利福霉素B | 13929-35-6

• 物质功能分类: 分析化学 - 标准品 - 药典标准品和杂质标准品
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 大环内酰胺类
• 中文名称: 利福霉素B
• 中文别名: 乙酸利福霉素；利福昔明杂质B
• 英文名称: Rifamycin B
• 英文别名: Rif B；O⁴-carboxymethyl-rifamycin；rifamycin-B；rifomycin-B；2-[[(7S,9E,11S,12R,13S,14R,15R,16R,17S,18S,19E,21Z)-13-acetyloxy-2,15,17,29-tetrahydroxy-11-methoxy-3,7,12,14,16,18,22-heptamethyl-6,23-dioxo-8,30-dioxa-24-azatetracyclo[23.3.1.14,7.05,28]triaconta-1(29),2,4,9,19,21,25,27-octaen-27-yl]oxy]acetic acid
• CAS: 13929-35-6
• 化学式: C₃₉H₄₉NO₁₄
• 分子量: 755.816
• InChiKey: SQTCRTQCPJICLD-KTQDUKAHSA-N

物化性质

• 熔点：
  300° (dec 160-164°)
• 比旋光度：
  D20 -11° (methanol)
• 沸点：
  730.16°C (rough estimate)
• 密度：
  1.2421 (rough estimate)
• 溶解度：
  DMSO（微溶）、乙酸乙酯（微溶）、甲醇（微溶、超声处理）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.8
• 重原子数：
  54
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.49
• 拓扑面积：
  228
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  14

安全信息

• 储存条件：
  -20°C，避光，充氩

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  利福霉素B 在 air 作用下， 以80%的产率得到二恶酮利福霉素
  参考文献：
  名称：

  利福霉素结构-活性关系的综合研究：利福霉素O的分子和晶体结构以及光谱和热化学性质的讨论。

  摘要：

  利福霉素对细菌依赖DNA的RNA聚合酶的作用机理已经在四个氧的空间排列基础上进行了解释，四个氧可以与该酶形成氢键。结构描述符来自25种活性和非活性利福霉素的X射线衍射晶体结构。主成分分析用于发现结构参数的组合，从而更好地区分活性和非活性利福霉素。描述了两种可能的分子重排机制，它们可以将非活性构象转化为活性构象。通过分子建模技术研究了构象重排所涉及的能量。发现甲基C34在确定药效基团的几何形状方面起关键作用。利福霉素O，据报道具有活性，该化合物通过利福霉素B的氧化获得，并通过X射线单晶衍射，溶液IR和NMR光谱以及热分析进行研究。出乎意料的是，氧化过程是完全立体定向的，并且基于溶液光谱学证据给出了解释。在固态中发现的构象是非活性化合物的典型特征，分子力学计算表明，将分子重排成活性构象将需要约15 kcal / mol。热分析证实利福霉素O具有空间受限的构象。因此，利福霉素O的抗生素活性很可能

  DOI：

  10.1021/jm970791o
• 作为产物：
  描述：

  利福霉素 在 cytochrome P₄₅₀ enzyme Rif₁₆ 、 ferredoxin reductasese FdR 、 ferredoxin seFdx 、 transketolase Rif₁₅ 、 3-[(4-氨基-2-甲基-5-嘧啶基)甲基]-4-甲基-5-[4,6,6-三羟基-4,6-二氧-3,5-二氧-4,6-二磷(五)己-1-基]噻唑-3-鎓 、 氧气 、 还原型辅酶II(NADPH)四钠盐 、 magnesium chloride 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 利福霉素B
  参考文献：
  名称：

  解读利福霉素生物合成的后期步骤。

  摘要：

  利福霉素衍生的药物，包括利福平，利福布汀，利福喷丁和利福昔明，长期以来一直被用作治疗结核病和其他致命感染的一线疗法。然而，导致工业上重要的利福霉素SV和B的生物合成的后期步骤在很大程度上仍是未知的。在这里，我们表征了利福霉素SV，S，L，O和B生物合成基础的反应网络。发现两个亚基转酮酶Rif15和细胞色素P450酶Rif16分别介导利福霉素中独特的CO键形成L和从利福霉素L到B的非典型P450酯至醚的转化。这两个反应都展示了这两个广为研究的酶家族有趣的化学性质。

  DOI：

  10.1038/s41467-018-04772-x

文献信息

• [EN] ANTI-STAPHYLOCOCCUS AUREUS ANTIBODY RIFAMYCIN CONJUGATES AND USES THEREOF<br/>[FR] CONJUGUÉS D'ANTICORPS ANTI STAPHYLOCOQUE DORÉ ET DE RIFAMYCINE ET UTILISATIONS DE CEUX-CI
  申请人：GENENTECH INC

  公开号：WO2016090038A1

  公开（公告）日：2016-06-09

  The invention provides anti-Staphylococcus aureus antibody rifamycin antibiotic conjugates and methods of using same.

