5,5-difluoro-1,3,7,9-tetramethyl-10-(perfluorophenyl)-5H-4λ⁴,5λ⁴-dipyrrolo[1,2-c:2',1'-f][1,3,2]diazaborinine | 1299467-50-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 5,5-difluoro-1,3,7,9-tetramethyl-10-(perfluorophenyl)-5H-4λ⁴,5λ⁴-dipyrrolo[1,2-c:2',1'-f][1,3,2]diazaborinine
• 英文别名: 4,4-Difluoro-1,3,5,7-tetramethyl-8-pentafluorophenyl-4-bora-3a,4a-diaza-s-indacene；2,2-difluoro-4,6,10,12-tetramethyl-8-(2,3,4,5,6-pentafluorophenyl)-3-aza-1-azonia-2-boranuidatricyclo[7.3.0.03,7]dodeca-1(12),4,6,8,10-pentaene
• CAS: 1299467-50-7
• 化学式: C₁₉H₁₄BF₇N₂
• 分子量: 414.133
• InChiKey: HASRPHGSHCKNTO-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.23
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.21
• 拓扑面积：
  7.9
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5,5-difluoro-1,3,7,9-tetramethyl-10-(perfluorophenyl)-5H-4λ⁴,5λ⁴-dipyrrolo[1,2-c:2',1'-f][1,3,2]diazaborinine 在 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以70 %的产率得到2,6-dibromo-8-pentafluorophenyl-1,3,5,7-tetramethyl-4,4-difluoro-4-bora-3a,4a-diaza-s-indacene
  参考文献：
  名称：

  卤代 3,5-二甲基- 和 1,3,5,7-四甲基-内消旋-五氟苯基 BODIPY 染料的光动力抗菌活性

  摘要：

  研究了四种内消旋五氟苯基 BODIPY 染料对金黄色葡萄球菌的光动力抗微生物化学疗法 (PACT) 活性，以确定与在 BODIPY 核心上引入不同取代基相关的结构-性质关系。合成并表征了在 2,6 位（2a和3a ）具有溴和碘原子的 1,3,5,7-四甲基染料以及在 1,2,6 位被四溴化的 3,5-二甲基染料,7-位 ( 2b ) 或二碘化 ( 3b) 在 2,6-位置。相对于二溴和四溴染料，在 BODIPY 核心的 2,6 位加入碘原子增强了 PACT 活性。用质子取代 1,7-位的甲基形成3b导致比3a的情况更高的 PACT 活性，因为在 1,7-位不存在与甲基相关的空间位阻允许中间芳基环旋转更接近的平面π-BODIPY 核心系统。四溴化染料被发现具有最低的 PACT 活性，因为它在溶液中缺乏稳定性并且被研究的细菌吸收不良。选择吸电子的五氟苯基来降低 BODIPY 核心染料的偶极矩，因为在用硫代甲基苯基制备

  DOI：

  10.1142/s1088424622500535
• 作为产物：
  描述：

  5-pentafluorophenyl-1,3,7,9-tetramethyldipyrromethane 在 四氯苯醌 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 12.5h， 生成 5,5-difluoro-1,3,7,9-tetramethyl-10-(perfluorophenyl)-5H-4λ⁴,5λ⁴-dipyrrolo[1,2-c:2',1'-f][1,3,2]diazaborinine
  参考文献：
  名称：

  Optical limiting properties of D-π-A BODIPY dyes in the presence and absence of methyl groups at the 1,7-positions

  摘要：

  在 1,7 位存在和不存在阻碍介芳基自由旋转的甲基的情况下，研究了三种介五氟苯基苯乙烯-BODIPY 染料的光学限制特性。在中位引入了五氟苯基基团，而在 3-和/或 5-位引入了 4-二乙基氨基苯乙烯基团，从而形成了具有强供体-[式：见正文]-受体（D-[式：见正文]-A）特性的染料，增强了分子的偶极矩。这三种染料都具有良好的光学限制特性，其中 1,7 位没有甲基的单苯乙烯基染料的二阶超极化率值最高。研究发现，1,7-甲基取代染料的 2,6-位溴化会导致二阶超极化率，而二阶超极化率要比计算出的类似非卤化染料的二阶超极化率低一个数量级。

