磷酰胺酸,N.N-双(1-甲基乙基)-,2-氰基乙基[1-(2-硝基苯基)乙基]酯) | 461425-49-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 中文名称: 磷酰胺酸,N.N-双(1-甲基乙基)-,2-氰基乙基[1-(2-硝基苯基)乙基]酯)
• 英文名称: O-1-(2-nitrophenyl)ethyl-O'-β-cyanoethyl-N,N-diisopropylphosphoramidite
• 英文别名: 2-Cyanoethyl (1-(2-nitrophenyl)ethyl) diisopropylphosphoramidite；3-[[di(propan-2-yl)amino]-[1-(2-nitrophenyl)ethoxy]phosphanyl]oxypropanenitrile
• CAS: 461425-49-0
• 化学式: C₁₇H₂₆N₃O₄P
• 分子量: 367.385
• InChiKey: BLAXPJFYCXOKEO-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.3
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.59
• 拓扑面积：
  91.3
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  芴甲氧羰基-L-酪氨酸-叔丁酯 、 磷酰胺酸,N.N-双(1-甲基乙基)-,2-氰基乙基[1-(2-硝基苯基)乙基]酯) 在 四氮唑 、 4 A molecular sieve 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 生成 tert-butyl (2S)-3-[4-[2-cyanoethoxy-[1-(2-nitrophenyl)ethoxy]phosphanyl]oxyphenyl]-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)propanoate
  参考文献：
  名称：

  固相肽合成的笼状磷酸氨基酸构件。

  摘要：

  已经合成了三种1-（2-硝基苯基）乙基笼罩的磷酸氨基酸，用于标准的基于Nα-芴基甲氧基羰基的固相肽合成（SPPS）。通过使用独特的磷酸化试剂进行修饰，可将最常见的天然磷酸氨基酸，丝氨酸，苏氨酸和酪氨酸制成受保护的笼状结构单元。在先前的工作中，使用相互组装的方法制备了笼状磷酸肽（Rothman，DM； Vazquez，ME； Vogel，EM； Imperiali，B.Org.Lett.2002，4，2865-2868）。然而，该技术限于产生不具有要修饰的氨基酸的C末端的氧化敏感残基的肽，并且该方法涉及在固相上的合成操作，这可能会限制该方法的利用。

  DOI：

  10.1021/jo0344891
• 作为产物：
  描述：

  邻硝基苯乙酮 在 sodium tetrahydroborate 、 三乙胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.5h， 生成 磷酰胺酸,N.N-双(1-甲基乙基)-,2-氰基乙基[1-(2-硝基苯基)乙基]酯)
  参考文献：
  名称：

  General Method for the Synthesis of Caged Phosphopeptides:  Tools for the Exploration of Signal Transduction Pathways

  摘要：

  [GRAPHIC]An interassembly approach for the synthesis of peptides containing 1-(2-nitrophenyl)ethyl-caged phosphoserine, -threonine, and -tyrosine has been developed. Photochemical uncaging of these peptides releases the 2-nitrophenylethyl protecting group to afford the corresponding phosphopeptide. The peptides described herein are based on phosphorylation sites of kinases involved in cell movement or cell cycle regulation and demonstrate the versatility of the method and compatibility with the synthesis of polypeptides, including a variety of encoded amino acids.

  DOI：

  10.1021/ol0262587

文献信息

• Synthesis of Site-Specifically Phosphate-Caged siRNAs and Evaluation of Their RNAi Activity and Stability
  作者：Li Wu、Fen Pei、Jinhao Zhang、Junzhou Wu、Mengke Feng、Yuan Wang、Hongwei Jin、Liangren Zhang、Xinjing Tang

  DOI：10.1002/chem.201403430

  日期：2014.9.15

  synergistic effect. The caging group on both the terminally phosphate‐caged siRNA and the single‐stranded caged RNA has comparatively high stability, whereas hydrolysis of the caged group from the internally caged siRNA was observed, irrespective of the presence of Mg2+. Molecular dynamic simulations demonstrated that enhanced hydrolysis of the caging group on internally phosphate‐caged siRNAs was due to easy

  合成了一整套新的对光不稳定的核苷亚磷酰胺，然后位点特异性地掺入到siRNA的有义或反义链中，以进行磷酸化笼罩。沿siRNA链进行单笼修饰，并使用萤火虫萤光素酶报告基因检查它们对基因沉默的光调节。然后确定了几个关键的磷酸盐位置。此外，在这些关键位置的多个笼子修饰导致基因沉默活性的光调制显着增强，表明具有协同作用。末端磷酸化的siRNA和单链笼状RNA上的笼蔽基团都具有较高的稳定性，而观察到笼状基团从内部笼中的siRNA水解，而与Mg 2+的存在无关。分子动力学模拟表明，内部磷酸化笼中的siRNA上笼形基团的增强水解是由于在磷酸三酯的五价中间体受水侵蚀形成时笼形基团易于断裂。末端磷酸化的siRNA或单链笼状RNA中的笼蔽基团更倾向于与附近的核碱基形成π–π堆栈。除了提供对先前观察结果的解释外，本研究进一步阐明了笼状寡核苷酸的设计，并指出了具有磷酸修饰的核酸药物的未来发展方向。
• Photocaging Strategy for Functionalisation of Oligonucleotides and Its Applications for Oligonucleotide Labelling and Cyclisation
  作者：Meng Su、Jie Wang、XinJing Tang

  DOI：10.1002/chem.201103833

  日期：2012.7.27

  Terminal labelling was also easily realised in solution or by on‐column solid‐phase synthesis. By using the photolabile amine modifier and the photolabile acid CPG, cyclisation of an oligodeoxynucleotide was achieved with good yields. This study provides an alternative way to introduce functional groups into oligonucleotides and expand the scope of oligonucleotide bio‐orthogonal labelling.

  我们已经使用光笼策略来开发新型亚磷酰胺，并扩大通过固相合成修饰寡核苷酸的保护基。我们合成了5个光不稳定的亚磷酰胺和4个新的光不稳定控制的孔玻璃（CPG）。通过使用这些对光不稳定的亚磷酰胺和CPG，可以轻松合成在5'和/或3'末端带有磷酸盐，胺，酸，硫醇和羰基的修饰的寡脱氧核苷酸（ODN）。据我们所知，这是第一个报道，在ODN的5'端引入一个羰基，在光不稳定的改性剂的两个末端引入硫醇基。末端标记也可以通过溶液或柱上固相合成轻松实现。通过使用光不稳定胺改性剂和光不稳定酸CPG，寡脱氧核苷酸的环化以良好的产率实现。这项研究提供了将功能基团引入寡核苷酸并扩大寡核苷酸生物正交标记范围的另一种方法。
• Photocontrol of Smad2, a Multiphosphorylated Cell-Signaling Protein, through Caging of Activating Phosphoserines
  作者：Michael E. Hahn、Tom W. Muir

  DOI：10.1002/anie.200461141

  日期：2004.11.5