  本发明提供了抗金黄色葡萄球菌抗体利福霉素抗生素偶联物及其使用方法。
• [EN] ANTIFUNGAL COMPOUNDS AND USES THEREOF<br/>[FR] COMPOSÉS ANTI-FONGIQUES ET UTILISATIONS ASSOCIÉES
  申请人：DANA FARBER CANCER INST INC

  公开号：WO2017143230A1

  公开（公告）日：2017-08-24

  Provided herein are compounds (e.g., compounds of Formulae (I), (II), and (III)) which are anti-fungal agents and can be used in the treatment of diseases, including infectious diseases. The invention provides methods of treating diseases in a subject (e.g., infectious diseases such as fungal infections), and methods of killing or inhibiting the growth of fungi in or on a subject or biological sample. The compounds may be used in subjects, in clinical settings, or in agricultural settings.

  本发明提供了化合物（例如，公式(I)、(II)和(III)的化合物），这些化合物是抗真菌剂，可用于治疗包括传染性疾病在内的疾病。本发明还提供了在主体（例如，真菌感染等传染性疾病）中治疗疾病的方法，以及杀死或抑制主体或生物样本内或上的真菌生长的方法。这些化合物可用于主体、临床环境或农业环境。
• [EN] INHIBITORS OF ADENYLATE-FORMING ENZYME MENE<br/>[FR] INHIBITEURS DE L'ENZYME MENE FORMANT L'ADÉNYLATE CYCLASE
  申请人：MEMORIAL SLOAN KETTERING CANCER CENTER

  公开号：WO2020163673A1

  公开（公告）日：2020-08-13

  Provided herein are compounds of Formula (I) and pharmaceutically acceptable salts or tautomers thereof which may inhibit adenylate-forming enzymes. Also provided are pharmaceutical compositions, kits, uses, and methods involving the inventive compounds for the treatment and/or prevention of an infectious disease (e.g., bacterial infection (e.g., tuberculosis, methicillin- resistant Staphylococcus aureus)).

  本文提供了式（I）的化合物及其药用可接受的盐或互变异构体，这些化合物可能抑制腺苷酸形成酶。还提供了涉及这些创新化合物用于治疗和/或预防传染病（例如细菌感染（例如结核病、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌））的药物组合物、试剂盒、用途和方法。
• Rifamycin C-11 oxime derivatives effective against drug-resistant microbes
  申请人：Li Jing

  公开号：US20050203076A1

  公开（公告）日：2005-09-15

  The invention relates to rifamycin derivatives having antimicrobial activities, including activities against drug-resistant microorganisms, specifically, the rifamycin derivatives having an oxime group at the C-11 position.

  该发明涉及具有抗微生物活性的利福霉素衍生物，包括针对耐药微生物的活性，具体来说，具有在C-11位置的肟基的利福霉素衍生物。
• [EN] ANTIBACTERIAL AGENTS: DUAL-TARGETED RNA POLYMERASE INHIBITORS<br/>[FR] AGENTS ANTIBACTÉRIENS: INHIBITEURS D'ARN POLYMÉRASE À DOUBLE CIBLAGE
  申请人：UNIV RUTGERS

  公开号：WO2019226915A1

  公开（公告）日：2019-11-28

  The invention provides bipartite, dual-targeted inhibitors of bacterial RNA polymerase having the general structural formula (I): X-α -Y (I) wherein X is an moiety that binds to the Rif target of a bacterial RNA polymerase; Y is a moiety that binds to the bridge-helix N-terminus target of a bacterial RNA polymerase; and is a covalent bond or a linker. The invention also provides compositions comprising such compounds, methods of making such compounds, and methods of using said compounds. The invention has applications in control of bacterial gene expression, control of bacterial growth, antibacterial chemistry, and antibacterial therapy.

  该发明提供了具有一般结构式（I）的双分子、双靶抑制剂，该结构式为：X-α-Y（I），其中X是结合到细菌RNA聚合酶的Rif靶点的基团；Y是结合到细菌RNA聚合酶的桥螺旋N-末端靶点的基团；和为共价键或连接物。该发明还提供了包含这种化合物的组合物、制备这种化合物的方法以及使用这些化合物的方法。该发明在细菌基因表达控制、细菌生长控制、抗菌化学和抗菌疗法等方面具有应用。