,3′,3′-四甲基-2,2′-吲哚二羧氰的寡核苷酸。通过合成几种标记的寡核苷酸确认了该试剂的有效性。
• An activator-induced quencher-detachment-based turn-on probe with a cationic substrate moiety for acetylcholinesterase
  作者：Masahiro Oe、Koji Miki、Akito Masuda、Kohei Nogita、Kouichi Ohe

  DOI：10.1039/d1cc05132f

  日期：——

  We report a choline ester-grafted turn-on fluorescence probe to detect acetylcholinesterase (AChE) in living cells. The AChE-mediated hydrolysis of the choline ester moiety producing carboxylate initiates the activation of the Cy5 fluorophore quenched by an intramolecular nucleophilic mercapto group. The probe has the advantages of high AChE affinity and low cytotoxicity.

  我们报告了一种胆碱酯接枝开启荧光探针来检测活细胞中的乙酰胆碱酯酶 (AChE)。AChE 介导的胆碱酯部分水解产生羧酸盐引发了由分子内亲核巯基猝灭的 Cy5 荧光团的活化。该探针具有高AChE亲和力和低细胞毒性的优点。
• Synthesis, properties and bioconjugation of water-soluble asymmetric indodicarbocyanine dyes
  作者：Viktoriya E. Kuznetsova、Vadim A. Vasiliskov、Aleksandr S. Zasedatelev、Aleksandr V. Chudinov

  DOI：10.1016/j.mencom.2008.05.009

  日期：2008.5

  New indodicarbocyanine dyes have been synthesised and converted into succinimidyl active esters for the fluorescent labeling of proteins and oligonucleotides.