4,9-dibromo-2,7-bis(2-morpholinoethyl)benzo[lmn][3,8]phenanthroline-1,3,6,8(2H,7H)-tetraone | 1429028-93-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡啶及其衍生物
• 英文名称: 4,9-dibromo-2,7-bis(2-morpholinoethyl)benzo[lmn][3,8]phenanthroline-1,3,6,8(2H,7H)-tetraone
• 英文别名: 2,9-dibromo-6,13-bis(2-morpholin-4-ylethyl)-6,13-diazatetracyclo[6.6.2.04,16.011,15]hexadeca-1,3,8,10,15-pentaene-5,7,12,14-tetrone
• CAS: 1429028-93-2
• 化学式: C₂₆H₂₆Br₂N₄O₆
• 分子量: 650.324
• InChiKey: LEASDFAZIYTYIC-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.8
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.46
• 拓扑面积：
  99.7
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4,9-dibromo-2,7-bis(2-morpholinoethyl)benzo[lmn][3,8]phenanthroline-1,3,6,8(2H,7H)-tetraone 在 copper(ll) sulfate pentahydrate 、 sodium ascorbate 作用下， 以 水 、 乙腈 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 13.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  硫糖萘二亚胺偶联物：具有抗寄生虫和抗癌活性的 G-四链体配体

  摘要：

  与非癌细胞相比，糖基与药物结合是一种利用癌细胞中葡萄糖转运蛋白 (GLUT) 过度表达的策略。与O-糖苷相比，它扩展到药物与硫糖的结合，试图利用它们更高的生物稳定性。在这里，我们合成了一系列硫糖萘二亚胺偶联物作为 G-四链体配体，并探索了氨基侧链的修饰，比较了二甲基氨基和吗啉基。然后，我们研究了它们在结肠癌细胞中的抗增殖活性，以及​​它们在T. brucei和L. major中的抗寄生虫活性寄生虫，以及它们结合四链体的能力及其细胞摄取和定位。我们在哺乳动物细胞和寄生虫中观察到糖-NDI-NMe 2衍生物的毒性高于糖-NDI-morph 化合物。我们的实验表明，与四链体的结合效率较低和对 carb-NDI-morph 衍生物的细胞摄取较差可能是这些差异的原因。我们发现O -carb-NDI 和S -carb-NDI之间的细胞毒性差异很小，除了针对非癌性人类成纤维细胞 MRC-5，其中硫糖-NDI

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2022.114183
• 作为产物：
  描述：

  1,4,5,8-萘四甲酸酐 在 硫酸 、 溶剂黄146 、 1,3-二溴-1,3,5-三嗪-2,4,6-三酮 作用下， 反应 5.0h， 生成 4,9-dibromo-2,7-bis(2-morpholinoethyl)benzo[lmn][3,8]phenanthroline-1,3,6,8(2H,7H)-tetraone
  参考文献：
  名称：

  胰腺癌细胞中萘二酰亚胺G-四链体配体作为端粒靶向剂的基于结构的设计和评估

  摘要：

  具有正电荷末端的四取代萘二酰亚胺（ND）衍生物是人端粒和基因启动子DNA四链体的有效稳定剂，可在体外和体内抑制人癌细胞的生长。本研究报告使用基于结构的设计增强了早期ND化合物的药理特性。具有人类端粒分子内四链体的三个复合物的晶体结构表明，四个强碱性N-甲基-哌嗪基团中的两个可以被碱性较低的吗啉基团取代，而在四链体的凹槽中没有分子间相互作用的损失。这些新化合物与人端粒四链体DNA保持高度亲和力，但对带有MIC PaCa-2胰腺癌细胞系的效力要高10倍，并带有IC50个值约为10 nM。铅化合物诱导细胞衰老，但在抑制细胞增殖所需的纳摩尔剂量水平上，不抑制端粒酶活性。对用先导化合物处理的MIA PaCa-2细胞进行的基因阵列qPCR分析显示，显着剂量依赖性地调节了不同基因的子集，包括强烈诱导DNA损伤应答基因CDKN1A，DDIT3，GADD45A / G和PPM1D，以及抑制涉及端粒维持的基因，包括hPOT1和PARP1。

  DOI：

  10.1021/jm301899y

文献信息

• The influence of positional isomerism on G-quadruplex binding and anti-proliferative activity of tetra-substituted naphthalene diimide compounds
  作者：Sheila Mpima、Stephan A. Ohnmacht、Maria Barletta、Jarmila Husby、Luke C. Pett、Mekala Gunaratnam、Stephen T. Hilton、Stephen Neidle

