methyl (3S)-3-[dimethyl(phenyl)silyl]hex-4-enoate | 1004309-92-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: methyl (3S)-3-[dimethyl(phenyl)silyl]hex-4-enoate
• CAS: 1004309-92-5
• 化学式: C₁₅H₂₂O₂Si
• 分子量: 262.424
• InChiKey: LCBVSVWXXPCVKB-CQSZACIVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.11
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  26.3
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (3S)-3-[dimethyl(phenyl)silyl]hex-4-enoate 在 四(三苯基膦)钯 、 1,3-二甲基巴比妥酸 、 三氟化硼 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  发现紫杉醇/嘧啶核糖核酸内切酶1的大环抑制剂。

  摘要：

  apurinic / apyrimidinic核酸内切酶1（APE1）是必不可少的碱基切除修复酶，在许多癌症中均被上调，有助于对用DNA烷化剂或氧化剂治疗的肿瘤产生抵抗力，并且最近被确定为重要的治疗靶点。在这项工作中，我们通过实验确定了APE1高分辨率晶体结构中小有机分子结合的热点，并通过使用FTMAP分析（http://ftmap.bu.edu/）进行了计算。在这些热点的引导下，停靠了一个类似药物的大环化合物文库，然后筛选了对APE1核酸内切酶活性的抑制作用。在迭代过程中，热点引导对接，APE1核酸内切酶抑制作用的表征以及癌细胞的细胞毒性被用于设计下一代大环化合物。为了评估细胞中的靶标选择性，分析了选定的大环化合物对DNA损伤的调节作用。综上所述，我们的研究表明，大环化合物代表了一种有前途的抑制癌细胞中APE1的化合物。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.8b01529

文献信息

• Synthesis of a 35-Member Stereoisomer Library of Bistramide A: Evaluation of Effects on actin State, Cell Cycle and Tumor Cell Growth
  作者：Iwona E. Wrona、Jason T. Lowe、Thomas J. Turbyville、Tanya R. Johnson、Julien Beignet、John A. Beutler、James S. Panek

  DOI：10.1021/jo802269q

  日期：2009.3.6

  Synthesis and preliminary biological evaluation of a 35-member library of bistramide A stereoisomers are reported. All eight stereoisomers of the C1−C13 tetrahydropyran fragment of the molecule were prepared utilizing crotylsilane reagents 9 and 10 in our [4+2]-annulation methodology. In addition, the four isomers of the C14−C18 γ-amino acid unit were accessed via a Lewis acid mediated crotylation

  报道了双酰胺 A 立体异构体的 35 成员文库的合成和初步生物学评估。在我们的 [4+2] 环化方法中，使用巴豆基硅烷试剂9和10制备了该分子的 C1-C13 四氢吡喃片段的所有八种立体异构体。此外，C14-C18 γ-氨基酸单元的四种异构体通过路易斯酸介导的巴豆化反应使用有机硅烷11的两种对映异构体获得. Bistramide A 的螺旋缩酮亚基在 C39 醇处进行了修饰，以提供立体化学多样化的另一个点。通过使用标准肽偶联方案将片段偶联以提供天然产物的 35 种立体异构体。筛选这些立体化学类似物对细胞肌动蛋白的影响和对癌细胞系（UO-31 肾和 SF-295 CNS）的细胞毒性。这些测定的结果鉴定了一种类似物1.21，其相对于天然产物 bistramide A 具有增强的效力。
• Diastereodivergent Synthesis of Chiral Tetrahydropyrrolodiazepinediones via a One-Pot Intramolecular <i>aza</i>-Michael/Lactamization Sequence
  作者：Spandan Chennamadhavuni、James S. Panek、John A. Porco、Lauren E. Brown

  DOI：10.1021/acs.joc.8b02724

  日期：2018.12.21

  A modular and diastereodivergent synthesis of tetrahydro-1 H-pyrrolo[1,2 d]diazepine-(2,5)-diones is presented. The tetrahydropyrrolodiazepinedione scaffold is obtained via a base-mediated three-step isomerization/tandem cyclization of amino acid-coupled homoallylic amino esters. Diastereoselectivity of the process is mediated by the interplay of a kinetic cyclization event and a propensity for thermodynamic

  提出了模块化和非对映异构合成四氢-1 H-吡咯并[1,2 d]二氮杂卓-（2,5）-二酮。四氢吡咯并二氮杂二酮二酮支架是通过氨基酸偶联的均烯丙基氨基酯的碱介导的三步异构化/串联环化获得的。该过程的非对映选择性是由动力学环化事件和在两个不稳定手性中心发生热力学差向异构化的相互作用所介导的，这取决于所选择的原料立体化学和反应条件，产生了两个不同的主要非对映异构体。在这里，我们提出了在多种氨基酯底物上进行这种串联过程的合成和计算研究。
• Sequential Transformations to Access Polycyclic Chemotypes: Asymmetric Crotylation and Metal Carbenoid Reactions
  作者：Jie Wu、Jorge Becerril、Yajing Lian、Huw M. L. Davies、John A. Porco、James S. Panek

  DOI：10.1002/anie.201101366

  日期：2011.6.20

  All in order: Bicyclic and tricyclic chemotypes were accessed through the title transformations. By subsequent pairing of installed functional groups using Heck cyclization or [2+2] photocycloaddition, the synthesis of tetracycles, pentacycles, and condensed polycycles has been achieved with high stereochemical and skeletal variation.

  全部按顺序：通过标题转换访问双环和三环化学型。通过随后使用 Heck 环化或 [2+2] 光环加成对已安装的官能团进行配对，已经实现了具有高度立体化学和骨架变异的四环、五环和稠合多环的合成。
• Discovery of Macrocyclic Inhibitors of Apurinic/Apyrimidinic Endonuclease 1
  作者：Richard Trilles、Dmitri Beglov、Qiujia Chen、Hongzhen He、Randall Wireman、April Reed、Spandan Chennamadhavuni、James S. Panek、Lauren E. Brown、Sandor Vajda、John A. Porco、Mark R. Kelley、Millie M. Georgiadis

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.8b01529

  日期：2019.2.28

  for inhibition of APE1 endonuclease activity. In an iterative process, hot-spot-guided docking, characterization of inhibition of APE1 endonuclease, and cytotoxicity of cancer cells were used to design next generation macrocycles. To assess target selectivity in cells, selected macrocycles were analyzed for modulation of DNA damage. Taken together, our studies suggest that macrocycles represent a promising

  apurinic / apyrimidinic核酸内切酶1（APE1）是必不可少的碱基切除修复酶，在许多癌症中均被上调，有助于对用DNA烷化剂或氧化剂治疗的肿瘤产生抵抗力，并且最近被确定为重要的治疗靶点。在这项工作中，我们通过实验确定了APE1高分辨率晶体结构中小有机分子结合的热点，并通过使用FTMAP分析（http://ftmap.bu.edu/）进行了计算。在这些热点的引导下，停靠了一个类似药物的大环化合物文库，然后筛选了对APE1核酸内切酶活性的抑制作用。在迭代过程中，热点引导对接，APE1核酸内切酶抑制作用的表征以及癌细胞的细胞毒性被用于设计下一代大环化合物。为了评估细胞中的靶标选择性，分析了选定的大环化合物对DNA损伤的调节作用。综上所述，我们的研究表明，大环化合物代表了一种有前途的抑制癌细胞中APE1的化合物。