benzyl-(1S,2R)-2-[(1S)-1-[(1,3-dioxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-2-yl)methyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-2-carbonyl]cyclohexane-1-carboxylate | 1432065-37-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 异吲哚及其衍生物
• 英文名称: benzyl-(1S,2R)-2-[(1S)-1-[(1,3-dioxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-2-yl)methyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-2-carbonyl]cyclohexane-1-carboxylate
• 英文别名: benzyl (1S,2R)-2-[(1S)-1-[(1,3-dioxoisoindol-2-yl)methyl]-3,4-dihydro-1H-isoquinoline-2-carbonyl]cyclohexane-1-carboxylate
• CAS: 1432065-37-6
• 化学式: C₃₃H₃₂N₂O₅
• 分子量: 536.627
• InChiKey: BMFVTLRCUWGYKU-SSBOKUKZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.9
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  84
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  benzyl-(1S,2R)-2-[(1S)-1-[(1,3-dioxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-2-yl)methyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-2-carbonyl]cyclohexane-1-carboxylate 在 5%-palladium/activated carbon 、 氢气 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 48.0h， 以49%的产率得到(1S，2R)-2-[[(1S)-1-[(1,3-二氢-1,3-二氧代-2H-异吲哚-2-基)甲基]-3,4-二氢-2(1H)-异喹啉基]羰基]环己烷甲酸
  参考文献：
  名称：

  Nrf2-Keap1复合体直接抑制剂周围的结合模式和结构-活性关系。

  摘要：

  与（1 S，2 R）-2-[（1 S）-1-[（1,3-dioxo-2,3 ）共结晶的类Kelch ECH相关蛋白（Keap1）的X射线晶体结构获得了[二氢-1 H-异吲哚-2-基）甲基] -1,2,3,4-四氢异喹啉-2-羰基]环己烷-1-羧酸（化合物（S，R，S）-1 a） 。这种X射线晶体结构为命中化合物（S，R，S）-1 a的真正结合模式提供了突破性的实验证据，因为发现配体方向不同于初始对接模型，该对接模型可在项目开始时使用。对这种结合模式的晶体学解释有助于更有效和有效地集中和推动药物设计过程。

  DOI：

  10.1002/cmdc.201300525
• 作为产物：
  描述：

  邻苯二甲酰甘氨酸 在 [(1S,2S)-N-(p-toluensulfonyl)-1,2-diphenylethanediamine](p-cymene)ruthenium (I) 、 甲酸 、 三乙酰氧基硼氢化钠 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 三氯氧磷 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 benzyl-(1S,2R)-2-[(1S)-1-[(1,3-dioxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-2-yl)methyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-2-carbonyl]cyclohexane-1-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  DIRECT INHIBITORS OF KEAP1-NRF2 INTERACTION AS ANTIOXIDANT INFLAMMATION MODULATORS

  摘要：

  通过高通量筛选和引物开发的方法，识别化合物作为Keap1-Nrf2相互作用的直接抑制剂。Keap1-Nrf2相互作用的直接抑制剂比现有的间接抑制剂更具特异性，不受各种不良影响，并且是化学预防和治疗各种涉及氧化应激和/或炎症的疾病或症状的潜在药物候选者，包括但不限于癌症、糖尿病、阿尔茨海默病和帕金森病。还公开了识别新化合物以及使用所识别的新化合物或含有这些化合物的组合物来预防或治疗与Keap1-Nrf2相互作用活性相关的疾病或症状的方法。

  公开号：

  US20180148408A1

文献信息

• DIRECT INHIBITORS OF KEAP1-NRF2 INTERACTION AS ANTIOXIDANT INFLAMMATION MODULATORS
  申请人：Rutgers, The State University of New Jersey

  公开号：US20180148408A1

  公开（公告）日：2018-05-31

  A method of identifying compounds as direct inhibitors of Keap1-Nrf2 interaction through high-throughput screening and lead development. The direct inhibitors of Keap1-Nrf2 interaction are more specific and free of various undesirable effects than existing indirect inhibitors, and are potential drug candidates of chemopreventive and therapeutic agents for treatment of various diseases or conditions involving oxidative stress and/or inflammation, including but not limited to cancers, diabetes, Alzheimer's, and Parkinson's. Novel compounds are identified and methods of preventing or treating diseases or conditions related to Keap1-Nrf2 interaction activity by use of the novel compounds identified or compositions containing such compounds are also disclosed.

