NRCSQGSCWN | 176952-12-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机聚合物 - 多肽
• 英文名称: NRCSQGSCWN
• 英文别名: H-Asn-arg-cys-ser-gln-gly-ser-cys-trp-asn-oh,(disulfide bond)；(2S)-4-amino-2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[(2S)-5-(diaminomethylideneamino)-2-[[(2S)-2,4-diamino-4-oxobutanoyl]amino]pentanoyl]amino]-3-sulfanylpropanoyl]amino]-3-hydroxypropanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]acetyl]amino]-3-hydroxypropanoyl]amino]-3-sulfanylpropanoyl]amino]-3-(1H-indol-3-yl)propanoyl]amino]-4-oxobutanoic acid
• CAS: 176952-12-8
• 化学式: C₄₄H₆₇N₁₇O₁₆S₂
• 分子量: 1154.25
• InChiKey: KEQZTNKTLNAKCM-XFPWREGGSA-N

物化性质

• 密度：
  1.68±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -11.8
• 重原子数：
  79
• 可旋转键数：
  36
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  577
• 氢给体数：
  21
• 氢受体数：
  20

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  依布硒 、 NRCSQGSCWN 在 溶剂黄146 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  Tandem MS Analysis of Selenamide-Derivatized Peptide Ions

  摘要：

  我们之前的研究表明，硒酰胺试剂如依布硒啉和N-(苯基硒基)邻苯二甲酰亚胺(NPSP)可用于蛋白质/肽硫醇的选择性、快速衍生化，且转化率高。本文报道了硒酰胺衍生肽离子在碰撞诱导解离 (CID) 和电子转移解离 (ETD) 下的 MS/MS 解离行为的系统研究。在正离子模式下，衍生肽离子表现出标签依赖性 CID 解离途径。例如，依布硒啉衍生的肽离子在 CID 上优先经历 Se-S 键裂解，产生特征片段离子，即质子化的依布硒啉 (m/z 276)，它可以选择性识别蛋白质消化物中的硫醇肽，并选择性检测使用前体离子扫描 (PIS) 从蛋白质混合物中提取硫醇蛋白。相比之下，NPSP 衍生的肽离子在 CID 过程中保留其苯基硒基标签，这对于肽测序和定位半胱氨酸残基非常有用。在负离子 CID 模式下，两种类型的标签都会优先通过 Se-S 裂解而丢失，类似于含二硫键的肽阴离子 CID 期间的 S-S 键裂解。考虑到制备硒酰胺衍生肽的便利性以及标签中Se-S与S-S键的相似性，我们还检查了衍生肽离子的ETD，以探讨基于电子的离子解离机制。有趣的是，携带质子或碱金属离子的肽离子容易发​​生 Se-S 键的断裂，而形成 c/z 离子的主链断裂则受到严重抑制。这些结果与为描述基于电子的离子解离过程而提出的犹他-华盛顿机制一致。

  DOI：

  10.1007/s13361-011-0170-4