N-benzoyl-5'-O-(bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl)-P-(2-chlorophenyl)-2'-deoxyadenylyl-(3'->5')-N-benzoyl-2'-deoxy-3'-cytidylic acid, 2-chlorophenyl 2-cyanoethyl ester | 75269-18-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: N-benzoyl-5'-O-(bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl)-P-(2-chlorophenyl)-2'-deoxyadenylyl-(3'->5')-N-benzoyl-2'-deoxy-3'-cytidylic acid, 2-chlorophenyl 2-cyanoethyl ester
• 英文别名: Einecs 278-168-1；[(2R,3S,5R)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1-yl)-2-[[[(2R,3S,5R)-5-(6-benzamidopurin-9-yl)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]oxolan-3-yl]oxy-(2-chlorophenoxy)phosphoryl]oxymethyl]oxolan-3-yl] (2-chlorophenyl) 2-cyanoethyl phosphate
• CAS: 75269-18-0
• 化学式: C₆₉H₆₁Cl₂N₉O₁₆P₂
• 分子量: 1405.15
• InChiKey: XCTWAKMNHHNFKZ-CMZLIIHQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.8
• 重原子数：
  98
• 可旋转键数：
  28
• 环数：
  12.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.22
• 拓扑面积：
  294
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  20

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-benzoyl-5'-O-(bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl)-P-(2-chlorophenyl)-2'-deoxyadenylyl-(3'->5')-N-benzoyl-2'-deoxy-3'-cytidylic acid, 2-chlorophenyl 2-cyanoethyl ester 、 三乙胺 在 水 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of a gene coding for human lysozyme.

  摘要：

  一个含有130个氨基酸的人类溶菌酶基因已通过将链长为13-18的化学合成寡脱氧核糖核酸进行连接合成。这个拥有401个碱基对的双链被分为52个片段，这些片段通过包含二核苷酸单元缩合的磷酸三酯固相方法制备而成。在合成过程中获得的副产品已进行了表征。

  DOI：

  10.1248/cpb.34.2202
• 作为产物：
  描述：

  N6-苯甲酰基-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯基)-2'-脱氧腺苷 在 mesitylenesulfonyl-3-nitrotriazolide 、 水 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 生成 N-benzoyl-5'-O-(bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl)-P-(2-chlorophenyl)-2'-deoxyadenylyl-(3'->5')-N-benzoyl-2'-deoxy-3'-cytidylic acid, 2-chlorophenyl 2-cyanoethyl ester
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of a gene coding for human lysozyme.

  摘要：

  一个含有130个氨基酸的人类溶菌酶基因已通过将链长为13-18的化学合成寡脱氧核糖核酸进行连接合成。这个拥有401个碱基对的双链被分为52个片段，这些片段通过包含二核苷酸单元缩合的磷酸三酯固相方法制备而成。在合成过程中获得的副产品已进行了表征。

  DOI：

  10.1248/cpb.34.2202

文献信息

• N,N-bis[2-oxo-3-oxazolidinyl]phosphorodiamidic chloride: a novel coupling reagent in the synthesis of oligodeoxyribonucleotides
  作者：S.B. Katti、K.L. Agarwal

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)98833-6

  日期：1985.1

  Use of a novel coupling reagent, N,N-bis[2-oxo-3-oxazolidinyl]phosphorodiamidic chloride (BOPDC) in the synthesis of oligodeoxyribonucleotides is described. This reagent allows the synthesis of phosphotriesters in high yields (70–80%) without detectable side reactions. Synthesis of a hexanucleotide, d(A-A-C-C-C-G) is presented as an example.

  描述了一种新颖的偶联剂，N，N-双[2-氧代-3-恶唑烷二基]磷二酰胺基氯化物（BOPDC）在寡聚脱氧核糖核苷酸的合成中的用途。该试剂可以高产率（70-80％）合成磷酸三酯，而没有可检测到的副反应。以六核苷酸d（AACCCG）的合成为例。