理解氢键的细微方面是提高我们设计对蛋白质宿主具有高亲和力的
配体的能力的一项艰巨而关键的任务。为了对这些方面有更深入的了解,我们研究了一系列凝血酶
抑制剂,其中通过
生物立体异构调节了从Gly216接受H键的
配体基团的碱性。例如,通过相邻部分的
生物等排代换,使C = O受体电子缺乏或富集。尽管当增加H键的碱性时(由于与蛋白质更强的H键结合),预期
配体的结合亲和力会提高,但我们在此提供的数据出乎意料地显示出相反的趋势。该趋势归因于去溶剂化在确定相对结合亲和力中的主导作用。例如,H-键碱性的降低减少了去溶剂化损失,并且如实验观察到的,提高了结合亲和力,因为去溶剂化损失的减少主导了
配体与蛋白质相互作用的净贡献的变化。因此,当前的研究表明,去溶剂化可能是造成明显的反直觉的结构-活性关系(
SAR)结果的主要原因,并且表明了解这一因素可以提高我们预测结合亲和力和设计更有效
配体的能力。