  通过高通量筛选和引物开发的方法，识别化合物作为Keap1-Nrf2相互作用的直接抑制剂。Keap1-Nrf2相互作用的直接抑制剂比现有的间接抑制剂更具特异性，不受各种不良影响，并且是化学预防和治疗各种涉及氧化应激和/或炎症的疾病或症状的潜在药物候选者，包括但不限于癌症、糖尿病、阿尔茨海默病和帕金森病。还公开了识别新化合物以及使用所识别的新化合物或含有这些化合物的组合物来预防或治疗与Keap1-Nrf2相互作用活性相关的疾病或症状的方法。
• [EN] DIRECT INHIBITORS OF KEAP1-NRF2 INTERACTION AS ANTIOXIDANT INFLAMMATION MODULATORS<br/>[FR] INHIBITEURS DIRECTS DE L'INTERACTION KEAP1-NRF2 EN TANT QUE MODULATEURS DE L'INFLAMMATION PAR ANTI-OXYDANT
  申请人：UNIV RUTGERS

  公开号：WO2013067036A1

  公开（公告）日：2013-05-10

  A method of identifying compounds as direct inhibitors of Keap1-Nrf2 interaction through high-throughput screening and lead development. The direct inhibitors of Keap1-Nrf2 interaction are more specific and free of various undesirable effects than existing indirect inhibitors, and are potential drug candidates of chemopreventive and therapeutic agents for treatment of various diseases or conditions involving oxidative stress and/or inflammation, including but not limited to cancers, diabetes, Alzheimer's, and Parkinson's. Novel compounds are identified and methods of preventing or treating diseases or conditions related to Keapl-Nrf2 interaction activity by use of the novel compounds identified or compositions containing such compounds are also disclosed.

  一种通过高通量筛选和引物开发将化合物识别为直接抑制Keap1-Nrf2相互作用的方法。Keap1-Nrf2相互作用的直接抑制剂比现有的间接抑制剂更具特异性，且不受各种不良效应的影响，是潜在的化学预防和治疗剂的候选药物，可用于治疗涉及氧化应激和/或炎症的各种疾病或病症，包括但不限于癌症、糖尿病、阿尔茨海默病和帕金森病。还披露了识别新化合物和利用所识别的新化合物或含有这些化合物的组合物预防或治疗与Keap1-Nrf2相互作用活性相关的疾病或病症的方法。
• US20140256767A1
  申请人：——

  公开号：US20140256767A1

  公开（公告）日：2014-09-11
• Binding Mode and Structure-Activity Relationships around Direct Inhibitors of the Nrf2-Keap1 Complex
  作者：Eric Jnoff、Claudia Albrecht、John J. Barker、Oliver Barker、Edward Beaumont、Steven Bromidge、Frederick Brookfield、Mark Brooks、Christian Bubert、Tom Ceska、Vincent Corden、Graham Dawson、Stephanie Duclos、Tara Fryatt、Christophe Genicot、Emilie Jigorel、Jason Kwong、Rosemary Maghames、Innocent Mushi、Richard Pike、Zara A. Sands、Myron A. Smith、Christopher C. Stimson、Jean-Philippe Courade

  DOI：10.1002/cmdc.201300525

  日期：2014.4

  This X‐ray crystal structure provides breakthrough experimental evidence for the true binding mode of the hit compound (S,R,S)‐1 a, as the ligand orientation was found to differ from that of the initial docking model, which was available at the start of the project. Crystallographic elucidation of this binding mode helped to focus and drive the drug design process more effectively and efficiently.

  与（1 S，2 R）-2-[（1 S）-1-[（1,3-dioxo-2,3 ）共结晶的类Kelch ECH相关蛋白（Keap1）的X射线晶体结构获得了[二氢-1 H-异吲哚-2-基）甲基] -1,2,3,4-四氢异喹啉-2-羰基]环己烷-1-羧酸（化合物（S，R，S）-1 a） 。这种X射线晶体结构为命中化合物（S，R，S）-1 a的真正结合模式提供了突破性的实验证据，因为发现配体方向不同于初始对接模型，该对接模型可在项目开始时使用。对这种结合模式的晶体学解释有助于更有效和有效地集中和推动药物设计过程。
• Discovery of a small-molecule inhibitor and cellular probe of Keap1–Nrf2 protein–protein interaction
  作者：Longqin Hu、Sadagopan Magesh、Lin Chen、Lili Wang、Timothy A. Lewis、Yu Chen、Carol Khodier、Daigo Inoyama、Lesa J. Beamer、Thomas J. Emge、Jian Shen、John E. Kerrigan、Ah-Ng Tony Kong、Sivaraman Dandapani、Michelle Palmer、Stuart L. Schreiber、Benito Munoz

  DOI：10.1016/j.bmcl.2013.03.013

  日期：2013.5

  A high-throughput screen (HTS) of the MLPCN library using a homogenous fluorescence polarization assay identified a small molecule as a first-in-class direct inhibitor of Keap1-Nrf2 protein protein interaction. The HTS hit has three chiral centers; a combination of flash and chiral chromatographic separation demonstrated that Keap1-binding activity resides predominantly in one stereoisomer (SRS)-5 designated as ML334 (LH601A), which is at least 100x more potent than the other stereoisomers. The stereochemistry of the four cis isomers was assigned using X-ray crystallography and confirmed using stereospecific synthesis. (SRS)-5 is functionally active in both an ARE gene reporter assay and an Nrf2 nuclear translocation assay. The stereospecific nature of binding between (SRS)-5 and Keap1 as well as the preliminary but tractable structure activity relationships support its use as a lead for our ongoing optimization (C) 2013 Elsevier Ltd. All rights reserved.