3-脱氧-5-甲基尿苷 | 7084-29-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 中文名称: 3-脱氧-5-甲基尿苷
• 中文别名: 3'-脱氧-5-甲基尿苷
• 英文名称: 3'-deoxy-5-methyluridine
• 英文别名: 1-(3-deoxy-β-D-erythropentofuranosyl)-5-methyluracil；3'-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosylthymine；1-(3-deoxy-β-D-ribofuranosyl)thymine；9-(3-deoxy-β-D-ribofuranosyl)thymine；3'-deoxythymidine；thymidine；5-Methyl-3'-deoxyuridine；1-[(2R,3R,5S)-3-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 7084-29-9
• 化学式: C₁₀H₁₄N₂O₅
• 分子量: 242.232
• InChiKey: UYUWZFRYAAHPDN-LKEWCRSYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.452±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.5
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  99.1
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 储存条件：
  存储条件：2-8°C，密封保存，置于干燥处。

制备方法与用途

3'-脱氧-5-甲基尿苷是一种嘌呤核苷类似物，具有广泛的抗肿瘤活性，尤其针对惰性淋巴系统恶性肿瘤。其抗癌机制主要通过抑制DNA合成和诱导细胞凋亡来实现。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-脱氧-5-甲基尿苷 在 咪唑 、 戴斯-马丁氧化剂 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-2'-keto-3'-deoxythymidine
  参考文献：
  名称：

  五氯化磷促进了2'-和3'-脱氧核苷的宝石二氯化。

  摘要：

  规范核苷各个位置的卤素取代产生了许多生物活性结构变体。本文中，提出了两个独特的带有宝石二氯基团的糖修饰的核苷系列的合成。合成计划要求将五氯化磷受控添加到适当保护的2'-或3'-酮脱氧核苷中间体中作为关键步骤，以促进此类功能化分子的快速构建。在相同的反应条件下，形成2'，2'-dichloro-2'，3'-二脱氧核苷的化学选择性最高，而在3'的情况下发生竞争性2'，3'-消除过程，3'-二氯对应物。

  DOI：

  10.3390/molecules23061457
• 作为产物：
  描述：

  O,O-二(三甲基甲硅烷基)胸苷 在 Dowex 1 OH^(1-) form 、 四氯化锡 作用下， 以 甲醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 44.0h， 生成 3-脱氧-5-甲基尿苷
  参考文献：
  名称：

  核苷-O-甲基膦酸酯：修饰寡核苷酸的单体池

  摘要：

  四种天然 2'-脱氧核糖核苷、1-（2-脱氧-β-D-苏式-戊呋喃糖基）胸腺嘧啶、5'-O- 和 2' 的一组独特的 5'-O- 和 3'-O-膦酰基甲基衍生物1-(3-脱氧-β-D-赤型-戊呋喃糖基)胸腺嘧啶和1-(3-脱氧-β-D-苏式-戊呋喃糖基)胸腺嘧啶的-O-膦酰基甲基衍生物已被合成为单体库修饰寡核苷酸的合成。膦酸酯部分用 4-甲氧基-1-氧化-2-吡啶基甲酯基团保护，在偶联步骤中也作为分子内催化剂。

  DOI：

  10.1081/ncn-200033912

文献信息

• Nucleoside derivatives as inhibitors of RNA-dependent RNA viral polymerase
  申请人：——

  公开号：US20020147160A1

  公开（公告）日：2002-10-10

  The present invention provides nucleoside compounds and certain derivatives thereof which are inhibitors of RNA-dependent RNA viral polymerase. These compounds are inhibitors of RNA-dependent RNA viral replication and are useful for the treatment of RNA-dependent RNA viral infection. They are particularly useful as inhibitors of hepatitis C virus (HCV) NS5B polymerase, as inhibitors of HCV replication, and/or for the treatment of hepatitis C infection. The invention also describes pharmaceutical compositions containing such nucleoside compounds alone or in combination with other agents active against RNA-dependent RNA viral infection, in particular HCV infection. Also disclosed are methods of inhibiting RNA-dependent RNA polymerase, inhibiting RNA-dependent RNA viral replication, and/or treating RNA-dependent RNA viral infection with the nucleoside compounds of the present invention.

  本发明提供了核苷化合物及其某些衍生物，这些衍生物是RNA依赖性RNA病毒聚合酶的抑制剂。这些化合物是RNA依赖性RNA病毒复制的抑制剂，可用于治疗RNA依赖性RNA病毒感染。它们特别适用于作为丙型肝炎病毒（HCV）NS5B聚合酶的抑制剂，作为HCV复制的抑制剂，以及/或用于治疗丙型肝炎感染。本发明还描述了包含这种核苷化合物的药物组合物，单独使用或与其他对RNA依赖性RNA病毒感染，特别是HCV感染有效的制剂组合使用。还公开了使用本发明的核苷化合物抑制RNA依赖性RNA聚合酶、抑制RNA依赖性RNA病毒复制和/或治疗RNA依赖性RNA病毒感染的方法。
• Oligonucleotides having modified nucleoside units
  申请人：——

  公开号：US20040014957A1

  公开（公告）日：2004-01-22

  Disclosed are oligonucleotides and oligonucleosides that include one or more modified nucleoside units. The oligonucleotides and oligonucleosides are particularly useful as antisense agents, ribozymes, aptamer, siRNA agents, probes and primers or, when hybridized to an RNA, as a substrate for RNA cleaving enzymes including RNase H and dsRNase.