  DOI：

  10.1142/s1088424620500315

文献信息

• Exploring the relationship between structure and activity in BODIPYs designed for antimicrobial phototherapy
  作者：Benjamin F. Hohlfeld、Burkhard Gitter、Keith J. Flanagan、Christopher J. Kingsbury、Nora Kulak、Mathias O. Senge、Arno Wiehe

  DOI：10.1039/d0ob00188k

  日期：——

  A synthetic strategy to BODIPY dyes is presented giving access to a range of new compounds relevant in the context of antimicrobial photodynamic therapy (aPDT). BODIPYs with the 8-(4-fluoro-3-nitrophenyl) and the 8-pentafluorophenyl substituents were used for the synthesis of new mono- and dibrominated BODIPYs. The para-fluorine atoms in these electron-withdrawing groups facilitate functional modification

  提出了BODIPY染料的合成策略，可提供与抗菌光动力疗法（aPDT）相关的一系列新化合物。具有8-（4-氟-3-硝基苯基）和8-五氟苯基取代基的BODIPY用于合成新的单溴和二溴BODIPY。的对位在这些吸电子基团-氟原子促进功能修饰经由亲核芳族取代（S Ñ AR）与一些胺和硫代糖类。随后，已在细菌测定中评估了这些BODIPY的抗细菌光毒性活性，这些细菌对革兰氏阳性菌金黄色葡萄球菌以及革兰氏阴性菌铜绿假单胞菌。细菌测定允许鉴定不仅在磷酸盐缓冲盐水（PBS）中而且在血清存在下均确保抗菌活性的取代模式，从而更现实地模拟临床应用中存在的复杂生物环境。
• [EN] APPLICATION OF BORON DIPYRROMETHENE DERIVATIVES IN ANTI-TUMOR AND ANTI-BACTERIAL THERAPY<br/>[FR] UTILISATION DE DÉRIVÉS DE DIPYRROMÉTHÈNE DE BORE DANS UNE THÉRAPIE ANTITUMORALE ET ANTI-BACTÉRIENNE
  申请人：BIOLITEC UNTERNEHMENSBETEILIGUNGS II AG

  公开号：WO2021089730A1

  公开（公告）日：2021-05-14

  Biologically active compounds and their methods of preparation are provided that may be used as photosensitizers for diagnostic and therapeutic applications, particularly for PDT of cancer, infections and other hyperproliferative diseases, fluorescence diagnosis and PDT treatment of non-tumorous indications such as arthritis, inflammatory diseases, viral or bacterial infections, dermatological, otorhinolaryngology disorders, ophthalmological or urological disorders. As the compounds exhibit also toxicity against targets (tumor cells, bacteria, inflammation-related cells) without light these biologically active compounds may also be used for the light-independent treatment of such indications. Embodiments also include methods to synthesize boron dipyrromethene complex structures incorporating a substituted 2,3,5,6-tetrafluorophenyl-dipyrromethene (2,3,5,6-tetrafluorophenyldipyrrin) unit or a substituted 3-nitrophenyl-dipyrromethene (3-nitrophenyl-dipyrrin) unit. Amphiphilic compounds with increased anti-tumor and anti-bacterial efficacy are also provided. Specifically, this is achieved by substitution with bromine atoms and sugar moieties.

  提供了生物活性化合物及其制备方法，可用作光敏剂，用于诊断和治疗应用，特别是用于癌症、感染和其他高增殖疾病的光动力疗法（PDT），以及用于非肿瘤指示如关节炎、炎症性疾病、病毒或细菌感染、皮肤病、耳鼻喉科疾病、眼科或泌尿系统疾病的荧光诊断和PDT治疗。由于这些化合物对靶标（肿瘤细胞、细菌、与炎症相关的细胞）也表现出毒性，因此这些生物活性化合物也可用于这些指示的光独立治疗。实施例还包括合成硼二吡咯烷基复合结构的方法，其中包括一个取代的2,3,5,6-四氟苯基-二吡咯烷基（2,3,5,6-四氟苯基二吡咯烷）单元或一个取代的3-硝基苯基-二吡咯烷基（3-硝基苯基二吡咯烷）单元。还提供了具有增强抗肿瘤和抗细菌功效的两性化合物。具体来说，通过溴原子和糖基团的取代实现了这一点。
• Synthesis, photodynamic activity, and quantitative structure-activity relationship modelling of a series of BODIPYs
  作者：Enrico Caruso、Marzia Gariboldi、Alessandro Sangion、Paola Gramatica、Stefano Banfi

