阐明RNA与蛋白质之间的动态相互作用对于理解RNA调控的
生物学过程(例如RNA干扰(RNAi))至关重要。在这项研究中,逻辑
化学探针包括7-
溴7-脱氮杂
腺苷(Br 7 C 7 A)和3-溴-3-脱氮杂
腺苷(Br 3 C 3 A),以研究小干扰RNA(siRNA)–RNAi相关蛋白相互作用的发展。Br 7 C 7 A和Br 3 C 3的
溴取代基当将这些
化学探针整合到siRNA中时,预期A分别位于主要和次要凹槽中,并在每个凹槽中充当空间位阻。使用包含这些
化学探针的siRNA进行的全面研究表明(i)过客链5'末端的Br 3 C 3 A增强了其RNAi活性,并且(ii)RISC组装的方向由RISC的主要成分Argonaute2与过客链5'端附近小沟中的siRNA相互作用。利用这些
化学探针可以研究RNA与蛋白质之间的动态相互作用。