methyl (2S)-2-[(2,5-dichlorobenzoyl)amino]-3-(1H-indol-3-yl)propanoate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: methyl (2S)-2-[(2,5-dichlorobenzoyl)amino]-3-(1H-indol-3-yl)propanoate
• 化学式: C₁₉H₁₆Cl₂N₂O₃
• 分子量: 391.254
• InChiKey: ISHPPFBFKZLKJW-KRWDZBQOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.99
• 重原子数：
  26.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.16
• 拓扑面积：
  71.19
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  3.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (2S)-2-[(2,5-dichlorobenzoyl)amino]-3-(1H-indol-3-yl)propanoate 在 盐酸 、 异丁基硼酸 、 三乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 12.17h， 生成 ((R)-1-((S)-2-(2,5-dichlorobenzamido)-3-(1H-indol-3-yl)propanamido)-3-methylbutyl)boronic acid
  参考文献：
  名称：

  发现具有非典型酶机制的新型拟肽硼酸盐ClpP抑制剂，作为体内和体外的强毒力阻断剂。

  摘要：

  酪蛋白水解蛋白酶P（ClpP）被认为是治疗金黄色葡萄球菌感染的有希望的靶标。在2632个分子的无偏筛选中，拟肽的硼酸酯MLN9708被发现是SaClpP功能的有效抑制剂。部署了一种节省时间和成本效益的策略，该策略集成了计算机位置扫描，多步微型化合成和生物活性测试，以优化该命中化合物，并导致对结构-活性关系的快速探索。来自小型化合成的150种化合物中有5种显示出更高的抑制活性。化合物43Hf是活性最高的抑制剂，并显示与SaClpP可逆的共价结合，而不会破坏SaClpP的十四聚体结构的稳定性。43Hf-SaClpP复合物的晶体结构提供了对拟肽硼酸酯和SaClpP的共价结合模式的机械洞察力。此外，43Hf可以结合金黄色葡萄球菌细胞中的内源性ClpP，并在体内和体外显示出减弱金黄色葡萄球菌毒力的显着功效。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.9b01746
• 作为产物：
  描述：

  L-色氨酸甲酯 、 2,5-二氯苯甲酸 在 三乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.17h， 生成 methyl (2S)-2-[(2,5-dichlorobenzoyl)amino]-3-(1H-indol-3-yl)propanoate
  参考文献：
  名称：

  发现具有非典型酶机制的新型拟肽硼酸盐ClpP抑制剂，作为体内和体外的强毒力阻断剂。

  摘要：

  酪蛋白水解蛋白酶P（ClpP）被认为是治疗金黄色葡萄球菌感染的有希望的靶标。在2632个分子的无偏筛选中，拟肽的硼酸酯MLN9708被发现是SaClpP功能的有效抑制剂。部署了一种节省时间和成本效益的策略，该策略集成了计算机位置扫描，多步微型化合成和生物活性测试，以优化该命中化合物，并导致对结构-活性关系的快速探索。来自小型化合成的150种化合物中有5种显示出更高的抑制活性。化合物43Hf是活性最高的抑制剂，并显示与SaClpP可逆的共价结合，而不会破坏SaClpP的十四聚体结构的稳定性。43Hf-SaClpP复合物的晶体结构提供了对拟肽硼酸酯和SaClpP的共价结合模式的机械洞察力。此外，43Hf可以结合金黄色葡萄球菌细胞中的内源性ClpP，并在体内和体外显示出减弱金黄色葡萄球菌毒力的显着功效。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.9b01746

文献信息

• Discovery of Novel Peptidomimetic Boronate ClpP Inhibitors with Noncanonical Enzyme Mechanism as Potent Virulence Blockers <i>in Vitro</i> and <i>in Vivo</i>
  作者：Yuan Ju、Lihui He、Yuanzheng Zhou、Tao Yang、Ke Sun、Rao Song、Yang Yang、Chengwei Li、Zitai Sang、Rui Bao、Youfu Luo

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b01746

  日期：2020.3.26

  relationships. Five of 150 compounds from the miniaturized synthesis exhibited improved inhibitory activity. Compound 43Hf was the most active inhibitor and showed reversible covalent binding to SaClpP while did not destabilize the tetradecameric structure of SaClpP. The crystal structure of 43Hf-SaClpP complex provided mechanistic insight into the covalent binding mode of peptidomimetic boronate and

  酪蛋白水解蛋白酶P（ClpP）被认为是治疗金黄色葡萄球菌感染的有希望的靶标。在2632个分子的无偏筛选中，拟肽的硼酸酯MLN9708被发现是SaClpP功能的有效抑制剂。部署了一种节省时间和成本效益的策略，该策略集成了计算机位置扫描，多步微型化合成和生物活性测试，以优化该命中化合物，并导致对结构-活性关系的快速探索。来自小型化合成的150种化合物中有5种显示出更高的抑制活性。化合物43Hf是活性最高的抑制剂，并显示与SaClpP可逆的共价结合，而不会破坏SaClpP的十四聚体结构的稳定性。43Hf-SaClpP复合物的晶体结构提供了对拟肽硼酸酯和SaClpP的共价结合模式的机械洞察力。此外，43Hf可以结合金黄色葡萄球菌细胞中的内源性ClpP，并在体内和体外显示出减弱金黄色葡萄球菌毒力的显着功效。