  披露的是包括一个或多个修饰核苷单元的寡核苷酸和寡核苷糖。这些寡核苷酸和寡核苷糖特别适用于作为反义剂、核酶、适配体、siRNA试剂、探针和引物，或者当它们与RNA杂交时，作为包括RNase H和dsRNase的RNA切割酶的底物。
• Anti-HCV nucleoside derivatives
  申请人：——

  公开号：US20030008841A1

  公开（公告）日：2003-01-09

  The present invention comprises novel and known purine and pyrimidine nucleoside derivatives which have been discovered to be active against hepatitis C virus (HCV). The use of these derivatives for the treatment of HCV infection is claimed as are the novel nucleoside derivatives disclosed herein.

  本发明涉及新颖和已知的嘌呤和嘧啶核苷衍生物，已发现这些衍生物对丙型肝炎病毒（HCV）具有活性。本发明声明利用这些衍生物治疗HCV感染，以及本文所披露的新颖核苷衍生物。
• Modified nucleosides for the treatment of viral infections and abnormal cellular proliferation
  申请人：——

  公开号：US20030087873A1

  公开（公告）日：2003-05-08

  The disclosed invention is a composition for and a method of treating a Flaviviridae (including BVDV and HCV), Orthomyxoviridae (including Influenza A and B) or Paramyxoviridae (including RSV) infection, or conditions related to abnormal cellular proliferation, in a host, including animals, and especially humans, using a nucleoside of general formula (I)-(XXIII) or its pharmaceutically acceptable salt or prodrug. This invention also provides an effective process to quantify the viral load, and in particular BVDV, HCV or West Nile Virus load, in a host, using real-time polymerase chain reaction (“RT-PCR”). Additionally, the invention discloses probe molecules that can fluoresce proportionally to the amount of virus present in a sample.

  该公开的发明涉及一种用于治疗Flaviviridae（包括BVDV和HCV）、Orthomyxoviridae（包括甲型和乙型流感）或Paramyxoviridae（包括RSV）感染或与异常细胞增殖有关的病况的组合物和方法，适用于宿主，包括动物，尤其是人类，使用通用式（I）-（XXIII）的核苷或其药学上可接受的盐或前药。该发明还提供了一种有效的过程，用于量化病毒载量，特别是BVDV、HCV或西尼罗河病毒载量，使用实时聚合酶链反应（RT-PCR）。此外，该发明揭示了可以与样本中存在的病毒数量成比例发光的探针分子。
• The Chemoenzymatic Synthesis of 2-Chloro- and 2-Fluorocordycepins
  作者：Igor Mikhailopulo、Alexandra Denisova、Yulia Tokunova、Ilja Fateev、Alexandra Breslav、Vladimir Leonov、Elena Dorofeeva、Olga Lutonina、Inessa Muzyka、Roman Esipov、Alexey Kayushin、Irina Konstantinova、Anatoly Miroshnikov、Vladimir Stepchenko

  DOI：10.1055/s-0036-1590804

  日期：2017.11

  biocatalyst. An efficient method for 3′-deoxyinosine synthesis starting from inosine was developed. However, the very poor solubility of 2ClAde and 2FAde is the limiting factor of the first approach. The second approach enables this problem to be overcome and it appears to be advantageous over the former approach from the viewpoint of practical synthesis of the title nucleosides. The 3-deoxy-α-d-ribofuranose-1-phosphate

  摘要 两种方法的2-fluorocordycepin和2- chlorocordycepin的酶法合成进行了研究：（i）使用的3'-脱氧腺苷（虫草素）和3'-脱氧肌苷（3'dIno）为3-脱氧供体d -ribofuranose重组大肠杆菌嘌呤核苷磷酸化酶（PNP）催化2-氟-（2F Ade）和2-氯腺嘌呤（2Cl Ade）的糖基转移，以及（ii）使用2-氟腺苷和3'-脱氧肌苷交叉糖基化的底物和PNP作为生物催化剂。开发了一种从肌苷开始合成3'-脱氧肌苷的有效方法。但是，2Cl Ade和2F的溶解度非常差Ade是第一种方法的限制因素。第二种方法能够克服这个问题，并且从实际合成标题核苷的角度来看，它比前一种方法更具优势。发现通过PNP在3'dIno磷酸分解中形成的3-deoxy-α- d-呋喃呋喃糖-1-磷酸中间体分别是大肠杆菌胸苷（TP）和尿苷（UP）磷酸化酶的弱底物和边缘底物。最后，一锅煮级联变换3-脱氧d