[(2S,6R)-6-{N²-(phenoxyacetyl)-O⁶-(2-cyanoethyl)guanin-9-yl}-4-tritylmorpholin-2-yl]methyl dimethylphosphoramidochloridate | 1370348-30-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: [(2S,6R)-6-{N²-(phenoxyacetyl)-O⁶-(2-cyanoethyl)guanin-9-yl}-4-tritylmorpholin-2-yl]methyl dimethylphosphoramidochloridate
• 英文别名: N-[9-[(2R,6S)-6-[[chloro(dimethylamino)phosphoryl]oxymethyl]-4-tritylmorpholin-2-yl]-6-(2-cyanoethoxy)purin-2-yl]-2-phenoxyacetamide
• CAS: 1370348-30-3
• 化学式: C₄₂H₄₂ClN₈O₆P
• 分子量: 821.272
• InChiKey: RJKFKQBYDBMFSV-DOMFXGONSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.9
• 重原子数：
  58
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  157
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  phosphoramidochloridic acid, N,N-dimethyl-, [6-(3,4-dihydro-5-methyl-2,4-dioxo-1(2H)-pyrimidinyl)-4-(triphenylmethyl)-2-morpholinyl]methyl ester 、 N,N-二甲基氯亚膦酰胺[(2S,6R)-6-[4-(苯甲酰基氨基)-2-氧代-1(2H)-嘧啶基]-4-(三苯基甲基)-2-吗啉基]甲基酯 、 phosphoramidochloridic acid, N,N-dimethyl-, [6-[6-(benzoylamino)-9H-purin-9-yl]-4-(triphenylmethyl)-2-morpholinyl]methyl ester 、 [(2S,6R)-6-{N²-(phenoxyacetyl)-O⁶-(2-cyanoethyl)guanin-9-yl}-4-tritylmorpholin-2-yl]methyl dimethylphosphoramidochloridate 、 1,4-环己烷双(甲基胺) 在 三氯乙酸 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 四氢呋喃 、 乙腈 为溶剂， 反应 1.53h， 生成 1-[(2R,6S)-6-[[[(2R,6S)-2-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-6-[[[(2S,6R)-2-[[[(2R,6S)-2-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-6-(hydroxymethyl)morpholin-4-yl]-(dimethylamino)phosphoryl]oxymethyl]-6-(6-aminopurin-9-yl)morpholin-4-yl]-(dimethylamino)phosphoryl]oxymethyl]morpholin-4-yl]-(dimethylamino)phosphoryl]oxymethyl]-4-[[(2S,6R)-6-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-4-[[(2S,6R)-6-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)morpholin-2-yl]methoxy-(dimethylamino)phosphoryl]morpholin-2-yl]methoxy-(dimethylamino)phosphoryl]morpholin-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  Morpholino Nucleic Acid Derivatives

  摘要：

  本发明提供了一种用于合成吗啉核酸寡聚体的有用吗啉核酸衍生物。本发明提供了以下一般式（1）或其盐所代表的化合物。 在这里，R1代表氢、三苯甲基等。 R2代表酰胺或亚胺。 R3代表一个羟基，可能被三烷基硅基等保护，或者由以下一般式（5）所代表的基团： （其中X代表O或S，Y代表二烷基氨基或烷氧基，Z代表氯）。

  公开号：

  US20130197220A1
• 作为产物：
  描述：

  N2-苯氧基乙酰基鸟苷 在 1-甲基吡咯烷 、 N-乙基吗啉 、 咪唑 、 N-甲基咪唑 、 盐酸 、 4-二甲氨基吡啶 、 sodium periodate 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 29.33h， 生成 [(2S,6R)-6-{N²-(phenoxyacetyl)-O⁶-(2-cyanoethyl)guanin-9-yl}-4-tritylmorpholin-2-yl]methyl dimethylphosphoramidochloridate
  参考文献：
  名称：

  Morpholino Nucleic Acid Derivatives

  摘要：

  本发明提供了一种用于合成吗啉核酸寡聚体的有用吗啉核酸衍生物。本发明提供了以下一般式（1）或其盐所代表的化合物。 在这里，R1代表氢、三苯甲基等。 R2代表酰胺或亚胺。 R3代表一个羟基，可能被三烷基硅基等保护，或者由以下一般式（5）所代表的基团： （其中X代表O或S，Y代表二烷基氨基或烷氧基，Z代表氯）。

  公开号：

  US20130197220A1