6-[6-(2,5-Dioxo-2,5-dihydro-pyrrol-1-yl)-hexanoylamino]-hexanoic acid pentafluorophenyl ester | 692739-26-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯酚酯
• 英文名称: 6-[6-(2,5-Dioxo-2,5-dihydro-pyrrol-1-yl)-hexanoylamino]-hexanoic acid pentafluorophenyl ester
• CAS: 692739-26-7
• 化学式: C₂₂H₂₃F₅N₂O₅
• 分子量: 490.427
• InChiKey: OAQWBKBBGPAGPA-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  623.5±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.357±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.45
• 重原子数：
  34.0
• 可旋转键数：
  13.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  92.78
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-[6-(2,5-Dioxo-2,5-dihydro-pyrrol-1-yl)-hexanoylamino]-hexanoic acid pentafluorophenyl ester 在 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 为溶剂， 生成 6-(2,5-Dioxo-2,5-dihydro-pyrrol-1-yl)-hexanoic acid (5-{5-[(2R,3R,4R,5S,6R)-3,4-dihydroxy-6-hydroxymethyl-5-((2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-hydroxymethyl-tetrahydro-pyran-2-yloxy)-tetrahydro-pyran-2-ylcarbamoyl]-pentylcarbamoyl}-pentyl)-amide
  参考文献：
  名称：

  用于研究高通量碳水化合物-蛋白质相互作用的碳水化合物芯片

  摘要：

  碳水化合物-蛋白质相互作用在生物体中起着重要的生物学作用。在大多数情况下，生物物理和生物化学方法已被用于研究这些生物分子相互作用。对阐明碳水化合物和蛋白质之间识别事件的高通量方法的开发关注较少。在目前开发用于监测碳水化合物-蛋白质相互作用的新型高通量工具的努力中，我们通过将马来酰亚胺连接的碳水化合物固定在硫醇衍生的载玻片上来制备碳水化合物微阵列，并使用这些微阵列进行凝集素结合实验。结果表明，具有不同结构特征的碳水化合物以与从基于溶液的测定中获得的那些相关联的相对结合亲和力选择性地结合到相应的凝集素。此外，还通过用碳水化合物微阵列确定可溶性碳水化合物的 IC(50) 值来定量分析凝集素对碳水化合物的结合亲和力。为了制造包含更多不同碳水化合物探针的碳水化合物芯片，进行了液相平行和酶促糖基化。在溶液相中平行合成了三种模型二糖，并将其用作制备碳水化合物芯片的碳水化合物探针。连续在载玻片上进行三个酶

  DOI：

  10.1021/ja0391661
• 作为产物：
  描述：

  6-马来酰亚胺基己酸 在 N-乙基吗啉 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 氯磷酸二苯酯 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 、 丙酮 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 6-[6-(2,5-Dioxo-2,5-dihydro-pyrrol-1-yl)-hexanoylamino]-hexanoic acid pentafluorophenyl ester
  参考文献：
  名称：

  用于研究高通量碳水化合物-蛋白质相互作用的碳水化合物芯片

  摘要：

  碳水化合物-蛋白质相互作用在生物体中起着重要的生物学作用。在大多数情况下，生物物理和生物化学方法已被用于研究这些生物分子相互作用。对阐明碳水化合物和蛋白质之间识别事件的高通量方法的开发关注较少。在目前开发用于监测碳水化合物-蛋白质相互作用的新型高通量工具的努力中，我们通过将马来酰亚胺连接的碳水化合物固定在硫醇衍生的载玻片上来制备碳水化合物微阵列，并使用这些微阵列进行凝集素结合实验。结果表明，具有不同结构特征的碳水化合物以与从基于溶液的测定中获得的那些相关联的相对结合亲和力选择性地结合到相应的凝集素。此外，还通过用碳水化合物微阵列确定可溶性碳水化合物的 IC(50) 值来定量分析凝集素对碳水化合物的结合亲和力。为了制造包含更多不同碳水化合物探针的碳水化合物芯片，进行了液相平行和酶促糖基化。在溶液相中平行合成了三种模型二糖，并将其用作制备碳水化合物芯片的碳水化合物探针。连续在载玻片上进行三个酶

  DOI：

  10.1021/ja0391661