N-4-benzoyl-5'-O-(dimethoxytrityl)-2'-deoxycitidine 3'-(o-chlorophenyl β-cyanoethyl phosphate) | 80817-35-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N-4-benzoyl-5'-O-(dimethoxytrityl)-2'-deoxycitidine 3'-(o-chlorophenyl β-cyanoethyl phosphate)
• 英文别名: N-benzoyl-5'-O-(bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl)-2'-deoxy-3'-cytidylic acid, 2-chlorophenyl 2-cyanoethyl ester；3'-Cytidylic acid, N-benzoyl-5'-O-(bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl)-2'-deoxy-, 2-chlorophenyl 2-cyanoethyl ester；[(2R,3S,5R)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1-yl)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]oxolan-3-yl] (2-chlorophenyl) 2-cyanoethyl phosphate
• CAS: 80817-35-2
• 化学式: C₄₆H₄₂ClN₄O₁₀P
• 分子量: 877.287
• InChiKey: YIVGVOFDVNJESZ-MAGPJGKGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.9
• 重原子数：
  62
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.22
• 拓扑面积：
  167
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-4-benzoyl-5'-O-(dimethoxytrityl)-2'-deoxycitidine 3'-(o-chlorophenyl β-cyanoethyl phosphate) 在 1-(2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl)-3-nitro-1,2,4-triazole 、 苯磺酸 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 、 氯仿 为溶剂， 反应 3.75h， 生成 Einecs 278-833-6
  参考文献：
  名称：

  四个十氧代核糖核苷酸的简化液相制备及其初步光谱表征

  摘要：

  dApTpApTpApTpApTpApT，dApTpApTpCpGpApTpApT和dApApApApApApApApApTpTpTly化学合成了四个自互补的十氧杂核糖核苷酸dApTpApTpApTpApTpApT，dApTpApTpCpGpCpApTpApTply。努力集中于使过程尽可能简单，同时在该过程的每个步骤中获得高纯度的产品。根据以下方案，从3'-末端以3'- O-苯甲酰化的单体开始精加工十聚体：单体+单体二聚体+二聚体四聚体+二聚六聚体+四聚体十聚体。中间体和完全封闭的十聚体的纯度通过色谱法和300MHz 1 HN M R.光谱法进行监测。解封闭的十氧杂核糖核苷酸的特征在于它们的UV，CD和1 HNMR。光谱。

  DOI：

  10.1002/hlca.19820650803
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧胞苷盐酸盐 在 N-甲基咪唑 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 吡啶 、 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 23.17h， 生成 N-4-benzoyl-5'-O-(dimethoxytrityl)-2'-deoxycitidine 3'-(o-chlorophenyl β-cyanoethyl phosphate)
  参考文献：
  名称：

  四个十氧代核糖核苷酸的简化液相制备及其初步光谱表征

  摘要：

  dApTpApTpApTpApTpApT，dApTpApTpCpGpApTpApT和dApApApApApApApApApTpTpTly化学合成了四个自互补的十氧杂核糖核苷酸dApTpApTpApTpApTpApT，dApTpApTpCpGpCpApTpApTply。努力集中于使过程尽可能简单，同时在该过程的每个步骤中获得高纯度的产品。根据以下方案，从3'-末端以3'- O-苯甲酰化的单体开始精加工十聚体：单体+单体二聚体+二聚体四聚体+二聚六聚体+四聚体十聚体。中间体和完全封闭的十聚体的纯度通过色谱法和300MHz 1 HN M R.光谱法进行监测。解封闭的十氧杂核糖核苷酸的特征在于它们的UV，CD和1 HNMR。光谱。

  DOI：

  10.1002/hlca.19820650803

文献信息

• Improved Synthesis of Oligodeoxyribonucleotides by Solid-Phase Phosphotriester Method UtilizingO6-[2-(p-Nitrophenyl)ethyl]-2?-deoxyguanosine Derivatives
  作者：Andr� Chollet、Edgar Ayala、Eric H. Kawashima

  DOI：10.1002/hlca.19840670521

  日期：1984.8.8

  The synthesis of oligodeoxyribonucleotides on a cross-linked polystyrene solid support utilizing stable mono- and dinucleotide phosphotriester building blocks is presented. The use of O6[2-(p-nitrophenyl)ethyl]-2′-deoxyguanosine derivatives yields cleaner DNA fragments by suppressing side reactions. Modifications improving the phosphotriester methodology are presented. The purification methods and

  提出了利用稳定的单核苷酸和二核苷酸磷酸三酯结构单元在交联的聚苯乙烯固体载体上合成寡脱氧核糖核苷酸。使用ö 6 [2-（p通过抑制副反应硝基苯基）乙基] -2'-脱氧鸟苷的产率衍生物吸尘器的DNA片段。提出了改进磷酸三酯方法的修饰。描述了合成寡聚脱氧核糖核苷酸的纯化方法和分析。
• Synthesis of a gene coding for human lysozyme.
  作者：MORIO IKEHARA、KAZUKO JUJIMOTO、YOSHIYUKI AOYAMA、KOICHI YANASE、JITSUHIRO KATSUGI、TETSUYA INEOKA、TOMOKO TOKUNAGA、SEIICHI UESUGI、SHIGENORI IWAI、EIKO OHTSUKA

  DOI：10.1248/cpb.34.2202

  日期：——

  A gene for human lysozyme with 130 amino acids has been synthesized by ligation of chemically synthesized oligodeoxyribonucleotides with chain lengths of 13-18. The duplex with 401 base pairs was divided into 52 fragments, which were prepared by the phosphotriester solid-phase method involving condensation of dinucleotide units. By-products obtained in the synthesis have been characterized.

  一个含有130个氨基酸的人类溶菌酶基因已通过将链长为13-18的化学合成寡脱氧核糖核酸进行连接合成。这个拥有401个碱基对的双链被分为52个片段，这些片段通过包含二核苷酸单元缩合的磷酸三酯固相方法制备而成。在合成过程中获得的副产品已进行了表征。
• A Convenient Synthesis of Cyclohexylammonium 2-Chlorophenyl 2-Cyanoethyl Phosphate
  作者：Kohji Yamada、Renzo Dohmori

  DOI：10.1055/s-1984-30834

  日期：——
• Francois, P.; Hamoir, G.; Sonveaux, E., Bulletin des Societes Chimiques Belges, 1985, vol. 94, # 11-12, p. 821 - 824
  作者：Francois, P.、Hamoir, G.、Sonveaux, E.、Vermeersch, H.、Ma, Y.

  DOI：——

  日期：——
• Selective N-deacylation of N,O-protected nucleosides by zinc bromide
  作者：R. Kierzek、H. Ito、R. Bhatt、K. Itakura

  DOI：10.1016/s0040-4039(01)82014-1

  日期：1981.1