3'-deoxy-3'-C-[(hydroxyphosphinyl)methyl]-2'-O-methyl-5-methyluridine | 312934-36-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3'-deoxy-3'-C-[(hydroxyphosphinyl)methyl]-2'-O-methyl-5-methyluridine
• 英文别名: [(2S,3R,4R,5R)-2-(hydroxymethyl)-4-methoxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]methylphosphinic acid
• CAS: 312934-36-4
• 化学式: C₁₂H₁₉N₂O₇P
• 分子量: 334.266
• InChiKey: MMGHSSCEYALAPO-TURQNECASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.4
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  125
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 、 3'-deoxy-3'-C-[(hydroxyphosphinyl)methyl]-2'-O-methyl-5-methyluridine 在 吡啶 作用下， 反应 24.0h， 生成 3'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-C-[(hydroxyphophinyl)methyl]-2'-O-methyl-5-methyluridine
  参考文献：
  名称：

  新型3'-C-亚甲基胸苷和5-甲基尿苷/胞苷H-膦酸酯和亚膦酸酯的合成，用于寡核苷酸的新骨架修饰。

  摘要：

  新型5'-O-DMT-和MMT保护的3'-C-亚甲基修饰的胸苷，5-甲基尿苷和5-甲基胞苷H-膦酸酯1-7与O-甲基，氟，氢和O-（2通过一种新的有效策略，由相应的关键中间体3'-C-碘甲基核苷和中间体BTSP（通过Arbuzov反应原位制备）合成了2'-位的-甲氧基乙基）取代基。Arbuzov反应的修饰反应条件防止了DMT和MMT保护基的丢失，并直接提供了所需的5'-O-DMT-和/或MMT保护的3'-C-亚甲基修饰的H-膦酸酯1 -6虽然在PC键形成后也通过操纵保护基制备了一些。3'-C-碘甲基-5-甲基胞嘧啶53的修饰Arbuzov反应 由其5-甲基尿苷衍生物42制备，并用BTSP提供5-甲基胞嘧啶H-膦酸酯54，将其进一步转移到相应的4-N-（N-甲基吡咯烷-2-亚基）-保护的H-膦酸酯单体7。5使用DCC作为偶联剂，将'-O-MMT保护的3'-C-亚甲基改性的H-膦酸酯5、3和7

  DOI：

  10.1021/jo001699u
• 作为产物：
  描述：

  1-[(2R,3R,4R,5R)-5-(tert-Butyl-diphenyl-silanyloxymethyl)-4-hydroxy-3-methoxy-tetrahydro-furan-2-yl]-5-methyl-1H-pyrimidine-2,4-dione 在 2,6-二甲基吡啶 、 sodium tetrahydroborate 、 四氧化锇 、 偶氮二异丁腈 、 双(三甲基硅基)亚磷酸盐 、 triethylamine trifluoride 、 甲基三苯氧基碘磷 、 水 、 N-甲基吗啉氧化物 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 苯 为溶剂， 反应 58.0h， 生成 3'-deoxy-3'-C-[(hydroxyphosphinyl)methyl]-2'-O-methyl-5-methyluridine
  参考文献：
  名称：

  新型3'-C-亚甲基胸苷和5-甲基尿苷/胞苷H-膦酸酯和亚膦酸酯的合成，用于寡核苷酸的新骨架修饰。

  摘要：

  新型5'-O-DMT-和MMT保护的3'-C-亚甲基修饰的胸苷，5-甲基尿苷和5-甲基胞苷H-膦酸酯1-7与O-甲基，氟，氢和O-（2通过一种新的有效策略，由相应的关键中间体3'-C-碘甲基核苷和中间体BTSP（通过Arbuzov反应原位制备）合成了2'-位的-甲氧基乙基）取代基。Arbuzov反应的修饰反应条件防止了DMT和MMT保护基的丢失，并直接提供了所需的5'-O-DMT-和/或MMT保护的3'-C-亚甲基修饰的H-膦酸酯1 -6虽然在PC键形成后也通过操纵保护基制备了一些。3'-C-碘甲基-5-甲基胞嘧啶53的修饰Arbuzov反应 由其5-甲基尿苷衍生物42制备，并用BTSP提供5-甲基胞嘧啶H-膦酸酯54，将其进一步转移到相应的4-N-（N-甲基吡咯烷-2-亚基）-保护的H-膦酸酯单体7。5使用DCC作为偶联剂，将'-O-MMT保护的3'-C-亚甲基改性的H-膦酸酯5、3和7

  DOI：

  10.1021/jo001699u

文献信息

• Synthesis of novel 3′-methylene H-phosphonate thymidines
  作者：Haoyun An、Tingmin Wang、P.Dan Cook

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)01358-7

  日期：2000.10

  The synthesis of novel 5'-DMT- and 5'-MMT-protected 3'-methylene H-phosphonate thymidines 1-6, having methoxy, fluoro, hydrogen, and methoxyethoxy substituents at the 2'-position is reported. (C) 2000 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.
• Synthesis of Novel 3‘-<i>C</i>-Methylene Thymidine and 5-Methyluridine/Cytidine H-Phosphonates and Phosphonamidites for New Backbone Modification of Oligonucleotides
  作者：Haoyun An、Tingmin Wang、Martin A. Maier、Muthiah Manoharan、Bruce S. Ross、P. Dan Cook

  DOI：10.1021/jo001699u

  日期：2001.4.1

  ne)-protected H-phosphonate monomer 7. 5'-O-MMT-protected 3'-C-methylene-modified H-phosphonates 5, 3, and 7 were converted to the corresponding cyanoethyl H-phosphonates 50, 51, and 56 using DCC as a coupling reagent. One-pot three-step reactions of 50, 51, and 56 provided the desired 3'-C-methylene-modified phosphonamidite monomers 8-10. Some of these new 3'-methylene-modified monomers 1-10 have

  新型5'-O-DMT-和MMT保护的3'-C-亚甲基修饰的胸苷，5-甲基尿苷和5-甲基胞苷H-膦酸酯1-7与O-甲基，氟，氢和O-（2通过一种新的有效策略，由相应的关键中间体3'-C-碘甲基核苷和中间体BTSP（通过Arbuzov反应原位制备）合成了2'-位的-甲氧基乙基）取代基。Arbuzov反应的修饰反应条件防止了DMT和MMT保护基的丢失，并直接提供了所需的5'-O-DMT-和/或MMT保护的3'-C-亚甲基修饰的H-膦酸酯1 -6虽然在PC键形成后也通过操纵保护基制备了一些。3'-C-碘甲基-5-甲基胞嘧啶53的修饰Arbuzov反应 由其5-甲基尿苷衍生物42制备，并用BTSP提供5-甲基胞嘧啶H-膦酸酯54，将其进一步转移到相应的4-N-（N-甲基吡咯烷-2-亚基）-保护的H-膦酸酯单体7。5使用DCC作为偶联剂，将'-O-MMT保护的3'-C-亚甲基改性的H-膦酸酯5、3和7