3'-O-acetyl-5-(3''-trifluoroacetamidopropynyl)-2'-deoxyuridine | 244285-88-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3'-O-acetyl-5-(3''-trifluoroacetamidopropynyl)-2'-deoxyuridine
• 英文别名: 3'-O-Acetyl-5-(3-trifluoroacetamidopropyn-1-yl)-2'-deoxyuridine；[(2R,3S,5R)-5-[2,4-dioxo-5-[3-[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]prop-1-ynyl]pyrimidin-1-yl]-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] acetate
• CAS: 244285-88-9
• 化学式: C₁₆H₁₆F₃N₃O₇
• 分子量: 419.314
• InChiKey: NVABNAYHJKEJMI-QJPTWQEYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.5
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  134
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-O-acetyl-5-(3''-trifluoroacetamidopropynyl)-2'-deoxyuridine 生成 5-(3-氨基-1-丙炔-1-基)-2'-脱氧尿苷5'-(四氢三磷酸酯)
  参考文献：
  名称：

  通过体外选择从包含阳离子核苷酸类似物的文库中获得的腺苷核苷酸受体的定量分析

  摘要：

  受体对 ATP 的亲和力已经收敛；在这两种情况下，受体在选择过程中呈现的 3 mM ATP 浓度下是半饱和的。表型的收敛表明，这个选择实验的结果是由选择发生的环境特征决定的，特别是选择步骤中使用的高负载亲和树脂。此外，表型的收敛表明最佳分子表型已通过选择条件的两种选择实现。需要生物聚合物功能的环境条件与生物聚合物提供该功能的能力之间的这种相互作用与在自然选择期间观察到的非常相似，

  DOI：

  10.1021/ja9816436
• 作为产物：
  描述：

  5-(3''-trifluoroacetamidopropynyl)-5'-O-dimethoxytrityl-2'-deoxyuridine 在 盐酸 、 4-二甲氨基吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 2.55h， 生成 3'-O-acetyl-5-(3''-trifluoroacetamidopropynyl)-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  通过体外选择从包含阳离子核苷酸类似物的文库中获得的腺苷核苷酸受体的定量分析

  摘要：

  受体对 ATP 的亲和力已经收敛；在这两种情况下，受体在选择过程中呈现的 3 mM ATP 浓度下是半饱和的。表型的收敛表明，这个选择实验的结果是由选择发生的环境特征决定的，特别是选择步骤中使用的高负载亲和树脂。此外，表型的收敛表明最佳分子表型已通过选择条件的两种选择实现。需要生物聚合物功能的环境条件与生物聚合物提供该功能的能力之间的这种相互作用与在自然选择期间观察到的非常相似，

  DOI：

  10.1021/ja9816436

文献信息

• Templated molecules and methods for using such molecules
  申请人：Nuevolution A/S

  公开号：US20040049008A1

  公开（公告）日：2004-03-11

  The present invention relates to a method for synthesising templated molecules. In one aspect of the invention, the templated molecules are linked to the template which templated the synthesis thereof. The intion allows the generation of libraries which can be screened for e.g. therapeutic activity.

  本发明涉及一种合成模板分子的方法。在本发明的一个方面中，模板分子与模板连接，从而进行模板合成。该方法可生成图书馆，可对其进行筛选，例如用于治疗活性。
• TEMPLATED MOLECULES AND METHODS FOR USING SUCH MOLECULES
  申请人：Pedersen Henrik

  公开号：US20100016177A1

  公开（公告）日：2010-01-21

  The present invention relates to a method for synthesising templated molecules. In one aspect of the invention, the templated molecules are linked to the template which templated the synthesis thereof. The intion allows the generation of libraries which can be screened for e.g. therapeutic activity.

  本发明涉及一种合成模板分子的方法。在本发明的一个方面中，模板分子与模板相连，该模板模板化了合成它们的过程。该方法允许生成可筛选例如治疗活性的库。
• Method for selecting functional deoxyribonucleotide derivatives
  申请人：——

  公开号：US06627456B1

  公开（公告）日：2003-09-30

  Improvements are disclosed for in vitro selection methods that yield ligands and catalysts through partitioning libraries of oligonucleotides. These improvements all increase the diversity and amount of fuctionality available to the oligonucleotides, by incorporating into the oligonucleotide libraries non-standard nucleobase analogs and/or functionalized standard nucleobases, and/or incorporating into the selection mixture organic cofactors that deliver functional groups by binding non-covalently to oligonucleotides in the library.

  本文披露了改进的体外选择方法，通过对寡核苷酸库进行分区，可以产生配体和催化剂。这些改进都增加了寡核苷酸库中可用的多样性和功能量，通过将非标准核碱基类似物和/或功能化标准核碱基引入寡核苷酸库中，并/或将有机辅因子引入选择混合物中，通过非共价结合到寡核苷酸库中，传递功能基团。
• Redox-Active Metal-Containing Nucleotides:  Synthesis, Tunability, and Enzymatic Incorporation into DNA
  作者：Haim Weizman、Yitzhak Tor

  DOI：10.1021/ja017193q

  日期：2002.2.1

  Novel redox-active DNA labeling tags with tunable electrochemical potentials are modularly synthesized using (a) bis-substituted Ru2+ or Os2+ precursors (R2bpy)2ML2, (b) substituted 2,4-pentanediones or hydroxamic acids bearing a functionalized linker, and (c) modified nucleotides. DNA polymerase efficiently incorporates the metal-containing nucleotide triphosphate into DNA oligonucleotides.
• US5965364A
  申请人：——

  公开号：US5965364A

  公开（公告）日：1999-10-12