  DOI：10.1016/j.bmc.2013.05.027

  日期：2013.10

  The synthesis together with biophysical and biological evaluation of a series of tetra-substituted naphthalene diimide (ND) compounds, are presented. These compounds are positional isomers of a recently-described series of quadruplex-binding ND derivatives, in which the two N-methyl-piperidine-alkyl side-chains have now been interchanged with the positions of side-chains bearing a range of end-groups. Molecular dynamics simulations of a pair of positional isomers are in accord with the quadruplex stabilization and biological data for these compounds. Analysis of structure-activity data indicates that for compounds where the side-chains are not of equivalent length then the positional isomers described here tend to have improved cell proliferation potency and in some instances, superior quadruplex stabilization ability. (C) 2013 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• US20140275062A1
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——
• US9493460B2
  申请人：——

  公开号：US9493460B2

  公开（公告）日：2016-11-15
• Thiosugar naphthalene diimide conjugates: G-quadruplex ligands with antiparasitic and anticancer activity
  作者：Efres Belmonte-Reche、Alessandra Benassi、Pablo Peñalver、Anne Cucchiarini、Aurore Guédin、Jean Louis Mergny、Frèdèric Rosu、Valerie Gabelica、Mauro Freccero、Filippo Doria、Juan Carlos Morales

  DOI：10.1016/j.ejmech.2022.114183

  日期：2022.3

  advantage of glucose transporters (GLUT) overexpression in cancer cells in comparison with non-cancerous cells. Its extension to the conjugation of drugs to thiosugars tries to exploit their higher biostability when compared to O-glycosides. Here, we have synthesized a series of thiosugar naphthalene diimide conjugates as G-quadruplex ligands and have explored modifications of the amino sidechain comparing

  与非癌细胞相比，糖基与药物结合是一种利用癌细胞中葡萄糖转运蛋白 (GLUT) 过度表达的策略。与O-糖苷相比，它扩展到药物与硫糖的结合，试图利用它们更高的生物稳定性。在这里，我们合成了一系列硫糖萘二亚胺偶联物作为 G-四链体配体，并探索了氨基侧链的修饰，比较了二甲基氨基和吗啉基。然后，我们研究了它们在结肠癌细胞中的抗增殖活性，以及​​它们在T. brucei和L. major中的抗寄生虫活性寄生虫，以及它们结合四链体的能力及其细胞摄取和定位。我们在哺乳动物细胞和寄生虫中观察到糖-NDI-NMe 2衍生物的毒性高于糖-NDI-morph 化合物。我们的实验表明，与四链体的结合效率较低和对 carb-NDI-morph 衍生物的细胞摄取较差可能是这些差异的原因。我们发现O -carb-NDI 和S -carb-NDI之间的细胞毒性差异很小，除了针对非癌性人类成纤维细胞 MRC-5，其中硫糖-NDI
• Structure-Based Design and Evaluation of Naphthalene Diimide G-Quadruplex Ligands As Telomere Targeting Agents in Pancreatic Cancer Cells
  作者：Marialuisa Micco、Gavin W. Collie、Aaron G. Dale、Stephan A. Ohnmacht、Ingrida Pazitna、Mekala Gunaratnam、Anthony P. Reszka、Stephen Neidle

  DOI：10.1021/jm301899y

  日期：2013.4.11

  charged termini are potent stabilizers of human telomeric and gene promoter DNA quadruplexes and inhibit the growth of human cancer cells in vitro and in vivo. The present study reports the enhancement of the pharmacological properties of earlier ND compounds using structure-based design. Crystal structures of three complexes with human telomeric intramolecular quadruplexes demonstrate that two of the

  具有正电荷末端的四取代萘二酰亚胺（ND）衍生物是人端粒和基因启动子DNA四链体的有效稳定剂，可在体外和体内抑制人癌细胞的生长。本研究报告使用基于结构的设计增强了早期ND化合物的药理特性。具有人类端粒分子内四链体的三个复合物的晶体结构表明，四个强碱性N-甲基-哌嗪基团中的两个可以被碱性较低的吗啉基团取代，而在四链体的凹槽中没有分子间相互作用的损失。这些新化合物与人端粒四链体DNA保持高度亲和力，但对带有MIC PaCa-2胰腺癌细胞系的效力要高10倍，并带有IC50个值约为10 nM。铅化合物诱导细胞衰老，但在抑制细胞增殖所需的纳摩尔剂量水平上，不抑制端粒酶活性。对用先导化合物处理的MIA PaCa-2细胞进行的基因阵列qPCR分析显示，显着剂量依赖性地调节了不同基因的子集，包括强烈诱导DNA损伤应答基因CDKN1A，DDIT3，GADD45A / G和PPM1D，以及抑制涉及端粒维持的基因，包括hPOT1和PARP1。