  DOI：10.1016/j.jphotobiol.2017.01.012

  日期：2017.2

  Here we report the synthesis of eleven new BODIPYs (14–24) characterized by the presence of an aromatic ring on the 8 (meso) position and of iodine atoms on the pyrrolic 2,6 positions. These molecules, together with twelve BODIPYs already reported by us (1 − 12), represent a large panel of BODIPYs showing different atoms or groups as substituent of the aromatic moiety. Two physico-chemical features

  这里，我们报告的11个新BODIPYs（合成14 - 24），其特征在于通过在8（芳香环的存在内消旋）的位置和碘原子对吡咯2,6位。这些分子中，连同已被我们（报道12个BODIPYs 1  -  12），代表BODIPYs表示不同的原子或基团作为芳族结构部分的取代基的一个大的面板。已经研究了两个物理化学特征（1 O 2生成速率和亲脂性），它们在光敏剂的结果中起着至关重要的作用。在体外在SKOV3细胞系中，在黑暗中处理细胞24小时，然后用绿色LED装置（通量25.2 J / cm 2）照射2 h，研究了23种PS的光诱导杀伤功效。用MTT试验评估细胞杀伤功效，并将其与内消旋未取代化合物之一进行比较（13）。为了理解取代基的可能作用，建立了基于理论整体分子描述符的预测定量构效关系（QSAR）回归模型。结果清楚地表明，芳环的存在是优异的光动力学响应的基础，而芳环上的电子效应和取代基的位置不影响光动力学功效。
• Rational design of boron-dipyrromethene (BODIPY) reporter dyes for cucurbit[7]uril
  作者：Mohammad A Alnajjar、Jürgen Bartelmeß、Robert Hein、Pichandi Ashokkumar、Mohamed Nilam、Werner M Nau、Knut Rurack、Andreas Hennig

  DOI：10.3762/bjoc.14.171

  日期：——

  introduce herein boron-dipyrromethene (BODIPY) dyes as a new class of fluorophores for the design of reporter dyes for supramolecular host-guest complex formation with cucurbit[7]uril (CB7). The BODIPYs contain a protonatable aniline nitrogen in the meso-position of the BODIPY chromophore, which was functionalized with known binding motifs for CB7. The unprotonated dyes show low fluorescence due to photoinduced

  我们在此引入硼二吡咯亚甲基（BODIPY）染料作为一类新型荧光团，用于设计与葫芦[7]脲（CB7）形成超分子主客体复合物的报告染料。BODIPY 在 BODIPY 发色团的中间位置含有可质子化的苯胺氮，该氮通过已知的 CB7 结合基序进行功能化。由于光诱导电子转移 (PET)，非质子化染料显示出低荧光，而质子化染料则具有高荧光。将结合基序封装在 CB7 内，将苯胺氮定位在 CB7 的羰基边缘，这会影响 pKa 值，并导致宿主诱导的质子化，从而导致荧光增加。证明了调节结合亲和力和 pKa 值的可能性，并且表明，与 BODIPY 的有益光物理特性相结合，可以实现宿主-染料报告基因对的几种新应用。这包括在可见光谱区具有有利吸收和发射波长的指示剂位移测定、荧光相关光谱以及荧光团的非共价表面功能化。
• Facile functionalization of a fully fluorescent perfluorophenyl BODIPY: photostable thiol and amine conjugates
  作者：Guillaume Vives、Carlo Giansante、Robin Bofinger、Guillaume Raffy、André Del Guerzo、Brice Kauffmann、Pinar Batat、Gediminas Jonusauskas、Nathan D. McClenaghan

  DOI：10.1039/c1cc13778f

  日期：——

  Selective nucleophilic substitution on a perfluorophenyl unit comprising a BODIPY fluorophore using an alkanethiol or a primary amine offers a quantitative fluorophore labelling strategy, while retaining high photostability and emission quantum yields approaching unity.

  在一个包含 BODIPY 荧光团的全氟苯基单元上，采用烷基硫醇或初级胺进行选择性亲核取代，提供了一种定量荧光团标记策略，同时仍能保持高光稳定性和接近单位的发光量子产率。