摩熵化学
数据库官网
小程序
打开微信扫一扫
首页 分子通 化学资讯 化学百科 反应查询 关于我们
请输入关键词

5-[5-(pent-1-ynylic acid methyl ester)]-2′-deoxycytidin | 1448510-93-7

中文名称
——
中文别名
——
英文名称
5-[5-(pent-1-ynylic acid methyl ester)]-2′-deoxycytidin
英文别名
methyl 5-[4-amino-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-5-yl]pent-4-ynoate
5-[5-(pent-1-ynylic acid methyl ester)]-2′-deoxycytidin化学式
CAS
1448510-93-7
化学式
C15H19N3O6
mdl
——
分子量
337.332
InChiKey
BIDGBUSINJXRDY-QJPTWQEYSA-N
BEILSTEIN
——
EINECS
——
  • 物化性质
  • 计算性质
  • ADMET
  • 安全信息
  • SDS
  • 制备方法与用途
  • 上下游信息
  • 反应信息
  • 文献信息
  • 表征谱图
  • 同类化合物
  • 相关功能分类
  • 相关结构分类

计算性质

  • 辛醇/水分配系数(LogP):
    -1.3
  • 重原子数:
    24
  • 可旋转键数:
    6
  • 环数:
    2.0
  • sp3杂化的碳原子比例:
    0.53
  • 拓扑面积:
    135
  • 氢给体数:
    3
  • 氢受体数:
    6

上下游信息

  • 上游原料
    中文名称 英文名称 CAS号 化学式 分子量
  • 下游产品
    中文名称 英文名称 CAS号 化学式 分子量

反应信息

  • 作为反应物:
    描述:
    5-[5-(pent-1-ynylic acid methyl ester)]-2′-deoxycytidin吡啶二氯乙酸4-二甲氨基吡啶三乙胺 作用下, 以 二氯甲烷 为溶剂, 反应 18.67h, 生成 5-[5-(pent-1-ynylic acid methyl ester)]-3′-O-acetyl-2′-deoxycytidine
    参考文献:
    名称:
    带有组胺,羧酸和羟基残基的脱氧核苷三磷酸-合成和生化表征†
    摘要:
    制备了修饰的核苷三磷酸酯(dA Hs TP,dU POH TP和dC Val TP),其带有通过炔烃连接基与嘌呤和嘧啶碱基连接的咪唑,羟基和羧酸残基。这些修饰的dN * TPs是引物延伸反应中各种DNA聚合酶的优良底物。此外,末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)和修饰的dNTPs的组合使用导致了有效的拖尾反应,可与天然对应物媲美。最后,在聚合酶链反应条件下,三磷酸被聚合酶所耐受,随后的修饰寡核苷酸用作未修饰DNA再生的模板。因此,这些修饰的dN * TPs与体外完全相容 选择方法,可用于开发基于DNA的人工肽酶。
    DOI:
    10.1039/c3ob40842f
  • 作为产物:
    描述:
    戊-4-炔酸甲酯5-碘-2'-脱氧胞苷copper(l) iodide三乙胺四(三苯基膦)钯 作用下, 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂, 反应 0.17h, 以90%的产率得到5-[5-(pent-1-ynylic acid methyl ester)]-2′-deoxycytidin
    参考文献:
    名称:
    带有组胺,羧酸和羟基残基的脱氧核苷三磷酸-合成和生化表征†
    摘要:
    制备了修饰的核苷三磷酸酯(dA Hs TP,dU POH TP和dC Val TP),其带有通过炔烃连接基与嘌呤和嘧啶碱基连接的咪唑,羟基和羧酸残基。这些修饰的dN * TPs是引物延伸反应中各种DNA聚合酶的优良底物。此外,末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)和修饰的dNTPs的组合使用导致了有效的拖尾反应,可与天然对应物媲美。最后,在聚合酶链反应条件下,三磷酸被聚合酶所耐受,随后的修饰寡核苷酸用作未修饰DNA再生的模板。因此,这些修饰的dN * TPs与体外完全相容 选择方法,可用于开发基于DNA的人工肽酶。
    DOI:
    10.1039/c3ob40842f
点击查看最新优质反应信息

文献信息

  • Deoxynucleoside triphosphates bearing histamine, carboxylic acid, and hydroxyl residues – synthesis and biochemical characterization
    作者:Marcel Hollenstein
    DOI:10.1039/c3ob40842f
    日期:——
    Modified nucleoside triphosphates (dAHsTP, dUPOHTP, and dCValTP) bearing imidazole, hydroxyl, and carboxylic acid residues connected to the purine and pyrimidine bases through alkyne linkers were prepared. These modified dN*TPs were excellent substrates for various DNA polymerases in primer extension reactions. Moreover, the combined use of terminal deoxynucleotidyl transferase (TdT) and the modified
    制备了修饰的核苷三磷酸酯(dA Hs TP,dU POH TP和dC Val TP),其带有通过炔烃连接基与嘌呤和嘧啶碱基连接的咪唑,羟基和羧酸残基。这些修饰的dN * TPs是引物延伸反应中各种DNA聚合酶的优良底物。此外,末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)和修饰的dNTPs的组合使用导致了有效的拖尾反应,可与天然对应物媲美。最后,在聚合酶链反应条件下,三磷酸被聚合酶所耐受,随后的修饰寡核苷酸用作未修饰DNA再生的模板。因此,这些修饰的dN * TPs与体外完全相容 选择方法,可用于开发基于DNA的人工肽酶。
查看更多